| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 叶绿体的起源及进化 | 第10页 |
| 1.2 叶绿体的发育 | 第10-13页 |
| 1.2.1 叶绿体的装备 | 第10-11页 |
| 1.2.2 叶绿体在发育过程中与细胞核的双向调控及其研究现状 | 第11-13页 |
| 1.2.2.1 核对叶绿体基因的调控 | 第11-12页 |
| 1.2.2.2 叶绿体对核基因的反馈调控 | 第12-13页 |
| 1.3 裸藻作为模式生物研究叶绿体发育及其与细胞核间分子通讯机制的相关生物学特性 | 第13-14页 |
| 1.4 裸藻光响应相关的研究进展 | 第14-17页 |
| 1.4.1 裸藻叶绿体发育的光响应 | 第14-16页 |
| 1.4.2 裸藻细胞线粒体代谢供能的光响应 | 第16页 |
| 1.4.3 裸藻细胞质总酶合成的光响应 | 第16-17页 |
| 1.5 相关组学技术发展近况及在裸藻上的应用 | 第17-18页 |
| 1.5.1 转录组学技术简介及其在裸藻上的应用 | 第17-18页 |
| 1.5.2 代谢组学技术简介及其在裸藻上的应用 | 第18页 |
| 1.6 纤细裸藻(Euglenagracilis)遗传转化研究进展 | 第18-20页 |
| 1.7 本研究内容及意义 | 第20-21页 |
| 第2章 三株裸藻的转录组分析 | 第21-40页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 实验藻株 | 第21页 |
| 2.1.2 常用培养基及其配制 | 第21-22页 |
| 2.1.3 仪器及试剂 | 第22-23页 |
| 2.2 实验设计 | 第23-24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-26页 |
| 2.3.1 生长曲线的绘制 | 第24页 |
| 2.3.2 TotalRNA的提取及样品检测 | 第24-25页 |
| 2.3.3 RNA-Seq建库测序 | 第25页 |
| 2.3.4 测序数据处理及分析 | 第25-26页 |
| 2.3.4.1 原始测序数据的处理及组装 | 第25页 |
| 2.3.4.3 差异表达基因分析 | 第25-26页 |
| 2.3.4.2 基因功能注释和分类 | 第26页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第26-37页 |
| 2.4.1 三株裸藻在黑暗条件下的生长情况 | 第26-27页 |
| 2.4.2 高通量测序和组装 | 第27-28页 |
| 2.4.3 差异表达基因注释及功能分类 | 第28-34页 |
| 2.4.3.1 差异表达基因结果分析 | 第28-29页 |
| 2.4.3.2 部分差异基因GO注释及功能分类 | 第29页 |
| 2.4.3.3 差异基因KEGG富集 | 第29-34页 |
| 2.4.4 与质体及光合作用相关的差异基因情况 | 第34-37页 |
| 2.5 讨论与小结 | 第37-40页 |
| 第3章 绿色野生型裸藻及其突变株的代谢组学分析 | 第40-48页 |
| 3.1 实验材料 | 第40页 |
| 3.1.1 实验藻株及培养基 | 第40页 |
| 3.1.2 仪器及试剂 | 第40页 |
| 3.2 实验设计 | 第40-41页 |
| 3.3 实验方法 | 第41-42页 |
| 3.3.1 代谢组的提取及衍生化 | 第41页 |
| 3.3.2 代谢组的检测 | 第41-42页 |
| 3.3.3 代谢组数据的预处理 | 第42页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第42-47页 |
| 3.4.1 主成分分析 | 第42-44页 |
| 3.4.2 聚类分析 | 第44-47页 |
| 3.5 讨论与小结 | 第47-48页 |
| 第4章 纤细裸藻的遗传转化体系的建立 | 第48-57页 |
| 4.1 实验材料 | 第48-49页 |
| 4.1.1 实验藻株及培养条件 | 第48页 |
| 4.1.2 仪器及试剂 | 第48-49页 |
| 4.2 实验方法及步骤 | 第49-52页 |
| 4.2.1 抗生素敏感性检验 | 第49页 |
| 4.2.2 转化载体的构建 | 第49-50页 |
| 4.2.3 E. gracilis转化 | 第50-51页 |
| 4.2.3.1 珠磨法操作步骤 | 第50页 |
| 4.2.3.2 基因枪操作步骤 | 第50-51页 |
| 4.2.3.3 电转化操作步骤 | 第51页 |
| 4.2.4 裸藻转化子的检验 | 第51-52页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第52-55页 |
| 4.3.1 裸藻的抗生素敏感性检测 | 第52-53页 |
| 4.3.2 裸藻转化载体 | 第53-54页 |
| 4.3.3 裸藻的转化子检验 | 第54-55页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第55-57页 |
| 第5章 全文总结与展望 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-67页 |
| 附录 | 第67-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 攻读硕士学位期间的成果 | 第88页 |
