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华南及邻近地区不同群体大刺鳅的遗传多样性及亲缘地理研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第12-27页
    1.1 大刺鳅研究概况第12-17页
        1.1.1 大刺鳅的形态特征第12-13页
        1.1.2 生理生化第13-14页
        1.1.3 繁殖第14-15页
        1.1.4 养殖技术第15页
        1.1.5 疾病防治第15-16页
        1.1.6 遗传多样性及亲缘地理第16-17页
        1.1.7 分类地位第17页
    1.2 鱼类亲缘地理学研究概况第17-18页
    1.3 DNA序列分子标记的应用第18-23页
        1.3.1 线粒体(Mitochondrial DNA,mtDNA)第18-19页
        1.3.2 核糖体(Ribosome)第19-20页
        1.3.3 外显子标记第20-21页
        1.3.4 内含子标记第21-23页
    1.4 DNA序列分子标记应用策略第23-25页
    1.5 研究的目的和意义第25-27页
第二章 基于线粒体COI对大刺鳅不同野生群体遗传多样性及亲缘地理研究第27-46页
    2.1 实验材料第27-29页
        2.1.1 样品的采集第27-28页
        2.1.2 实验仪器与试剂第28-29页
    2.2 实验方法第29页
        2.2.1 基因组DNA提取第29页
        2.2.2 PCR扩增与电泳第29页
    2.3 数据处理第29-30页
    2.4 结果第30-42页
        2.4.1 序列分析第30-31页
        2.4.2 单倍型分析第31-33页
        2.4.3 遗传多样性第33页
        2.4.4 遗传距离第33-35页
        2.4.5 遗传分化与基因流第35-38页
        2.4.6 种群动态第38-39页
        2.4.7 系统发育分析第39-41页
        2.4.8 分子方差分析第41-42页
    2.5 讨论第42-46页
        2.5.1 遗传多样性第42-43页
        2.5.2 遗传结构第43-44页
        2.5.3 亲缘地理第44-46页
第三章 EPICs引物的开发和核基因对大刺鳅不同野生群体遗传多样性和亲缘地理研究第46-68页
    3.1 实验材料第46-47页
    3.2 实验方法第47-48页
        3.2.1 引物开发的实验方法第47页
        3.2.2 遗传多样性和亲缘地理研究实验方法第47-48页
    3.3 数据分析第48-49页
    3.4 结果第49-62页
        3.4.1 引物筛选第49页
        3.4.2 遗传多样性第49-53页
        3.4.3 遗传距离第53页
        3.4.4 遗传分化与基因流第53-56页
        3.4.5 单倍型分析第56-57页
        3.4.6 等位基因空间分布分析第57-58页
        3.4.7 相关性检验第58页
        3.4.8 聚类分析第58-61页
        3.4.9 环境因子的相关性分析第61-62页
    3.5 讨论第62-68页
        3.5.1 EPICs引物开发第62-63页
        3.5.2 遗传多样性第63-65页
        3.5.3 遗传结构第65页
        3.5.4 亲缘地理第65-66页
        3.5.5 资源保护建议第66-68页
第四章 亚洲刺鳅属系统发育关系探讨第68-74页
    4.1 材料和方法第68-69页
        4.1.1 实验材料第68-69页
        4.1.2 实验方法第69页
    4.2 数据分析第69-72页
    4.3 结果与分析第72页
        4.3.1 EPICs引物在近缘种中的通用性分析第72页
        4.3.2 亚洲刺鳅属系统发育关系第72页
    4.4 讨论第72-74页
第五章 总结与展望第74-77页
    5.1 总结第74页
    5.2 本研究的创新之处第74-75页
    5.3 本研究的不足之处第75页
    5.4 展望第75-77页
参考文献第77-89页
攻读硕士期间发表的论文第89-90页
致谢第90页

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