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小麦抽穗期全基因组关联分析及调控基因的鉴定与功能研究

致谢第4-9页
摘要第9-11页
第一章 文献综述第11-21页
    1 小麦抽穗期相关基因的研究进展第11-15页
        1.1 春化基因的研究进展第11-14页
            1.1.1 已鉴定的春化基因第11-12页
            1.1.2 已发掘的春化等位基因第12-13页
            1.1.3 春化基因与小麦冬春性的关系第13页
            1.1.4 春化基因间的互作第13-14页
        1.2 光周期基因的研究进展第14-15页
        1.3 早熟基因(EPS)的研究进展第15页
    2 其它植物中抽穗开花相关研究进展第15-16页
        2.1 拟南芥开花时间的研究进展第15-16页
        2.2 水稻抽穗期的研究进展第16页
    3 小麦抽穗期和开花期的调控途径第16-18页
    4 全基因组关联分析第18-19页
    5 本研究目的和意义第19-21页
第二章 小麦抽穗期全基因组关联分析第21-31页
    1 材料与方法第21-22页
        1.1 试验材料第21页
        1.2 试验方法第21-22页
            1.2.1 田间试验设计及农艺性状调查第21-22页
            1.2.2 GWAS分析软件第22页
            1.2.3 统计分析第22页
    2 结果与分析第22-29页
        2.1 抽穗期和开花期的表型分析第22-23页
        2.2 群体结构分析第23页
        2.3 抽穗期和开花期全基因组关联分析第23-27页
        2.4 候选SNP位点功能预测第27页
        2.5 显著SNP位点对抽穗期和开花期的影响第27-29页
    3 讨论第29-31页
        3.1 抽穗期相关的SNP位点第29页
        3.2 SNP位点的功能预测第29页
        3.3 黄淮麦区适宜偏早熟小麦品种第29-30页
        3.4 GWAS分析的影响因素第30-31页
第三章 中国普通小麦中抽穗期基因的分子鉴定第31-51页
    1 材料与方法第31-35页
        1.1 试验材料第31页
        1.2 试验方法第31-35页
            1.2.1 田间试验设计及农艺性状调查第31页
            1.2.2 DNA的提取第31页
            1.2.3 PCR扩增体系与程序第31-32页
            1.2.4 引物设计第32-34页
            1.2.5 荧光定量分析第34-35页
            1.2.6 QTL定位第35页
            1.2.7 统计分析第35页
    2 结果与分析第35-47页
        2.1 Vrn-D1位点新等位基因的发掘及功能分析第35-38页
        2.2 春化和光周期基因在中国小麦中的分布第38-41页
        2.3 Vrn-A1基因拷贝数变异分析第41页
        2.4 光周期基因分子标记的开发第41-42页
        2.5 抽穗期影响因素分析及预测模型的建立第42-46页
        2.6 Ppd-D1基因功能分析第46-47页
    3 讨论第47-51页
        3.1 Vrn-D1c对抽穗期和开花期的影响第47页
        3.2 拷贝数变异对小麦抽穗期和开花期的影响第47-48页
        3.3 春化和光周期基因对抽穗期和开花期的影响第48-49页
        3.4 Ppd-D1基因对小麦其它农艺性状的影响第49页
        3.5 抽穗期和开花期影响因素模型的建立第49-50页
        3.6 优异种质资源的利用第50-51页
第四章 春化基因Vrn3新等位基因的克隆与功能研究第51-67页
    1 材料与方法第51-56页
        1.1 试验材料第51-52页
            1.1.1 植物材料第51页
            1.1.2 实验所用菌株和载体第51页
            1.1.3 实验酶类第51页
            1.1.4 培养基配方第51-52页
        1.2 试验方法第52-56页
            1.2.1 田间试验设计及农艺性状调查第52页
            1.2.2 QTL定位第52页
            1.2.3 基因克隆第52-53页
            1.2.4 遗传转化与功能互补实验第53-56页
    2 结果与分析第56-65页
        2.1 UP群体抽穗期和开花期的表型分布第56页
        2.2 UP群体抽穗期和开花期的QTL定位第56-58页
        2.3 UP群体转录组分析第58-59页
        2.4 Vrn-D3基因克隆第59页
        2.5 Vrn-D3基因效应分析第59-60页
        2.6 Vrn-D3蛋白亚细胞定位第60页
        2.7 Vrn-D3基因转拟南芥功能验证第60-62页
            2.7.1 表达载体的构建第60-61页
            2.7.2 转基因拟南芥的功能分析第61-62页
        2.8 Vrn-D3基因转小麦功能验证第62-65页
            2.8.1 阳性转基因植株的鉴定第62页
            2.8.2 转基因植株表型分析第62-65页
    3 讨论第65-67页
        3.1 RIL群体中抽穗期和开花期的QTL定位第65页
        3.2 Vrn-D3基因的功能研究第65-67页
第五章 结论第67-69页
参考文献第69-80页
附表第80-101页
Abstract第101-104页
作者简历第105页

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