摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5-6页 |
第1章 文献综述 | 第10-20页 |
1.1 盐胁迫 | 第10-12页 |
1.1.1 盐胁迫对植物种子萌发的影响 | 第10页 |
1.1.2 盐胁迫对植物生长和生理生化特性的影响 | 第10-12页 |
1.2 转录组测序技术 | 第12-13页 |
1.2.1 转录组测序技术的原理 | 第12页 |
1.2.2 转录组测序技术的特点 | 第12页 |
1.2.3 转录组测序技术在植物中的应用 | 第12-13页 |
1.3 耐盐机制研究进展 | 第13-17页 |
1.3.1 植物耐盐的生理机制 | 第14-15页 |
1.3.2 植物耐盐的分子机制 | 第15-17页 |
1.4 本研究背景、目的及意义 | 第17页 |
1.5 本研究主要内容及技术路线 | 第17-20页 |
1.5.1 主要研究内容 | 第17-18页 |
1.5.2 技术路线图 | 第18-20页 |
第2章 番茄耐盐生理研究 | 第20-30页 |
2.1 实验材料 | 第20-21页 |
2.1.1 植物材料 | 第20页 |
2.1.2 主要试剂 | 第20-21页 |
2.1.3 实验仪器 | 第21页 |
2.2 实验方法 | 第21-24页 |
2.2.1 萌芽期处理 | 第21页 |
2.2.2 萌芽期相关指标的测定 | 第21-22页 |
2.2.3 幼苗期处理 | 第22页 |
2.2.4 幼苗期相关指标的测定 | 第22-23页 |
2.2.5 统计分析 | 第23-24页 |
2.3 结果与分析 | 第24-28页 |
2.3.1 盐胁迫下番茄萌芽期的生理分析 | 第24-25页 |
2.3.2 盐胁迫下番茄幼苗期的生理分析 | 第25-28页 |
2.4 本章小结 | 第28-30页 |
第3章 基于转录组测序的番茄耐盐基因分析 | 第30-50页 |
3.1 实验材料 | 第30页 |
3.1.1 植物材料 | 第30页 |
3.1.2 实验仪器 | 第30页 |
3.2 实验方法 | 第30-33页 |
3.2.1 RNA-seq高通量测序 | 第30-31页 |
3.2.2 原始测序数据预处理 | 第31页 |
3.2.3 参考序列比对分析 | 第31页 |
3.2.4 测序质量评估 | 第31-32页 |
3.2.5 转录本差异表达分析 | 第32页 |
3.2.6 聚类分析 | 第32页 |
3.2.7 GO富集分析 | 第32-33页 |
3.2.8 KEGG富集分析 | 第33页 |
3.2.9 参考物种信息 | 第33页 |
3.3 结果与分析 | 第33-48页 |
3.3.1 差异表达分析 | 第33-34页 |
3.3.2 GO富集分析 | 第34-35页 |
3.3.3 蛋白质代谢途径的转录组测序分析 | 第35-39页 |
3.3.4 碳水化合物代谢途径的转录组测序分析 | 第39-43页 |
3.3.5 盐胁迫相关通路的转录组测序分析 | 第43-48页 |
3.4 本章小结 | 第48-50页 |
第4章 番茄盐胁迫相关基因表达分析 | 第50-62页 |
4.1 实验材料 | 第50-51页 |
4.1.1 植物材料 | 第50页 |
4.1.2 主要试剂 | 第50页 |
4.1.3 实验仪器 | 第50-51页 |
4.1.4 实验器具处理 | 第51页 |
4.2 实验方法 | 第51-55页 |
4.2.1 盐胁迫处理 | 第51页 |
4.2.2 总RNA的提取 | 第51-52页 |
4.2.3 RNA的消化 | 第52页 |
4.2.4 RNA质量检测 | 第52页 |
4.2.5 cDNA的合成 | 第52-53页 |
4.2.6 引物的设计与合成 | 第53-54页 |
4.2.7 PCR扩增反应 | 第54-55页 |
4.2.8 实时荧光定量PCR | 第55页 |
4.2.9 统计分析 | 第55页 |
4.3 结果与分析 | 第55-60页 |
4.3.1 总RNA的检测 | 第55-56页 |
4.3.2 PCR扩增目标基因和内参基因β-tublin | 第56-58页 |
4.3.3 目标基因在盐胁迫处理下的表达特性 | 第58-60页 |
4.4 本章小结 | 第60-62页 |
第5章 番茄两个类ASR基因的耐盐机制研究 | 第62-88页 |
5.1 实验材料 | 第62-63页 |
5.1.1 植物材料 | 第62页 |
5.1.2 实验仪器 | 第62页 |
5.1.3 试剂 | 第62-63页 |
5.2 实验方法 | 第63-64页 |
5.2.1 番茄ASR2-like和ASR3-like基因的生物信息学分析 | 第63页 |
5.2.2 多维度实验处理 | 第63页 |
5.2.3 相关指标测定 | 第63-64页 |
5.2.4 基因相对表达量分析 | 第64页 |
5.3 结果与分析 | 第64-86页 |
5.3.1 番茄ASR2-like和ASR3-like理化性质及结构预测 | 第64-68页 |
5.3.2 不同处理对番茄幼苗相关指标的影响 | 第68-76页 |
5.3.3 脱落酸(ABA)响应盐胁迫的模式分析 | 第76-77页 |
5.3.4 ASR2-like和ASR3-like基因表达分析 | 第77-83页 |
5.3.5 基因应答机制网络构建 | 第83-86页 |
5.4 本章小结 | 第86-88页 |
第6章 全文结论及展望 | 第88-90页 |
6.1 结论 | 第88-89页 |
6.2 展望 | 第89-90页 |
参考文献 | 第90-100页 |
附录 | 第100-102页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第102-104页 |
致谢 | 第104-105页 |