| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| ABBREVIATIONS USED IN THIS STUDY | 第11-12页 |
| CHAPTERⅠ | 第12-42页 |
| 1.LITERATURE REVIEW | 第12-42页 |
| 1.1 SEED DORMANCY | 第12-13页 |
| 1.2 RELATIONSHIP BETWEEN SEED DORMANCY AND GERMINATION | 第13-15页 |
| 1.2.1 Parameters of germination assays | 第14页 |
| 1.2.2 Primary Dormancy and Secondary Dormancy | 第14-15页 |
| 1.3 CLASSIFICATION SYSTEM FOR SEED DORMANCY | 第15-18页 |
| 1.3.1 Physiological dormancy (PD) | 第15-16页 |
| 1.3.2 Morphological dormancy (MD) | 第16-17页 |
| 1.3.3 Morphophysiological dormancy (MPD) | 第17页 |
| 1.3.4 Physical Dormancy (PY) | 第17页 |
| 1.3.5 Combinational dormancy (PY+PD) | 第17-18页 |
| 1.4 SEED STRUCTURE AND SEED DORMANCY EVOLUTION | 第18-21页 |
| 1.5 HORMONAL CONTROL OF SEED DORMANCY | 第21-27页 |
| 1.5.1 Abscisic Acid (ABA) | 第22-24页 |
| 1.5.2 Gibbererellins (GA) | 第24页 |
| 1.5.3 Brassinosteroids (BR) | 第24-25页 |
| 1.5.4 Ethylene | 第25-26页 |
| 1.5.5 Nitrogen Containing compounds and Active Oxygen Species | 第26-27页 |
| 1.6 CONTROL OF DORMANCY AND GERMINATION BY ENVIRONMENT AND SEED COAT COMPONENTS | 第27-30页 |
| 1.6.1 Seed coat components | 第27-28页 |
| 1.6.2 Dormancy Release by After-Ripening (AR) | 第28-29页 |
| 1.6.3 Dormancy Control by Light and Temperature | 第29-30页 |
| 1.7 REGULATION OF SEED DORMANCY | 第30-34页 |
| 1.8 QTL ANALYSIS OF SEED DORMANCY IN RICE | 第34-36页 |
| 1.9 MARKER ASSISTED SELECTION FOR YIELD IMPROVEMENT IN RICE | 第36-38页 |
| 1.10 GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES (GWAS) IN RICE | 第38-42页 |
| CHAPTER Ⅱ GENOME-WIDE ASSOCIATION MAPPING REVEALED A DIVERSE GENETICBASIS OF SEED DORMANCY ACROSS SUBPOPULATIONS IN RICE (Oryza sativa L.) | 第42-76页 |
| 1. METHODS | 第43-52页 |
| 1.1 Plant materials and sequencing | 第43-45页 |
| 1.2 Collection of sequence data,sequence alignment and SNP identification | 第45-46页 |
| 1.3 SNP annotation | 第46页 |
| 1.4 QTL Imputing missing genotype using an LD-KNN algorithm | 第46-47页 |
| 1.5 Estimating the accuracy of genotyping and imputation and the sensitivity of SNPidentification | 第47页 |
| 1.6 Field Experiments | 第47-48页 |
| 1.7 Phenotype assessment for seed dormancy | 第48-49页 |
| 1.8 Statistical Analysis | 第49-50页 |
| 1.9 Association mapping | 第50-51页 |
| 1.10 Sdr4 and GA2ox3 Haplotype analysis | 第51-52页 |
| 2. RESULTS | 第52-69页 |
| 2.1 Phenotypic evaluations and heritability | 第52-57页 |
| 2.2 Association mapping in FHS | 第57-60页 |
| 2.3 Association mapping in ARS | 第60-64页 |
| 2.4 Genes and QTL around the putative peak positions | 第64-65页 |
| 2.5 Sdr4 haplotypes analysis | 第65-67页 |
| 2.6 GA2OX3 haplotypes analysis | 第67-69页 |
| 3. DISCUSSION | 第69-76页 |
| 3.1 Diverse genetic basis of seed dormancy in indica,japonica and Aus subpopulations | 第69-71页 |
| 3.2 Early and late detectable signals controlling seed dormancy | 第71-72页 |
| 3.3 Candidate genes for seed dormancy | 第72-74页 |
| 3.4 Sdr4 and GA2ox3 haplotypes for breeding pre-harvest sprouting resistance variety | 第74-76页 |
| CHAPTER Ⅲ MOLECULAR CLONING AND CHARACTERIZATION OF(OSDOG1),A RICE SEED DORMANCY CANDIDATE GENE | 第76-89页 |
| 1. METHODS | 第77-83页 |
| 1.1 Plant Materials | 第77页 |
| 1.2 DNA extraction | 第77-78页 |
| 1.3 RNA extraction | 第78页 |
| 1.4 Complementary DNA(cDNA)synthesis and RT-PCR | 第78-79页 |
| 1.5 Cloning of OsDOG1,OsDOG2 and OsDOG3 | 第79-80页 |
| 1.6 Transformation of OsDOG1 into Nipponbare | 第80页 |
| 1.7 Germination Testing | 第80-81页 |
| 1.8 ABA Measurements | 第81页 |
| 1.9 UFLC-ESI-MS/MS | 第81-82页 |
| 1.10 Gene expression analyses | 第82-83页 |
| 2. RESULTS AND DISCUSSION | 第83-89页 |
| 2.1 Germination Characteristics | 第83-85页 |
| 2.2 ABA quantification | 第85-86页 |
| 2.3 Genes involved in ABA Biosynthesis pathway | 第86-89页 |
| CONCLUSION | 第89-91页 |
| REFERENCES | 第91-111页 |
| ACKNOWLEDGEMENTS | 第111-113页 |
| PERSONAL INFORMATION | 第113页 |
| PUBLICATIONS | 第113-114页 |
| SCHOLARSHIP AWARDS | 第114页 |
