中文摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第11-24页 |
1.1 UCP蛋白与衰老 | 第11-15页 |
1.1.1 线粒体和衰老的自由基理论 | 第11-12页 |
1.1.2 UCP的发展进程及其与自由基产率的相关性 | 第12-13页 |
1.1.3 线粒体解偶联与衰老相关疾病 | 第13-15页 |
1.2 实时荧光定量PCR研究及内参筛选 | 第15-19页 |
1.2.1 基因表达分析现状 | 第15-17页 |
1.2.2 内参基因概述 | 第17页 |
1.2.3 RT-qPCR | 第17-19页 |
1.3 转录组学 | 第19-24页 |
1.3.1 下一代测序技术(Next-generation sequencing,NGS) | 第19-20页 |
1.3.2 RNA测序概述 | 第20-21页 |
1.3.3 RNA测序工作流程 | 第21-24页 |
第二章 实验材料和方法 | 第24-39页 |
2.1 实验材料 | 第24-25页 |
2.1.1 细胞系 | 第24页 |
2.1.2 实验动物 | 第24页 |
2.1.3 化合物 | 第24-25页 |
2.2 主要实验试剂与仪器 | 第25-29页 |
2.2.1 实验试剂 | 第25-27页 |
2.2.2 实验所需的主要试剂盒 | 第27-28页 |
2.2.3 实验所需的主要仪器 | 第28-29页 |
2.3 实验方法 | 第29-39页 |
2.3.1 实验细胞复苏、冻存、传代培养及处理 | 第29页 |
2.3.2 不同年龄段大鼠组织的获得 | 第29-30页 |
2.3.3 不同年龄段大鼠的抗氧化水平检测 | 第30页 |
2.3.4 总RNA提取 | 第30-31页 |
2.3.5 总RNA质量检测 | 第31-32页 |
2.3.6 反转录cDNA | 第32-33页 |
2.3.7 定量PCR反应 | 第33-34页 |
2.3.8 WesternBlot检测蛋白表达 | 第34-36页 |
2.3.9 构建文库、纯化及测序 | 第36页 |
2.3.10 比对参考基因组 | 第36-37页 |
2.3.11 基因的表达水平分析 | 第37页 |
2.3.12 差异基因的表达分析 | 第37页 |
2.3.13 差异基因的功能注释 | 第37页 |
2.3.14 Pathway富集分析 | 第37-38页 |
2.3.15 数据分析 | 第38-39页 |
第三章 实验结果 | 第39-78页 |
3.1 不同处理后HL60细胞内参的筛选 | 第39-51页 |
3.1.1 琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性 | 第39页 |
3.1.2 RT-qPCR引物特异性 | 第39-41页 |
3.1.3 候选内参基因丰度的分析 | 第41-42页 |
3.1.4 不同处理后细胞的内参筛选 | 第42-50页 |
3.1.5 内参基因的选择对靶基因mRNA表达水平的影响 | 第50-51页 |
3.2 不同年龄段SD大鼠各组织内参基因的筛选 | 第51-66页 |
3.2.1 实验所用大鼠的基本情况 | 第51页 |
3.2.2 不同年龄段SD大鼠的抗氧化水平 | 第51-52页 |
3.2.3 琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性 | 第52-53页 |
3.2.4 RT-qPCR引物特异性 | 第53-57页 |
3.2.5 候选内参基因丰度的分析 | 第57页 |
3.2.6 大鼠各组织内参筛选 | 第57-66页 |
3.3 不同年龄段SD大鼠各组织中UCP的表达水平 | 第66-69页 |
3.3.1 UcpmRNA的表达 | 第66-67页 |
3.3.2 UCP蛋白的表达 | 第67-69页 |
3.4 2月龄和34月龄大鼠脑皮层转录组分析 | 第69-78页 |
3.4.1 转录组文库的构建和基因映射 | 第69-70页 |
3.4.2 重复性 | 第70-71页 |
3.4.3 转录本定量 | 第71-73页 |
3.4.4 Reads定位的不同区域情况 | 第73页 |
3.4.5 差异表达基因 | 第73-74页 |
3.4.6 转录组分析线粒体等相关基因的差异表达 | 第74-76页 |
3.4.7 GO功能注释与KEGG分析 | 第76-78页 |
第四章 讨论 | 第78-81页 |
4.1 选择合适的内参对于QRT-PCR结果具有重要影响 | 第78-79页 |
4.2 UCP表达水平与大鼠衰老之间相关性 | 第79-81页 |
第五章 结论 | 第81-83页 |
5.1 主要结论 | 第81页 |
5.2 实验展望 | 第81-83页 |
参考文献 | 第83-91页 |
在学期间的研究成果 | 第91-92页 |
致谢 | 第92页 |