| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 第1章 引言 | 第7-18页 |
| 1.1 概述 | 第7-8页 |
| 1.2 淡水蚌类的多样性和分布 | 第8-11页 |
| 1.3 线粒体的研究概况 | 第11-13页 |
| 1.3.1 动物线粒体基因组的特点 | 第11页 |
| 1.3.2 线粒体基因重排和系统发育关系 | 第11-12页 |
| 1.3.3 双壳类线粒体的双单亲遗传现象 | 第12-13页 |
| 1.4 系统发生关系与系统发育树 | 第13-14页 |
| 1.5 丽蚌属的种类和分布 | 第14-17页 |
| 1.6 本研究的目的及意义 | 第17-18页 |
| 第2章 材料与方法 | 第18-29页 |
| 2.1 样品的采集 | 第18-19页 |
| 2.2 样本鉴定与处理 | 第19页 |
| 2.2.1 样本鉴定 | 第19页 |
| 2.3 本实验所用主要试剂以及仪器 | 第19-20页 |
| 2.3.1 实验主要试剂 | 第19页 |
| 2.3.2 实验主要仪器 | 第19-20页 |
| 2.4 方法 | 第20-22页 |
| 2.4.1 性别鉴定与取样 | 第20页 |
| 2.4.2 总DNA的提取与保存 | 第20-21页 |
| 2.4.3 线粒体基因短片段的PCR反应 | 第21页 |
| 2.4.4 长片段引物设计和LA-PCR反应 | 第21-22页 |
| 2.5 数据处理 | 第22-29页 |
| 2.5.1 序列拼接与线粒体基因组注释 | 第22页 |
| 2.5.2 线粒体基因组结构分析 | 第22-23页 |
| 2.5.3 丽蚌属线粒体基因组的系统发育学分析 | 第23-26页 |
| 2.5.4 基于分子标记ND1和16SrRNA丽蚌属系统发育分析 | 第26-29页 |
| 第3章 丽蚌属线粒体的基因组特征 | 第29-49页 |
| 3.1 线粒体基因组结构 | 第29-37页 |
| 3.2 背瘤丽蚌父系与母系线粒体基因组比较 | 第37-38页 |
| 3.3 转运RNA与核糖体RNA基因 | 第38-40页 |
| 3.4 蛋白编码基因特征 | 第40-44页 |
| 3.4.1 蛋白编码基因序列比较 | 第43-44页 |
| 3.5 非编码区和控制区 | 第44-45页 |
| 3.6 线粒体基因排列模式 | 第45-49页 |
| 第4章 丽蚌属的系统发育分析 | 第49-69页 |
| 4.1 基于12个蛋白质编码基因的系统发育树 | 第49-56页 |
| 4.2 基于线粒体基因组全序列的系统发育分析 | 第56-59页 |
| 4.3 基于分子标记COX1、16s和ND1的丽蚌属的系统发育及物种鉴定 | 第59-69页 |
| 4.3.1 基于ND1序列的丽蚌属系统发育 | 第59-61页 |
| 4.3.2 基于16SrRNA与ND1基因联合数据集的丽蚌属系统发育研究 | 第61-64页 |
| 4.3.3 基于COX1、16SrRNA和ND1对洞穴丽蚌的分析 | 第64-69页 |
| 第5章 结论和展望 | 第69-70页 |
| 5.1 主要结论 | 第69页 |
| 5.2 展望 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-76页 |
| 附录 | 第76-81页 |
| 攻读硕士学位期间研究成果 | 第81页 |
