| 中文摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-8页 |
| 第1章 绪论 | 第13-21页 |
| 1.1 手足口病及其病原体概述 | 第13-15页 |
| 1.1.1 手足口病概述 | 第13页 |
| 1.1.2 手足口病的发展 | 第13页 |
| 1.1.3 手足口病临床表现 | 第13-14页 |
| 1.1.4 手足口病病原体概述 | 第14-15页 |
| 1.2 柯萨奇病毒A组6型的病原学基础 | 第15-17页 |
| 1.2.1 CVA6的基因组特征 | 第15-16页 |
| 1.2.2 CVA6的临床表现 | 第16-17页 |
| 1.3 关于生物信息学的概述及分子进化的研究 | 第17-20页 |
| 1.3.1 生物信息学概述 | 第17页 |
| 1.3.2 系统发育分析 | 第17-20页 |
| 1.4 病毒的基因重组 | 第20-21页 |
| 第2章 CVA6病毒的培养与鉴定 | 第21-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 细胞株与病毒株 | 第21页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第21-22页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-30页 |
| 2.2.1 实验试剂配制 | 第22-24页 |
| 2.2.2 病毒标本的处理 | 第24页 |
| 2.2.3 细胞培养 | 第24-25页 |
| 2.2.4 CVA6病毒的接种与收集 | 第25-26页 |
| 2.2.5 CVA6病毒RNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.2.6 CVA6病毒RT-PCR扩增 | 第27-29页 |
| 2.2.7 产物的回收与纯化 | 第29-30页 |
| 2.2.8 RT-PCR纯化产物测序及序列比对分析 | 第30页 |
| 2.3 实验结果 | 第30-35页 |
| 2.3.1 CVA6感染RD细胞结果 | 第30-31页 |
| 2.3.2 CVA6PCR结果 | 第31-33页 |
| 2.3.3 CVA6VP1测序结果 | 第33-34页 |
| 2.3.4 CVA6VP1序列比对结果 | 第34-35页 |
| 第3章 CVA6的分子进化研究 | 第35-57页 |
| 3.1 实验材料 | 第35页 |
| 3.1.1 实验设备 | 第35页 |
| 3.1.2 数据处理软件 | 第35页 |
| 3.1.3 数据来源 | 第35页 |
| 3.2 实验方法 | 第35-38页 |
| 3.2.1 CVA6VP1序列的下载及筛选 | 第35页 |
| 3.2.2 数据的处理 | 第35-36页 |
| 3.2.3 应用BEAST对CVA6VP1基因进行进化分析 | 第36-37页 |
| 3.2.4 CVA6全基因组重组分析 | 第37-38页 |
| 3.3 结果 | 第38-57页 |
| 3.3.1 CVA6VP1序列的重组分析及饱和度检测结果 | 第38页 |
| 3.3.2 最佳核苷酸替代模型的选择 | 第38页 |
| 3.3.3 构建CVA6VP1最大可信分支树(MCC) | 第38-42页 |
| 3.3.4 绘制CVA6VP1基因多态性变化曲线 | 第42-43页 |
| 3.3.5 中国、日本、泰国和印度的CVA6基因型分布 | 第43-44页 |
| 3.3.6 CVA6VP1基因的进化率与密码子的突变率 | 第44-46页 |
| 3.3.7 CVA6的重组分析 | 第46-57页 |
| 第4章 讨论 | 第57-61页 |
| 第5章 结论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
