摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
引言 | 第13-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-22页 |
1.1 斑节对虾及其遗传育种研究进展 | 第15-17页 |
1.1.1 斑节对虾简介 | 第15-16页 |
1.1.2 斑节对虾遗传育种研究进展 | 第16-17页 |
1.2 分子遗传标记在水产动物遗传育种中的应用 | 第17-19页 |
1.2.1 水产动物中的DNA标记种类 | 第17页 |
1.2.2 单核苷酸多态性(SNP) | 第17-18页 |
1.2.3 SNP在水产动物遗传育种中的应用 | 第18-19页 |
1.3 候选基因的研究进展 | 第19-22页 |
1.3.1 候选基因法 | 第19-20页 |
1.3.2 生长性状候选基因研究进展 | 第20-22页 |
第二章 斑节对虾CATL基因克隆、表达分析及与生长性状相关的SNP筛查 | 第22-57页 |
2.1 Pm Cat L基因的克隆和表达分析 | 第23-44页 |
2.1.1 实验材料 | 第23-26页 |
2.1.1.1 实验动物 | 第23页 |
2.1.1.2 实验试剂和试剂盒 | 第23-24页 |
2.1.1.3 实验配制试剂 | 第24-25页 |
2.1.1.4 实验用品预处理 | 第25页 |
2.1.1.5 实验主要仪器设备 | 第25-26页 |
2.1.2 实验方法 | 第26-34页 |
2.1.2.1 Pm Cat L基因的克隆 | 第26-27页 |
2.1.2.2 斑节对虾总RNA提取及检测 | 第27-28页 |
2.1.2.3 c DNA第一链的合成 | 第28页 |
2.1.2.4 获取c DNA全长 | 第28-32页 |
2.1.2.5 斑节对虾Cat L的生物信息学分析 | 第32-33页 |
2.1.2.6 Pm Cat L基因m RNA表达分析 | 第33-34页 |
2.1.2.7 统计学分析 | 第34页 |
2.1.3 结果 | 第34-42页 |
2.1.3.1 总RNA抽提及检测 | 第34-35页 |
2.1.3.2 RACE扩增PCR产物结果 | 第35页 |
2.1.3.3 斑节对虾Pm Cat L基因c DNA序列分析 | 第35-37页 |
2.1.3.4 斑节对虾Pm Cat L同源性分析 | 第37-40页 |
2.1.3.5 斑节对虾Pm Cat L基因表达特征分析 | 第40-42页 |
2.1.4 讨论 | 第42-44页 |
2.2 Pm Cat L基因SNPs的筛选及与生长性状的关联性分析 | 第44-57页 |
2.2.1 实验材料 | 第44-45页 |
2.2.2 实验方法 | 第45-50页 |
2.2.2.1 基因组DNA提取 | 第45-46页 |
2.2.2.2 目的基因候选SNP位点的获得 | 第46-47页 |
2.2.2.3 候选SNP位点分型检测 | 第47-49页 |
2.2.2.4 候选SNP位点与生长性状相关性分析 | 第49-50页 |
2.2.3 结果 | 第50-56页 |
2.2.3.1 SNP位点的筛查 | 第50-53页 |
2.2.3.2 SNP位点与生长性状相关性分析 | 第53-56页 |
2.2.4 讨论 | 第56-57页 |
第三章 斑节对虾TRY基因克隆、表达分析及与生长性状相关SNP的筛查 | 第57-72页 |
3.1 Pm Try基因的克隆和表达分析 | 第58-67页 |
3.1.1 实验材料 | 第58页 |
3.1.2 实验方法 | 第58-59页 |
3.1.3 结果 | 第59-65页 |
3.1.3.1 斑节对虾Pm Try序列分析 | 第59-60页 |
3.1.3.2 斑节对虾与其他动物TRY同源性分析 | 第60-63页 |
3.1.3.3 斑节对虾Pm Try基因表达特征分析 | 第63-65页 |
3.1.4 讨论 | 第65-67页 |
3.2 Pm Try基因SNP的筛选及与生长性状的关联性分析 | 第67-72页 |
3.2.1 实验材料 | 第67页 |
3.2.2 实验方法 | 第67页 |
3.2.3 结果 | 第67-71页 |
3.2.3.1 Pm Try基因SNP位点的筛查 | 第67-69页 |
3.2.3.2 候选SNP位点基因型与生长性状相关性分析 | 第69-71页 |
3.2.4 讨论 | 第71-72页 |
第四章 斑节对虾AMY基因的克隆、表达分析及其SNP的筛查 | 第72-85页 |
4.1 Pm Amy基因的克隆和表达分析 | 第73-83页 |
4.1.1 实验材料 | 第73页 |
4.1.2 实验方法 | 第73页 |
4.1.3 结果 | 第73-81页 |
4.1.3.1 斑节对虾Pm Amy序列分析 | 第73-76页 |
4.1.3.2 斑节对虾与其他动物AMY同源性分析 | 第76-79页 |
4.1.3.3 斑节对虾Pm Amy基因表达特征分析 | 第79-81页 |
4.1.4 讨论 | 第81-83页 |
4.2 Pm Amy基因SNP位点的筛查 | 第83-85页 |
4.2.1 实验材料 | 第83页 |
4.2.2 实验方法 | 第83页 |
4.2.3 结果 | 第83页 |
4.2.3.1 Pm Amy基因SNPs位点 | 第83页 |
4.2.4 讨论 | 第83-85页 |
总结 | 第85-86页 |
参考文献 | 第86-93页 |
附录 | 第93-94页 |
攻读学位期间发表的论文目录和参加的会议 | 第94-95页 |
致谢 | 第95页 |