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Caldicellulosiruptor bescii来源的多结构域糖苷水解酶CbXyn10C/Ce148B的催化机制的研究

内容摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 前言第9-25页
    1.1 引言第9页
    1.2 植物细胞壁组成第9-11页
        1.2.1 植物细胞壁化学成分第9-10页
        1.2.2 木聚糖结构第10-11页
        1.2.3 纤维素结构第11页
    1.3 糖苷水解酶概述第11-14页
        1.3.1 糖苷水解酶分类第11-12页
        1.3.2 糖苷水解酶催化机制第12-13页
        1.3.3 糖苷水解酶应用第13-14页
    1.4 纤维素酶、木聚糖酶研究概述第14-19页
        1.4.1 纤维素酶分类第14-15页
        1.4.2 木聚糖酶分类第15页
        1.4.3 纤维素、木聚糖降解模式研究第15-18页
            1.4.3.1 纤维素降解机制第16-17页
            1.4.3.2 木聚糖降解机制第17-18页
        1.4.4 GH10家族木聚糖酶研究概述第18-19页
        1.4.5 糖苷水解酶协同效应的研究第19页
    1.5 Caldicellulosiruptor bescii研究进展第19-24页
        1.5.1 Caldicellulosiruptor bescii概述第19-20页
        1.5.2 C.bescii中糖苷水解酶研究第20-23页
            1.5.2.1 C.bescii纤维素酶第20-22页
            1.5.2.2 C.bescii木聚糖酶第22-23页
        1.5.3 Ce1A催化机制研究第23-24页
    1.6 本研究的目的和意义第24-25页
第二章 活性位点附近非催化残基在GH10家族木聚糖酶中的作用研究第25-45页
    2.1 前言第25页
    2.2 材料与方法第25-29页
        2.2.1 实验材料第25-26页
            2.2.1.1 菌株、培养基第25页
            2.2.1.2 仪器及生化试剂第25-26页
            2.2.1.3 引物的合成与测序第26页
        2.2.2 实验方法第26-29页
            2.2.2.1 CbXyn10C点突变体的构建第26-27页
            2.2.2.2 CbXyn10C重组蛋白的表达与纯化第27页
            2.2.2.3 CbXyn10C酶活的检测第27页
            2.2.2.4 CbXyn10C动力学参数的测定第27页
            2.2.2.5 CbXyn10C对寡糖催化效率的检测第27-28页
            2.2.2.6 ITC检测第28页
            2.2.2.7 圆二色谱检测第28页
            2.2.2.8 CbXyn10C与纤维七糖的分子对接第28页
            2.2.2.9 蛋白结晶、数据收集和结构解析第28-29页
            2.2.2.10 动力学模拟第29页
    2.3 结果与分析第29-42页
        2.3.0 等温滴定量热仪(ITC)分析第29-32页
        2.3.1 野生型CbXyn10C的晶体结构第32-33页
        2.3.2 无活性突变体E140Q/E248Q与木七糖的复合物结构第33-34页
        2.3.3 无活性突变体E140Q/E248Q与纤维寡糖的复合物结构第34-35页
        2.3.4 CbXyn10C与纤维七糖结合的分子动力学模拟第35-36页
        2.3.5 CbXyn10C结合口袋中氨基酸残基对水解木聚糖、纤维素的影响第36-40页
        2.3.6 突变远端氨基酸残基对水解木聚糖、纤维素的影响第40-41页
        2.3.7 突变体的动力学分析第41-42页
    2.4 讨论第42-45页
第三章 全酶CbXyn10C/Ce148B的N端和C端协同效应的研究第45-56页
    3.1 前言第45页
    3.2 材料与方法第45-47页
        3.2.1 实验材料第45页
            3.2.1.1 菌株、培养基第45页
            3.2.1.2 仪器及生化试剂第45页
            3.2.1.3 引物的合成与测序第45页
        3.2.2 实验方法第45-47页
            3.2.2.1 GH10-CBM、CBM-GH48和GH10-CBM-GH48蛋白的表达和纯化第45-46页
            3.2.2.2 CBD-GST的表达和纯化第46页
            3.2.2.3 酶活分析第46页
            3.2.2.4 水解产物的分析第46-47页
            3.2.2.5 免疫荧光显微镜检测第47页
    3.3 结果与分析第47-54页
        3.3.1 GH10-CBM,CBM-GH48和GH10-CBM-GH48的克隆、表达和纯化第47-48页
        3.3.2 GH10-CBM和CBM-GH48对纤维素的协同效应第48-49页
        3.3.3 GH10-CBM和CBM-GH48对木聚糖的协同作用检测第49-51页
        3.3.4 GH10-CBM和CBM-GH48对玉米秸秆的协同效应第51-52页
        3.3.5 免疫荧光显微镜检测第52-53页
        3.3.6 GH10-CBM-GH48降解纤维素的机制初探第53-54页
        3.3.7 GH10-CBM和CBM-GH48协同降解纤维素的机制示意图第54页
    3.4 讨论第54-56页
第四章 结论和展望第56-58页
    4.1 全文结论第56页
    4.2 展望第56-58页
参考文献第58-65页
致谢第65-67页
个人简历第67-68页
附表第68-69页

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