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应用下一代测序技术检测分析鼻咽癌易感性相关单核苷酸多态性

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
前言第10-13页
第一章 鼻咽癌易感性相关单核苷酸多态性筛查第13-17页
    1 材料与方法第13-14页
        1.1 检索策略第13页
        1.2 纳入标准第13-14页
        1.3 数据提取第14页
        1.4 数据分析第14页
    2 结果第14-16页
        2.1 纳入文献情况第14页
        2.2 多态位点与鼻咽癌易感性的关系第14-16页
    3 讨论第16-17页
第二章 P53 及GSTM1 基因多态性与东亚人群鼻咽癌易感性的Meta分析第17-25页
    1 材料与方法第17-19页
        1.1 检索策略第17-18页
        1.2 纳入与排除标准第18页
        1.3 数据提取第18页
        1.4 纳入文献质量评价第18页
        1.5 数据分析第18-19页
    2 结果第19-22页
        2.1 纳入研究的基本特征第19页
        2.2 P53 基因多态性与NPC易感性的关联第19-22页
        2.3 GSTM1 基因多态性与NPC易感性的关联第22页
        2.4 敏感性分析及发表偏倚评价第22页
    3 讨论第22-25页
第三章 应用下一代测序技术研究15个SNP与鼻咽癌易感性的关系第25-50页
    1 实验材料与主要仪器第28-33页
        1.1 主要试剂及耗材第30页
        1.2 主要仪器第30页
        1.3 SNP位点编号信息第30-31页
        1.4 引物信息第31-33页
    2 实验方法第33-41页
        2.1 外周静脉血DNA提取及质检第33-35页
            2.1.1 基因组提取第33页
            2.1.2 DNA浓度测定第33-34页
            2.1.3 DNA质检第34-35页
        2.2 样本前处理第35-38页
            2.2.1 目的片段扩增第35页
            2.2.2 获取大量目的片段第35-36页
            2.2.3 目的片段质检第36-37页
            2.2.4 目的片段连接带标签磁珠第37-38页
            2.2.5 连接目的片段的磁珠(Beads)回收混合第38页
        2.3 高通量测序第38-41页
            2.3.1 点样前准备第38页
            2.3.2 点样第38页
            2.3.3 启动测序仪第38-39页
            2.3.4 组装反应小室第39页
            2.3.5 反应小室安装第39页
            2.3.6 配制反应试剂第39-40页
            2.3.7 试剂参数设置第40页
            2.3.8 开始测序第40页
            2.3.9 测序结束关机第40-41页
            2.3.10 测序结果分析及统计学分析第41页
    3 实验结果第41-48页
        3.1 样本特征第41页
        3.2 基因质检结果第41-42页
        3.3 高通量仪自动识别处理分析结果第42页
        3.4 15 个SNP各基因型分布情况第42-45页
        3.5 各SNP正常组HWE分析第45-46页
        3.6 各SNP与NPC易感性关联的统计学分析第46-48页
    4 讨论第48-50页
全文小结第50-52页
参考文献第52-58页
附录第58-62页
    1 缩略语第58-59页
    2 调查表及知情同意书第59-62页
已发表综述第62-69页
攻读学位期间发表论文第69-70页
致谢第70页

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