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基于转录组测序的番茄类ASR基因耐盐机制研究

摘要第4-5页
abstract第5-6页
第1章 文献综述第10-20页
    1.1 盐胁迫第10-12页
        1.1.1 盐胁迫对植物种子萌发的影响第10页
        1.1.2 盐胁迫对植物生长和生理生化特性的影响第10-12页
    1.2 转录组测序技术第12-13页
        1.2.1 转录组测序技术的原理第12页
        1.2.2 转录组测序技术的特点第12页
        1.2.3 转录组测序技术在植物中的应用第12-13页
    1.3 耐盐机制研究进展第13-17页
        1.3.1 植物耐盐的生理机制第14-15页
        1.3.2 植物耐盐的分子机制第15-17页
    1.4 本研究背景、目的及意义第17页
    1.5 本研究主要内容及技术路线第17-20页
        1.5.1 主要研究内容第17-18页
        1.5.2 技术路线图第18-20页
第2章 番茄耐盐生理研究第20-30页
    2.1 实验材料第20-21页
        2.1.1 植物材料第20页
        2.1.2 主要试剂第20-21页
        2.1.3 实验仪器第21页
    2.2 实验方法第21-24页
        2.2.1 萌芽期处理第21页
        2.2.2 萌芽期相关指标的测定第21-22页
        2.2.3 幼苗期处理第22页
        2.2.4 幼苗期相关指标的测定第22-23页
        2.2.5 统计分析第23-24页
    2.3 结果与分析第24-28页
        2.3.1 盐胁迫下番茄萌芽期的生理分析第24-25页
        2.3.2 盐胁迫下番茄幼苗期的生理分析第25-28页
    2.4 本章小结第28-30页
第3章 基于转录组测序的番茄耐盐基因分析第30-50页
    3.1 实验材料第30页
        3.1.1 植物材料第30页
        3.1.2 实验仪器第30页
    3.2 实验方法第30-33页
        3.2.1 RNA-seq高通量测序第30-31页
        3.2.2 原始测序数据预处理第31页
        3.2.3 参考序列比对分析第31页
        3.2.4 测序质量评估第31-32页
        3.2.5 转录本差异表达分析第32页
        3.2.6 聚类分析第32页
        3.2.7 GO富集分析第32-33页
        3.2.8 KEGG富集分析第33页
        3.2.9 参考物种信息第33页
    3.3 结果与分析第33-48页
        3.3.1 差异表达分析第33-34页
        3.3.2 GO富集分析第34-35页
        3.3.3 蛋白质代谢途径的转录组测序分析第35-39页
        3.3.4 碳水化合物代谢途径的转录组测序分析第39-43页
        3.3.5 盐胁迫相关通路的转录组测序分析第43-48页
    3.4 本章小结第48-50页
第4章 番茄盐胁迫相关基因表达分析第50-62页
    4.1 实验材料第50-51页
        4.1.1 植物材料第50页
        4.1.2 主要试剂第50页
        4.1.3 实验仪器第50-51页
        4.1.4 实验器具处理第51页
    4.2 实验方法第51-55页
        4.2.1 盐胁迫处理第51页
        4.2.2 总RNA的提取第51-52页
        4.2.3 RNA的消化第52页
        4.2.4 RNA质量检测第52页
        4.2.5 cDNA的合成第52-53页
        4.2.6 引物的设计与合成第53-54页
        4.2.7 PCR扩增反应第54-55页
        4.2.8 实时荧光定量PCR第55页
        4.2.9 统计分析第55页
    4.3 结果与分析第55-60页
        4.3.1 总RNA的检测第55-56页
        4.3.2 PCR扩增目标基因和内参基因β-tublin第56-58页
        4.3.3 目标基因在盐胁迫处理下的表达特性第58-60页
    4.4 本章小结第60-62页
第5章 番茄两个类ASR基因的耐盐机制研究第62-88页
    5.1 实验材料第62-63页
        5.1.1 植物材料第62页
        5.1.2 实验仪器第62页
        5.1.3 试剂第62-63页
    5.2 实验方法第63-64页
        5.2.1 番茄ASR2-like和ASR3-like基因的生物信息学分析第63页
        5.2.2 多维度实验处理第63页
        5.2.3 相关指标测定第63-64页
        5.2.4 基因相对表达量分析第64页
    5.3 结果与分析第64-86页
        5.3.1 番茄ASR2-like和ASR3-like理化性质及结构预测第64-68页
        5.3.2 不同处理对番茄幼苗相关指标的影响第68-76页
        5.3.3 脱落酸(ABA)响应盐胁迫的模式分析第76-77页
        5.3.4 ASR2-like和ASR3-like基因表达分析第77-83页
        5.3.5 基因应答机制网络构建第83-86页
    5.4 本章小结第86-88页
第6章 全文结论及展望第88-90页
    6.1 结论第88-89页
    6.2 展望第89-90页
参考文献第90-100页
附录第100-102页
发表论文和参加科研情况说明第102-104页
致谢第104-105页

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