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山东省优质地方品种鸡禽白血病病毒分离株亚型鉴定及其分子特点分析

基金项目第4-5页
符号说明第5-11页
中文摘要第11-13页
Abstract第13-14页
引言第15-29页
    1.1 禽白血病病毒发展史第15-16页
    1.2 病原学第16-20页
        1.2.1 分类第16页
        1.2.2 形态学第16-17页
        1.2.3 病毒复制、转录、翻译第17页
        1.2.4 理化特性第17-18页
        1.2.5 病毒的全基因组结构第18-19页
        1.2.6 病毒的致肿瘤机制第19-20页
    1.3 分子流行病学第20-22页
        1.3.1 宿主范围第20-21页
        1.3.2 传播方式第21页
        1.3.3 潜伏期第21-22页
        1.3.4 临床特征及病理变化第22页
    1.4 ALV-J 与其它病毒的共感染现状第22-23页
    1.5 ALV-J 基因的变异及其与治病性的相关性分析第23页
    1.6 ALV 的检测与诊断第23-27页
        1.6.1 病毒分离第24页
        1.6.2 酶标免疫荧光检测技术(ELISA)第24-25页
        1.6.3 病毒核酸的检测第25-26页
        1.6.4 免疫组化法第26页
        1.6.5 酶分析法第26页
        1.6.6 其它检测方法第26-27页
    1.7 预防和控制第27-28页
        1.7.1 政府主管部门要强化种鸡群 ALV 的监控第27页
        1.7.2 加强对种鸡群 ALV 的净化第27-28页
        1.7.3 强化弱毒疫苗中检测和监控第28页
        1.7.4 原种鸡群的 ALV 净化第28页
    1.8 本研究的目的及意义第28-29页
2.材料和方法第29-40页
    2.1 材料第29-31页
        2.1.1 病毒来源及背景第29页
        2.1.2 细胞第29页
        2.1.3 主要试剂第29页
        2.1.4 仪器设备第29-30页
        2.1.5 其它相关培养基和溶液配制第30-31页
    2.2 鸡胚成纤维细胞的制备第31页
    2.3 病毒分离、鉴定第31-33页
        2.3.1 病毒分离第31-32页
        2.3.2 鉴定第32-33页
            2.3.2.1 IFA 验证第32页
            2.3.3.2 ELISA 检测第32-33页
    2.4 前病毒 DNA 的提取第33页
    2.5 禽白血病病毒的 PCR 扩增第33-38页
        2.5.1 引物序列第33-34页
        2.5.2 禽白血病病毒 PCR 扩增第34-35页
            2.5.2.1 山东五大地方品种鸡 ALV 分离株 PCR 扩增第34页
            2.5.2.2 ALV-J 全基因组 PCR 扩增第34-35页
        2.5.3 PCR 产物 DNA 凝胶电泳验证、回收及定量第35页
        2.5.4 A 尾连接第35-36页
        2.5.5 DNA 连接第36页
        2.5.6 大肠杆菌感受态细胞的制备第36-37页
        2.5.7 连接产物的转化第37页
        2.5.8 菌液及质粒 DNA PCR 验证第37-38页
            2.5.8.1 菌液 PCR 验证、鉴定第37页
            2.5.8.2 质粒 DNA 的提取、验证第37-38页
    2.6 序列分析第38-40页
        2.6.1 参考毒株第38-39页
        2.6.2 序列分析第39-40页
            2.6.2.1 遗传基因进化树分析第39页
            2.6.2.2 ALV 分离株与参考株的同源性结果第39页
            2.6.2.3 ALV-J 分离株 gp85 基因序列变异情况分析第39页
            2.6.2.4 三个代表性 ALV-J 分离株 E 元件分析比对第39页
            2.6.2.5 U3 转录作用元件的预测分析第39-40页
3.结果与分析第40-55页
    3.1 分离鉴定结果第40-42页
        3.1.1 IFA 检测结果第40-41页
        3.1.2 ELISA 检测结果第41-42页
    3.2 山东五大地方品种鸡 ALV 分离株 PCR 扩增结果第42-43页
    3.3 ALV-J 全基因组 PCR 扩增结果第43-46页
        3.3.1 ALV-J 全基因组 PCR 扩增凝胶电泳结果第43页
        3.3.2 菌液 PCR 验证结果第43-44页
        3.3.3 质粒 PCR 验证结果第44-46页
    3.4 测序结果第46页
    3.5 序列分析结果第46-53页
        3.5.1 山东五大地方品种鸡 ALV 分离株 PCR 扩增结果分析第46-50页
            3.5.1.1 山东五大地方品种鸡 ALV 分离株同源性分析结果第46-47页
            3.5.1.2 山东五大地方种鸡 ALV 分离株遗传基因进化树第47-48页
            3.5.1.3 山东地方品种鸡 ALV-J 分离株 gp85 基因序列变异情况分析第48-50页
        3.5.2 共感染毒株 ALV-J 全基因组序列分析结果第50-53页
            3.5.2.1 共感染 ALV-J 分离株与参考序列不同片段同源性比对第50页
            3.5.2.2 共感染 ALV-J 分离株全基因组系统发育树分析比对第50-51页
            3.5.2.3 共感染 ALV-J 分离株 E 元件分析比对第51-52页
            3.5.2.4 U3 区转录作用元件的预测分析第52-53页
    3.6 重组序列的分析、比对第53-55页
4.讨论第55-58页
    4.1 山东地方品种鸡分离株 ALV 主要流行亚型鉴定及 gp85 基因分子特征分析第55-56页
        4.1.1 山东五大地方品种鸡分离株 ALV 主要流行亚型鉴定第55页
        4.1.2 山东地方品种鸡 ALV-Jgp85 基因分子特征分析第55-56页
    4.2 与其它致鸡肿瘤病病毒共感染的代表性 ALV-J 全基因组序列分析第56-58页
5.结论第58-59页
6.创新点第59-60页
7.参考文献第60-69页
8.致谢第69-70页
9.硕士期间发表论文情况第70页

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