| 中文摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 引言 | 第13-15页 |
| 文献综述 | 第15-27页 |
| 1 SSR 的含义及特点 | 第15-16页 |
| 1.1 EST-SSR 标记的开发研究进展 | 第15-16页 |
| 2 Illumina/Solexa 转录组测序技术及其应用 | 第16-19页 |
| 2.1 转录组测序技术的概念 | 第16-17页 |
| 2.2 Illumina/Solexa 测序原理 | 第17-18页 |
| 2.3 基于 Illumina/Solexa 转录组测序的 SSR 标记开发研究进展 | 第18-19页 |
| 3 肌肉生长抑制素（MSTN）基因的研究现状 | 第19-24页 |
| 3.1 MSTN 基因概述 | 第19-20页 |
| 3.2 MSTN 基因的结构和功能 | 第20-21页 |
| 3.3 MSTN 基因的表达 | 第21-22页 |
| 3.4 MSTN 对骨骼肌调控作用机制 | 第22-24页 |
| 4 本课题提出的依据和研究意义 | 第24-27页 |
| 试验一基于中华鳖转录组测序的微卫星标记的开发、验证 | 第27-40页 |
| 1 材料与方法 | 第28-31页 |
| 1.1 材料来源 | 第28页 |
| 1.2 实验方法 | 第28-31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-36页 |
| 2.1 EST-SSR 的分布和频率分析 | 第31-32页 |
| 2.2 中华鳖 EST-SSR 引物的开发及多态性引物的验证 | 第32页 |
| 2.3 中华鳖四个养殖群体的遗传多样性检测 | 第32-35页 |
| 2.4 群体间遗传结构分析 | 第35-36页 |
| 3 讨论 | 第36-39页 |
| 3.1 利用中华鳖转录组测序开发微卫星标记 | 第36-37页 |
| 3.2 中华鳖转录组中 EST-SSR 的分布和频率 | 第37-38页 |
| 3.3 中华鳖 4 个养殖群体的遗传多样性 | 第38-39页 |
| 3.4 中华鳖 4 个养殖群体的遗传分化 | 第39页 |
| 4 小结 | 第39-40页 |
| 试验二中华鳖 EST-SSR 标记与生长性状相关性分析 | 第40-46页 |
| 1 材料与方法 | 第40-41页 |
| 1.1 材料来源 | 第40页 |
| 1.2 EST-SSR 引物 | 第40-41页 |
| 1.3 试验方法 | 第41页 |
| 2 结果与分析 | 第41-44页 |
| 2.1 表型性状的分布检测 | 第41-42页 |
| 2.2 生长性状显著相关位点、基因型的分析 | 第42-44页 |
| 3 讨论 | 第44-45页 |
| 3.1 生长性状关联的生长标记的分析 | 第44-45页 |
| 4 小结 | 第45-46页 |
| 试验三中华鳖 MSTN 基因的克隆及表达分析 | 第46-65页 |
| 1 材料与方法 | 第46-53页 |
| 1.1 材料来源 | 第46-47页 |
| 1.2 试验方法 | 第47-53页 |
| 2. 结果与分析 | 第53-62页 |
| 2.1 中华鳖 MSTN 基因的 RACE 结果及 cDNA 全长序列 | 第53-55页 |
| 2.2 MSTN 基因与其它物种的同源比对及系统进化树分析 | 第55-58页 |
| 2.3 中华鳖 MSTN 基因编码蛋白的生物信息学分析 | 第58-61页 |
| 2.4 不同年龄、不同组织 MSTN 基因的荧光定量表达 | 第61-62页 |
| 3.讨论 | 第62-63页 |
| 3.1 中华鳖 MSTN 蛋白序列的保守性 | 第62页 |
| 3.2 中华鳖 MSTN 基因在不同组织和年龄段的表达差异性分析 | 第62-63页 |
| 4 小结 | 第63-65页 |
| 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-77页 |
| 攻读学位期间公开发表的论文 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
