中国地方山羊品种群体遗传结构和选择信号分析
| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第一章 引言 | 第9-17页 |
| 1.1 我国山羊品种资源概况 | 第9-10页 |
| 1.1.1 山羊的驯化 | 第9-10页 |
| 1.1.2 我国山羊遗传资源 | 第10页 |
| 1.2 山羊遗传多样性及群体结构研究进展 | 第10-13页 |
| 1.2.1 微卫星DNA标记 | 第11-12页 |
| 1.2.2 DNA芯片技术 | 第12页 |
| 1.2.3 全基因组重测序 | 第12-13页 |
| 1.3 山羊遗传资源保护进展 | 第13-15页 |
| 1.3.1 畜禽遗传资源保护的法律法规 | 第13页 |
| 1.3.2 资源保护体系 | 第13-14页 |
| 1.3.3 遗传资源保护技术方式 | 第14-15页 |
| 1.4 山羊经济性状研究进展 | 第15-16页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 第二章 中国地方山羊群体遗传结构分析 | 第17-29页 |
| 2.1 前言 | 第17页 |
| 2.2 材料与方法 | 第17-20页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第17-18页 |
| 2.2.2 试验方法 | 第18-19页 |
| 2.2.3 基因分型与质量控制 | 第19-20页 |
| 2.3 数据处理与分析 | 第20-21页 |
| 2.3.1 遗传多样性分析 | 第20页 |
| 2.3.2 PCA分析 | 第20页 |
| 2.3.3 NETVIEW分析 | 第20页 |
| 2.3.4 NJ树和STRUCTURE分析 | 第20-21页 |
| 2.4 结果 | 第21-25页 |
| 2.4.1 SNP质量控制结果 | 第21页 |
| 2.4.2 遗传多样性分析 | 第21页 |
| 2.4.3 群体遗传结构分析 | 第21-25页 |
| 2.5 讨论 | 第25-28页 |
| 2.5.1 山羊SNP芯片的质控 | 第25-26页 |
| 2.5.2 群体遗传结构和遗传多样性分析 | 第26-27页 |
| 2.5.3 保护对策 | 第27-28页 |
| 2.6 小结 | 第28-29页 |
| 第三章 山羊的全基因组选择信号检测 | 第29-38页 |
| 3.1 前言 | 第29页 |
| 3.2 材料和方法 | 第29-30页 |
| 3.2.1 试验材料 | 第29-30页 |
| 3.2.2 试验方法 | 第30页 |
| 3.2.3 基因分型与质量控制 | 第30页 |
| 3.3 选择信号检测与分析 | 第30页 |
| 3.4 基因注释 | 第30页 |
| 3.5 结果 | 第30-34页 |
| 3.5.1 样品和SNP质控结果 | 第30-31页 |
| 3.5.2 野生和家养山羊之间选择信号检测结果 | 第31-32页 |
| 3.5.3 高海拔与低海拔之间选择信号检测 | 第32-34页 |
| 3.5.4 中国14个地方品种的选择信号分析 | 第34页 |
| 3.6 讨论 | 第34-37页 |
| 3.6.1 选择信号检测 | 第34-36页 |
| 3.6.2 保护对策 | 第36-37页 |
| 3.7 小结 | 第37-38页 |
| 第四章 结论与研究展望 | 第38-39页 |
| 4.1 结论 | 第38页 |
| 4.2 研究展望 | 第38-39页 |
| 参考文献 | 第39-44页 |
| 在学期间的研究成果 | 第44-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
