| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略术语表 | 第11-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-30页 |
| 1.1 豆科植物与微生物共生关系的产生机制 | 第15-23页 |
| 1.1.1 促进豆科植物与微生物共生的信号 | 第16页 |
| 1.1.2 LysM结构类受体激酶的识别 | 第16-20页 |
| 1.1.3 感染过程中的共生信号传导 | 第20-21页 |
| 1.1.4 共生转录网络 | 第21-23页 |
| 1.2 植物small RNA的生源及产生途径 | 第23-27页 |
| 1.2.1 microRNA的序列特征及其产生途径 | 第23-24页 |
| 1.2.2 其他small RNA类群的产生途径 | 第24-27页 |
| 1.3 植物small RNA的生物学功能 | 第27-28页 |
| 1.4 本论文研究的目的和意义 | 第28-30页 |
| 第二章 miRNA及其靶基因在豆科植物与微生物共生过程中的表达与调控 | 第30-45页 |
| 2.1 数据资源及分析方法 | 第30-33页 |
| 2.1.1 数据资源 | 第30-32页 |
| 2.1.2 分析方法 | 第32-33页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第33-43页 |
| 2.2.1 small RNA数据的序列特征分析 | 第33-34页 |
| 2.2.2 microRNA的预测及差异表达分析 | 第34-40页 |
| 2.2.3 miRNAs靶基因的预测及功能分析 | 第40-42页 |
| 2.2.4 根瘤和菌根中miRNAs与靶基因的调控关系 | 第42-43页 |
| 2.3 小结 | 第43-45页 |
| 第三章 蒺藜苜蓿中tRNA介导产生的sRNAs的特征及其在共生过程中的功能 | 第45-61页 |
| 3.1 数据资源及分析方法 | 第45-47页 |
| 3.1.1 数据资源 | 第45页 |
| 3.1.2 分析方法 | 第45-47页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第47-59页 |
| 3.2.1 由tRNA介导产生的sRNAs的来源特征 | 第47-51页 |
| 3.2.2 tRFs的产生及其在染色体上的分布 | 第51-56页 |
| 3.2.3 tRFs靶基因的预测及功能分析 | 第56-59页 |
| 3.3 小结 | 第59-61页 |
| 第四章 蒺藜苜蓿中来源于rRNA的srRNAs的特性以及与其他sRNAs的调控关系 | 第61-70页 |
| 4.1 数据资源及分析方法 | 第61-62页 |
| 4.1.1 数据资源 | 第61页 |
| 4.1.2 分析方法 | 第61-62页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第62-68页 |
| 4.2.1 srRNAs的序列特征及来源分布 | 第62-64页 |
| 4.2.2 srRNAs的调控功能 | 第64-68页 |
| 4.3 小结 | 第68-70页 |
| 第五章 总结与展望 | 第70-72页 |
| 5.1 总结 | 第70-71页 |
| 5.2 展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-84页 |
| 附录 | 第84-87页 |
| 作者简历 | 第87页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文及著作 | 第87页 |
