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利用基因芯片技术筛选奶牛外周血热应激相关基因

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-7页
目录第7-10页
第一章 文献综述第10-20页
   ·热应激对奶牛生产的影响第11-12页
     ·对奶牛繁殖性能的影响第11页
     ·对奶牛免疫性能的影响第11页
     ·对产奶量及乳品质的影响第11-12页
   ·热应激相关分子机制的研究进展第12-15页
     ·热休克蛋白第12-14页
     ·热应激诱导的非热休克蛋白第14页
     ·奶牛热应激分子标记研究进展第14-15页
   ·热应激相关蛋白在细胞凋亡中的作用第15-19页
     ·热应激相关蛋白对线粒体凋亡路径的调控第15-18页
     ·热应激相关蛋白对膜受体凋亡路径的调控第18-19页
   ·研究目的及意义第19-20页
第二章 材料与方法第20-28页
   ·试验材料第20-21页
     ·试验材料及采样方法第20页
     ·主要仪器设备第20-21页
     ·主要试剂第21页
   ·全血RNA提取及反转录第21-24页
     ·RNA提取所用试剂第21-22页
     ·奶牛外周血总RNA提取和检测第22页
     ·总RNA的纯化第22-23页
     ·cDNA第一链的合成第23页
     ·cDNA第一链检测第23-24页
   ·DNA克隆及测序第24-28页
     ·菌株和载体第24页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备第24-25页
     ·碱裂解法小量制备质粒第25-26页
     ·目的片段回收及连接转化第26-27页
     ·重组质粒的快速筛选第27页
     ·序列测定第27-28页
第三章 牛全基因组表达谱芯片检测与数据分析第28-39页
   ·材料与方法第28-32页
     ·试验动物与采样方法第28页
     ·样品处理第28页
     ·总RNA的提取与纯化第28-29页
     ·Poly(A)+mRNA的提取第29页
     ·制备Poly-A RNA Control第29页
     ·第一链cDNA合成第29页
     ·第二链cDNA合成第29-30页
     ·双链DNA纯化第30页
     ·生物素标记的cRNA合成第30页
     ·芯片杂交第30-31页
     ·芯片的洗脱、染色和扫描第31页
     ·数据预处理第31页
     ·差异基因筛选第31-32页
     ·差异基因生物信息学分析第32页
   ·结果与分析第32-35页
     ·散点图第32-33页
     ·基因的杂交结果第33-34页
     ·差异表达基因的聚类分析第34-35页
   ·讨论第35-39页
     ·基因芯片的选择第35-36页
     ·试验设计第36页
     ·试验数据分析第36-37页
     ·主要差异表达基因的功能第37-39页
第四章 奶牛CCL3的基因克隆与序列分析第39-59页
   ·材料与方法第39-43页
     ·试验材料与采样方法第39页
     ·奶牛外周血总RNA的提取第39-40页
     ·RNA的反转录第40页
     ·用于奶牛CCL3基因克隆的引物设计第40-41页
     ·CCL3基因cDNA末端的快速扩增第41-42页
     ·目的片段的纯化、克隆和鉴定第42页
     ·CCL3全长序列拼接和Spidey分析第42页
     ·荷斯坦奶牛、荷斯坦杂交牛CCL3基因与标准序列的多重比对第42页
     ·奶牛CCL3蛋白的多重比对功能的生物信息学分析第42-43页
   ·结果与分析第43-55页
     ·CCL3 mRNA序列克隆第43-44页
     ·CCL3序列拼接及ORF分析第44-45页
     ·奶牛CCL3基因的Spidey分析第45页
     ·荷斯坦奶牛、荷斯坦杂交牛CCL3基因与标准序列的多重比对结果第45-47页
     ·奶牛CCL3蛋白序列与初级结构分析第47-50页
     ·奶牛CCL3蛋白功能分析第50-55页
   ·讨论第55-59页
     ·CCL3的基因克隆与分析第55-56页
     ·奶牛CCL3蛋白分析讨论第56-58页
     ·CCL3的免疫调控第58-59页
第五章 全文结论第59-60页
参考文献第60-66页
附录 A 基因芯片差异表达基因功能聚类第66-73页
附录 B 奶牛CCL3蛋白序列与chemokine CC的比对第73-75页
攻读学位期间取得的研究成果第75-76页
致谢第76-77页

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