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热胁迫下菜心转录组分析与SSR分子标记开发

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第12-24页
    1.1 植物耐热性的研究进展第12-19页
        1.1.1 热胁迫对植物生长和形态结构的影响第12-13页
        1.1.2 热胁迫对植物生理生化特性的影响第13-17页
        1.1.3 热胁迫与基因调控第17-19页
    1.2 菜心耐热性的研究进展第19-21页
        1.2.1 热胁迫对菜心农艺性状的影响第19-20页
        1.2.2 热胁迫对菜心生理特性的影响第20页
        1.2.3 菜心耐热相关基因的研究第20-21页
    1.3 转录组测序技术在植物中的应用第21-22页
        1.3.1 转录组测序在植物抗逆性研究中的应用第21页
        1.3.2 转录组测序在植物分子标记开发中的应用第21-22页
    1.4 本研究的目的意义及内容第22-24页
        1.4.1 目的意义第22-23页
        1.4.2 研究内容第23-24页
第二章 菜心转录组测序及分析第24-35页
    2.1 材料与方法第24-28页
        2.1.1 材料第24页
        2.1.2 方法第24-28页
    2.2 结果第28-34页
        2.2.1 测序数据统计、组装序列结果及评价第28-30页
        2.2.2 ORF预测结果第30-31页
        2.2.3 Unigenes的功能注释第31-34页
    2.3 讨论第34-35页
第三章 差异表达基因的筛选与分析第35-57页
    3.1 材料与方法第35-38页
        3.1.1 材料第35页
        3.1.2 方法第35-38页
    3.2 结果第38-48页
        3.2.1 四份菜心材料热胁迫下差异表达基因分析第38-40页
        3.2.2 RNA-seq分析结果的qRT-PCR验证第40-41页
        3.2.3 热胁迫响应差异表达基因的Uniprot功能注释第41-44页
        3.2.4 热胁迫响应差异表达基因的GO功能分类第44-46页
        3.2.5 热胁迫响应差异表达基因的KEGG通路富集第46-48页
    3.3 讨论第48-57页
        3.3.1 四份菜心材料在高温胁迫下的转录水平表达分析第48-49页
        3.3.2 差异表达基因注释结果分析第49-50页
        3.3.3 菜心的热胁迫响应机制第50-55页
        3.3.4 菜心耐热性分子机理的推测第55-57页
第四章 利用转录组序列信息开发菜心EST-SSR标记第57-72页
    4.1 材料与方法第57-60页
        4.1.1 材料第57-59页
        4.1.2 方法第59-60页
    4.2 结果第60-69页
        4.2.1 菜心EST-SSR位点的频率和分布第60-61页
        4.2.2 菜心EST-SSR位点的验证及多态性筛选第61-62页
        4.2.3 多态性EST-SSR的应用第62-69页
    4.3 讨论第69-72页
        4.3.1 菜心转录组中的EST-SSR位点第69页
        4.3.2 菜心EST-SSR位点的验证第69-70页
        4.3.3 菜心材料的遗传多样性第70-72页
第五章 总结与展望第72-75页
    5.1 总结第72-73页
        5.1.1 菜心材料转录组测序及分析第72页
        5.1.2 差异表达基因分析第72页
        5.1.3 菜心热胁迫响应机制第72-73页
        5.1.4 EST-SSR的开发与应用第73页
    5.2 展望第73-75页
参考文献第75-94页
硕士期间的科研成果第94-95页
致谢第95页

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