| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 前言 | 第12-23页 |
| 1.1 放线菌概述及研究意义 | 第12-13页 |
| 1.1.1 放线菌概述 | 第12-13页 |
| 1.1.2 放线菌研究的意义 | 第13页 |
| 1.2 南极地区放线菌研究概况及研究意义 | 第13-15页 |
| 1.2.1 南极及南极乔治王岛概述 | 第13-14页 |
| 1.2.2 极地放线菌研究概况 | 第14-15页 |
| 1.3 微生物多样性研究技术 | 第15-22页 |
| 1.3.1 传统的研究方法 | 第15-17页 |
| 1.3.2 分子生物学方法 | 第17-22页 |
| 1.4 本论文研究的目的及意义 | 第22-23页 |
| 第二章 DGGE技术分析南极乔治王岛陆地和潮间带放线菌多样性 | 第23-45页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 样品 | 第23-24页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-33页 |
| 2.2.1 样品总DNA的提取(强力土壤DNA提取试剂盒) | 第25-26页 |
| 2.2.2 放线菌门特异性引物扩增及纯化 | 第26-28页 |
| 2.2.3 V3高变区特异性引物扩增 | 第28-29页 |
| 2.2.4 DGGE电泳、切胶回收、扩增并克隆测序 | 第29-33页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第33-44页 |
| 2.3.1 引物的选择及阳性对照的设计 | 第33-34页 |
| 2.3.2 样品总DNA的提取 | 第34页 |
| 2.3.3 放线菌门特异性引物扩增 | 第34-35页 |
| 2.3.4 V3高变区特异性引物扩增 | 第35页 |
| 2.3.5 DGGE电泳、切胶回收、扩增并克隆测序 | 第35-36页 |
| 2.3.6 DGGE技术分析南极乔治王岛陆地和潮间带放线菌多样性 | 第36-43页 |
| 2.3.7 南极乔治王岛陆地和潮间带样品中放线菌多样性比较及分析 | 第43-44页 |
| 2.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第三章 16S rDNA文库技术分析南极乔治王岛陆地和潮间带放线菌多样性 | 第45-75页 |
| 3.1 实验材料 | 第45-47页 |
| 3.1.1 样品 | 第45-46页 |
| 3.1.2 主要试剂和仪器 | 第46-47页 |
| 3.2 实验方法 | 第47-50页 |
| 3.2.1 样品总DNA的提取 | 第47页 |
| 3.2.2 放线菌门特异性引物扩增及纯化 | 第47页 |
| 3.2.3 16S rDNA序列的克隆与测序 | 第47-48页 |
| 3.2.4 16S rDNA克隆文库的系统发育及多样性分析 | 第48-50页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第50-73页 |
| 3.3.1 样品总DNA的提取 | 第50页 |
| 3.3.2 放线菌门特异性引物扩增 | 第50-51页 |
| 3.3.3 16S rDNA克隆文库的构建及RFLP分析 | 第51-52页 |
| 3.3.4 16S rDNA克隆文库的多样性指数分析及稀有度曲线 | 第52-54页 |
| 3.3.5 16S rDNA克隆文库的多样性及系统发育分析 | 第54-72页 |
| 3.3.6 南极乔治王岛陆地和潮间带样品中放线菌多样性比较及分析 | 第72-73页 |
| 3.5 本章小结 | 第73-75页 |
| 第四章 纯培养技术分析南极乔治王岛陆地和潮间带放线菌多样性 | 第75-97页 |
| 4.1 实验材料 | 第75-79页 |
| 4.1.1 样品 | 第75-76页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第76-77页 |
| 4.1.3 培养基 | 第77-79页 |
| 4.1.4 主要引物 | 第79页 |
| 4.2 实验方法 | 第79-82页 |
| 4.2.1 放线菌的分离培养 | 第79-80页 |
| 4.2.2 菌株的纯化及保藏 | 第80页 |
| 4.2.3 放线菌菌株基因组DNA的提取 | 第80-81页 |
| 4.2.4 菌株16S rDNA的扩增 | 第81页 |
| 4.2.5 PCR扩增产物的纯化 | 第81-82页 |
| 4.2.6 序列的克隆及测序 | 第82页 |
| 4.3 实验结果 | 第82-91页 |
| 4.3.1 南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥样品放线菌的分离纯化 | 第82-86页 |
| 4.3.2 放线菌菌株基因组DNA的提取 | 第86页 |
| 4.3.3 南极乔治王岛陆地和潮间带放线菌菌株16S rDNA的扩增 | 第86-87页 |
| 4.3.4 南极乔治王岛陆地土壤和潮间带底泥样品中放线菌菌株多样性分析 | 第87-89页 |
| 4.3.5 16S rDNA系统发育树的构建与分析 | 第89-91页 |
| 4.4 免培养与纯培养分析放线菌多样性比较 | 第91-96页 |
| 4.5 本章小结 | 第96-97页 |
| 论文总结 | 第97-100页 |
| 研究展望 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 个人简历 | 第108-109页 |
| 发表的学术论文 | 第109页 |
