| 目录 | 第1-5页 |
| 中文摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 前言 | 第7-12页 |
| 一. microRNA的生物学功能及研究方向 | 第7-9页 |
| ·microRNA的发现 | 第7页 |
| ·microRNA的生物合成 | 第7页 |
| ·microRNA对靶基因的作用 | 第7-8页 |
| ·生物信息学研究 | 第8-9页 |
| ·miRNA的生物信息学预测 | 第8页 |
| ·miRNA的转录因子预测 | 第8-9页 |
| ·miRNA靶基因的预测 | 第9页 |
| ·miRNA的组织特异性表达及相关分析 | 第9页 |
| 二. 基因本体注释 | 第9-11页 |
| 三. 本研究的主要内容 | 第11-12页 |
| 材料与方法 | 第12-24页 |
| 一. 生物信息学材料 | 第12-15页 |
| ·计算分析的软硬件环境 | 第12页 |
| ·硬件 | 第12页 |
| ·软件 | 第12页 |
| ·生物信息学网站 | 第12-13页 |
| ·miRNA相关数据获取 | 第13-15页 |
| ·人类miRNA数据 | 第13-14页 |
| ·miRNA根据组织表达特异性的分类 | 第14-15页 |
| 二. 生物信息学方法 | 第15-17页 |
| ·miRNA上游转录因子的预测 | 第15页 |
| ·microRNA下游靶基因的预测 | 第15-16页 |
| ·Gene Ontology分析 | 第16页 |
| ·单因素方差分析 | 第16页 |
| ·相关性分析 | 第16-17页 |
| 三. 实验材料 | 第17-18页 |
| ·菌株和质粒 | 第17页 |
| ·细胞系 | 第17页 |
| ·限制性内切酶及其它修饰酶类 | 第17页 |
| ·转染试剂 | 第17页 |
| ·其它主要试剂及试剂盒 | 第17页 |
| ·主要仪器 | 第17-18页 |
| ·实验中所用引物列表 | 第18页 |
| 四. 实验方法 | 第18-24页 |
| ·质粒的构建 | 第19-22页 |
| ·酶切反应 | 第19页 |
| ·DNA片段回收 | 第19-20页 |
| ·连接反应 | 第20页 |
| ·感受态大肠杆菌细胞制备 | 第20页 |
| ·转化 | 第20-21页 |
| ·质粒DNA的小量制备 | 第21页 |
| ·质粒DNA的大量制备 | 第21-22页 |
| ·细胞培养 | 第22页 |
| ·细胞生长条件 | 第22页 |
| ·细胞传代 | 第22页 |
| ·复苏及冻存 | 第22页 |
| ·脂质体转染质粒DNA | 第22-23页 |
| ·双荧光素酶报告系统检测microRNA对基因3’UTR的调控 | 第23-24页 |
| 实验结果 | 第24-56页 |
| 一 miRNA上游转录因子与下游靶基因在Gene Ontology的三个方面存在广泛的正负相关性 | 第24-51页 |
| ·miRNA转录因子与靶基因参与生物学过程的相关性 | 第27-34页 |
| ·数据正态性检验 | 第27页 |
| ·相关分析 | 第27-34页 |
| ·miRNA转录因子与靶基因行使分子功能的相关性 | 第34-42页 |
| ·数据正态性检验 | 第34页 |
| ·相关分析 | 第34-42页 |
| ·miRNA转录因子与靶基因在细胞成分上的相关性 | 第42-50页 |
| ·数据正态性检验 | 第42页 |
| ·相关分析 | 第42-50页 |
| ·结果小结 | 第50-51页 |
| 二. 组织特异性miRNA的靶基因GO分析 | 第51-54页 |
| ·结果小结 | 第53-54页 |
| 三. 生物信息学预测和实验结果证明MIR-122有部分代谢相关的直接靶基因和线粒体相关间接靶基因 | 第54-56页 |
| 讨论 | 第56-64页 |
| 一. miRNA转录因子之间和靶基因之间可能存在协同或拮抗关系 | 第56-58页 |
| 二. miR-122代谢相关靶基因的GO分析验证了它们之间存在正负相关性 | 第58-60页 |
| 三. microRNA的转录因子和下游靶基因间存在相关性的意义 | 第60-61页 |
| 四. 不同组织特异性表达的miRNA,靶基因功能等方面也存在差异 | 第61-62页 |
| 五. 本课题研究的不足与展望 | 第62-64页 |
| 小结 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-67页 |
| 文献综述 | 第67-74页 |
| 参考文献 | 第71-74页 |
| 英文名词及缩写 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 个人简历 | 第76-77页 |
