| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-18页 |
| 1 微生物的多样性及其分类 | 第11-12页 |
| 2 微生物全基因组测序 | 第12-13页 |
| 3 重金属及抗生素污染现状 | 第13-15页 |
| 3.1 重金属污染现状 | 第13-14页 |
| 3.2 抗生素污染现状 | 第14-15页 |
| 4 农研丝杆菌属Niastella | 第15-17页 |
| 5 研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第18-39页 |
| 1 实验材料 | 第18-19页 |
| 1.1 实验样品 | 第18页 |
| 1.2 培养基 | 第18页 |
| 1.3 实验菌株 | 第18-19页 |
| 2 实验方法 | 第19-39页 |
| 2.1 土样中细菌的分离、纯化及分类地位的初步鉴定 | 第19-21页 |
| 2.1.1 土壤理化性质的检测 | 第19-20页 |
| 2.1.2 菌种的分离和纯化 | 第20-21页 |
| 2.2 乡村农研丝杆菌Niastella vici DJ57~T多相分类学鉴定 | 第21-39页 |
| 2.2.1 菌株DJ57~T的基因型特征 | 第21-24页 |
| 2.2.2 菌株DJ57~T的表型特征 | 第24-37页 |
| 2.2.3 菌株DJ57~T的化学分类学特征 | 第37-39页 |
| 第三章 结果与分析 | 第39-70页 |
| 1 临湘铅锌矿土壤样品中细菌的分离与鉴定 | 第39-41页 |
| 1.1 土壤理化性质的测定 | 第39页 |
| 1.2 土壤中菌株的分离与纯化 | 第39-41页 |
| 2 乡村农研丝杆菌DJ57~T的基因型特征 | 第41-52页 |
| 2.1 16S rRNA基因序列及其比对分析及系统发育分析 | 第41-45页 |
| 2.2 菌株DJ57~T全基因组测序结果 | 第45-52页 |
| 2.2.1 全基因组测序基本信息 | 第45-46页 |
| 2.2.2 全基因组注释结果及菌株DJ57~T与参考菌株的比较基因组分析 | 第46-49页 |
| 2.2.3 基于核心蛋白构建系统进化树 | 第49-52页 |
| 2.3 DNA G+C含量的测定 | 第52页 |
| 3 表型特征 | 第52-66页 |
| 3.1 形态学特征 | 第52-56页 |
| 3.2 生长特征 | 第56-57页 |
| 3.3 生理生化特性 | 第57-66页 |
| 3.3.1 菌株DJ57~T生理生化特征总述 | 第57-58页 |
| 3.3.2 菌株DJ57~T和参考菌株对胶体几丁质的水解及其相关基因 | 第58-59页 |
| 3.3.3 菌株DJ57~T和参考菌株对抗生素的敏感性及其相关基因 | 第59-62页 |
| 3.3.4 菌株DJ57~T和参考菌株对重金属抗性及其相关基因 | 第62-64页 |
| 3.3.5 菌株DJ57~T和参考菌株酶活性的差别 | 第64-66页 |
| 4 化学特征 | 第66-68页 |
| 4.1 菌株DJ57~T的呼吸醌检测 | 第66-67页 |
| 4.2 菌株DJ57~T和参考菌株全细胞脂肪酸的检测 | 第67-68页 |
| 4.3 菌株DJ57~T和菌株Niastella populi 208~T极性脂的检测 | 第68页 |
| 5 总结 | 第68-70页 |
| 第四章 结论与分析 | 第70-73页 |
| 1 对乡村农研丝杆菌Niastella vici DJ57~T的描述 | 第70-71页 |
| 2 菌株DJ57~T基因组测序及其比较基因组学分析 | 第71-72页 |
| 3 展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-81页 |
| 附录 | 第81-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
