| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩写名词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.1 PEPC研究进展 | 第11-13页 |
| 1.1.1 PEPC生物学功能 | 第11-12页 |
| 1.1.2 PEPC在棉花中研究 | 第12-13页 |
| 1.2 脂肪酸生物合成 | 第13-17页 |
| 1.2.1 脂肪酸从头合成 | 第13-14页 |
| 1.2.2 TAG生物合成 | 第14-15页 |
| 1.2.3 脂肪酸组分 | 第15页 |
| 1.2.4 转录因子参与油分合成 | 第15-17页 |
| 1.3 植物油脂与非生物胁迫 | 第17-19页 |
| 1.3.1 植物磷脂信号参与植物抗逆 | 第17-18页 |
| 1.3.2 脂肪酸组分与植物抗逆 | 第18-19页 |
| 1.4 植物基因组与转录组研究 | 第19-22页 |
| 1.4.1 植物基因组测序 | 第19-20页 |
| 1.4.2 棉花基因组测序 | 第20-21页 |
| 1.4.3 转录组测序 | 第21页 |
| 1.4.4 油料植物种子转录组测序 | 第21-22页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第23-34页 |
| 2.1 材料 | 第23-24页 |
| 2.1.1 植株材料 | 第23页 |
| 2.1.2 基因组及转录组数据 | 第23页 |
| 2.1.3 载体及菌株 | 第23-24页 |
| 2.1.4 试剂、酶及试剂盒 | 第24页 |
| 2.1.5 实验仪器 | 第24页 |
| 2.2 方法 | 第24-32页 |
| 2.2.1 生物信息学分析方法 | 第24-25页 |
| 2.2.2 棉籽发育转录组数据分析 | 第25-26页 |
| 2.2.3 植物材料处理方法 | 第26-27页 |
| 2.2.4 引物设计及合成 | 第27-28页 |
| 2.2.5 DNA提取 | 第28-29页 |
| 2.2.6 RNA提取及实时荧光定量PCR | 第29-30页 |
| 2.2.7 载体构建 | 第30-31页 |
| 2.2.8 叶盘法转化烟草 | 第31-32页 |
| 2.3 田间农艺性状调查 | 第32页 |
| 2.4 种子油分含量测定 | 第32-33页 |
| 2.4.1 索氏提取法测定油分含量 | 第32页 |
| 2.4.2 正己烷浸提法测定油分含量 | 第32-33页 |
| 2.4.3 近红外反射光谱模型测定棉籽油分 | 第33页 |
| 2.4.4 棉籽脂肪酸组分含量测定 | 第33页 |
| 2.5 数据处理 | 第33-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-97页 |
| 3.1 棉籽油分合成基因表达谱 | 第34-51页 |
| 3.1.1 棉籽发育及油分动态积累 | 第34-35页 |
| 3.1.2 棉籽发育过程中基因表达及功能分类 | 第35-39页 |
| 3.1.3 棉籽发育过程中基因表达差异 | 第39-43页 |
| 3.1.4 棉籽油分合成基因表达谱 | 第43-48页 |
| 3.1.5 调节脂肪酸组分相关基因表达谱 | 第48-51页 |
| 3.2 棉属PEPC基因全基因组鉴定与表达分析 | 第51-67页 |
| 3.2.1 四个棉花种中PEPC基因家族成员鉴定 | 第51-52页 |
| 3.2.2 棉花PEPC蛋白序列比对与进化分析 | 第52-54页 |
| 3.2.3 棉花PEPC基因结构与保守motif分析 | 第54-56页 |
| 3.2.4 棉属PEPC基因染色体定位和基因复制 | 第56-58页 |
| 3.2.5 棉花PEPC基因家族中直系及旁系同源基因的鉴定 | 第58-60页 |
| 3.2.6 棉花PEPC基因启动子区顺式调控原件分析 | 第60-62页 |
| 3.2.7 PEPC基因在棉花不同组织表达分析 | 第62-65页 |
| 3.2.8 非生物胁迫下GhPEPC基因的表达模式 | 第65-67页 |
| 3.3 干涉GhPEPC2转基因与对照棉籽发育转录组分析 | 第67-76页 |
| 3.3.1 对陆地棉中GhPEPC基因的表达模式分析 | 第67-68页 |
| 3.3.2 转基因株系中PEPC基因表达量降低 | 第68-69页 |
| 3.3.3 干涉GhPEPC2基因表达,脂质代谢相关基因上调表达 | 第69-74页 |
| 3.3.4 干涉GhPEPC2基因表达,氨基酸代谢相关基因下调表达 | 第74-76页 |
| 3.4 候选基因功能初步验证 | 第76-82页 |
| 3.4.1 候选基因克隆 | 第76-77页 |
| 3.4.2 过表达载体构建 | 第77-78页 |
| 3.4.3 遗传转化烟草 | 第78-79页 |
| 3.4.4 转基因烟草植株的阳性鉴定 | 第79-81页 |
| 3.4.5 抗性植株表型与分子检测 | 第81-82页 |
| 3.4.6 转基因烟草种子油分含量测定 | 第82页 |
| 3.5 转基因棉花高油材料的筛选和抗逆性分析 | 第82-97页 |
| 3.5.1 转基因高油材料筛选 | 第83-88页 |
| 3.5.2 转基因材料田间性状调查及考种 | 第88-93页 |
| 3.5.3 逆境胁迫下发芽实验 | 第93-95页 |
| 3.5.4 苗期根系扫描实验 | 第95-97页 |
| 第四章 讨论 | 第97-103页 |
| 4.1 棉籽油分合成基因表达谱 | 第97-99页 |
| 4.2 棉属PEPC基因的进化和功能分析 | 第99-101页 |
| 4.3 干涉GhPEPC2基因表达提高棉籽油分含量 | 第101-102页 |
| 4.4 转基因高油材料的筛选和抗逆性分析 | 第102-103页 |
| 第五章 结论 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 附录 | 第118-136页 |
| 附图1 棉籽发育不同时期干重和含水量测定 | 第118页 |
| 附图2 棉籽发育过程中基因表达趋势分析 | 第118-119页 |
| 附图3 棉籽发育过程中DEGs GO分布分析 | 第119-120页 |
| 附图4 GhFAD2基因在陆地棉不同组织表达分析 | 第120页 |
| 附图5 已测序四棉种中33个PEPC蛋白最保守的10个motifs图标 | 第120-121页 |
| 附图6 二倍体棉种中PEPC基因启动子区非生物胁迫顺式调控原件 | 第121页 |
| 附图7 丙二醛含量测定 | 第121-122页 |
| 附表1 陆地棉基因KEGG功能注释分析 | 第122-126页 |
| 附表2 棉籽发育过程中转录因子基因表达模式 | 第126-127页 |
| 附表3 已测序四棉种中PEPC基因鉴定信息 | 第127-129页 |
| 附表4 已测序四棉种中PEPC复制基因Ka/ks分析 | 第129-134页 |
| 附表5 干涉GhPEPC2转基因株系中20 DPA上调DEGs KEGG富集分析 | 第134-135页 |
| 附表6 干涉GhPEPC2转基因株系中20 DPA下调DEGs KEGG富集分析 | 第135-136页 |
| 个人简介 | 第136-137页 |
