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K27链接二泛素及其识别蛋白UCHL3的结构生物学研究

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-24页
    1.1 泛素密码第13-17页
        1.1.1 蛋白质泛素化第13页
        1.1.2 泛素链类型及功能第13-17页
    1.2 去泛素化酶第17-20页
        1.2.1 去泛素化酶种类第17-18页
        1.2.2 去泛素化酶功能第18-20页
    1.3 去泛素化酶UCHL第20-22页
        1.3.1 UCHL3 蛋白功能第20-21页
        1.3.2 UCHL3 蛋白翻译后调控机制第21-22页
        1.3.3 UCHL3与K27 链接类型泛素链第22页
    1.4 本课题的研究内容与意义第22-24页
第二章 实验材料与方法第24-31页
    2.1 实验材料第24-27页
        2.1.1 实验仪器第24-25页
        2.1.2 实验试剂第25-27页
    2.2 实验方法第27-31页
        2.2.1 分子克隆第27-28页
        2.2.2 蛋白质表达与纯化第28-29页
        2.2.3 K27 链接类型二泛素的合成第29页
        2.2.4 蛋白复合物的组装第29页
        2.2.5 晶体生长与优化第29页
        2.2.6 晶体数据收集第29页
        2.2.7 晶体结构解析第29-30页
        2.2.8 晶体结构分析第30页
        2.2.9 蛋白相互作用检测第30页
        2.2.10 Ub-AMC 单泛素切割实验第30页
        2.2.11 泛素链切割实验第30页
        2.2.12 序列比对以及系统发育树的构建第30-31页
第三章 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物结构解析第31-38页
    3.1 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物获取第31-33页
        3.1.1 UCHL3 蛋白获取第31-32页
        3.1.2 UCHL3 与泛素链相互作用力检测第32-33页
        3.1.3 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物获取第33页
    3.2 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物结构解析第33-37页
        3.2.1 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物晶体获取第33-35页
        3.2.2 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物数据收集与结构解析第35-37页
    3.3 总结第37-38页
第四章 K27 链接类型二泛素被UCHL3 识别机制分析第38-49页
    4.1 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物结构分析第38-40页
        4.1.1 泛素结合位点S第38-39页
        4.1.2 泛素结合位点S第39-40页
    4.2 K27 链接类型二泛素与UCHL3 复合物结构验证第40-46页
        4.2.1 点突变设计与蛋白获取第40-44页
        4.2.2 相互作用力验证第44-46页
    4.3 结构比对与分析第46-48页
    4.4 总结与讨论第48-49页
第五章 磷酸化UCHL3 体外生化研究第49-56页
    5.1 磷酸化UCHL3 蛋白获取第49-51页
    5.2 磷酸化UCHL3 体外活性检测第51-53页
    5.3 UCHL3 序列比对与系统进化树构建第53-54页
    5.4 总结与讨论第54-56页
第六章 全文结论第56-57页
    主要结论第56页
    展望第56-57页
参考文献第57-63页
附录第63-65页
致谢第65-66页
作者简历第66页

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