| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第10-21页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第10页 |
| 1.2 西瓜物种多样性 | 第10-13页 |
| 1.3 西瓜果实成熟品质性状研究进展 | 第13-18页 |
| 1.4 西瓜基因组及群体进化研究进展 | 第18-20页 |
| 1.5 研究内容及拟解决的关键科学问题 | 第20-21页 |
| 第二章 野生西瓜基因组序列图谱构建及基因组变异研究 | 第21-36页 |
| 2.1 前言 | 第21页 |
| 2.2 材料与方法 | 第21-22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-35页 |
| 2.3.1 基因组组装及质量评估 | 第22-25页 |
| 2.3.2 基因组重组热点及共线性比较 | 第25-26页 |
| 2.3.3 基因组注释 | 第26-29页 |
| 2.3.4 基因组复制和丢失分析 | 第29-31页 |
| 2.3.5 基因组变异比较 | 第31-33页 |
| 2.3.6 果实品质性状基因比较分析 | 第33-35页 |
| 2.4 讨论 | 第35-36页 |
| 第三章 栽培西瓜与野生西瓜果实品质发育转录组比较研究 | 第36-58页 |
| 3.1 前言 | 第36页 |
| 3.2 材料与方法 | 第36-39页 |
| 3.3 结果与分析 | 第39-56页 |
| 3.3.1 转录组测序 | 第39页 |
| 3.3.2 果实品质发育过程差异表达基因鉴定 | 第39-41页 |
| 3.3.3 差异表达基因功能分析 | 第41-43页 |
| 3.3.4 代谢途径差异分析 | 第43-45页 |
| 3.3.5 品质相关基因表达比较分析 | 第45-55页 |
| 3.3.6 栽培和野生西瓜果肉特异表达基因 | 第55-56页 |
| 3.4 讨论 | 第56-58页 |
| 第四章 西瓜果实品质性状基因组选择进化研究 | 第58-82页 |
| 4.1 前言 | 第58-59页 |
| 4.2 材料与方法 | 第59页 |
| 4.3 结果与分析 | 第59-80页 |
| 4.3.1 种间进化和遗传多样性 | 第59-64页 |
| 4.3.2 果实性状基因组关联分析 | 第64-68页 |
| 4.3.3 野生种到半野生种进化 | 第68-74页 |
| 4.3.4 半野生种到地方品种的驯化 | 第74-77页 |
| 4.3.5 地方品种到现代栽培种的改良 | 第77-78页 |
| 4.3.6 果实品质性状基因组进化驯化与改良模式 | 第78-80页 |
| 4.4 讨论 | 第80-82页 |
| 第五章 全文结论 | 第82-85页 |
| 参考文献 | 第85-94页 |
| 附录 | 第94-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 作者简介 | 第109页 |