| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-14页 |
| 1.1.1 生物通路 | 第12-13页 |
| 1.1.2 生物通路数据库 | 第13-14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-17页 |
| 1.2.1 生物通路可视化 | 第14-16页 |
| 1.2.2 生物通路可视化工具 | 第16-17页 |
| 1.3 PATHBUBBLES 系统开发的必要性 | 第17-19页 |
| 1.4 本文工作与论文组织 | 第19-20页 |
| 第二章 PATHBUBBLES 系统设计 | 第20-30页 |
| 2.1 生物数据分析 | 第20-21页 |
| 2.2 需求分析 | 第21-22页 |
| 2.3 PATHBUBBLES 系统整体设计 | 第22-29页 |
| 2.3.1 PathBubbles 气泡隐喻界面的设计思想 | 第22-24页 |
| 2.3.2 PathBubbles Javascript 库的设计 | 第24-27页 |
| 2.3.3 PathBubbles 生物通路功能模块设计 | 第27-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 PATHBUBBLES 系统实现 | 第30-47页 |
| 3.1 相关技术介绍 | 第30-31页 |
| 3.2 界面设计的实现 | 第31-34页 |
| 3.2.1 虚拟桌面的实现 | 第31-32页 |
| 3.2.2 Bubble 之间交互算法的实现 | 第32-34页 |
| 3.3 功能模块的可视化实现 | 第34-43页 |
| 3.3.1 生物通路图可视化气泡 | 第34-38页 |
| 3.3.2 Sunburst 可视化气泡以及交互式表格气泡 | 第38-43页 |
| 3.4 专家评估 | 第43-46页 |
| 3.4.1 可视化的有效性 | 第43-44页 |
| 3.4.2 系统交互设计的有效性 | 第44-45页 |
| 3.4.3 用户体验的总结 | 第45页 |
| 3.4.4 PathBubbles 系统可扩展性的建议 | 第45-46页 |
| 3.5 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 在线排列和编辑生物通路图 | 第47-53页 |
| 4.1 设计思想 | 第47-48页 |
| 4.2 文档设计 | 第48-50页 |
| 4.2.1 生物通路图排列标准 | 第48-49页 |
| 4.2.2 排列生物通路图的一些指导准则 | 第49-50页 |
| 4.3 界面和交互设计 | 第50-52页 |
| 4.3.1 界面设计 | 第50-52页 |
| 4.3.2 交互设计 | 第52页 |
| 4.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 第五章 总结与展望 | 第53-56页 |
| 5.1 工作内容总结 | 第53-54页 |
| 5.2 进一步工作的展望 | 第54-56页 |
| 致谢 | 第56-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 附录 | 第64-65页 |
| 详细摘要 | 第65-67页 |
