| 摘要 | 第12-16页 |
| Abstract | 第16-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第21-31页 |
| 1.1 天然彩色棉的现状 | 第21-22页 |
| 1.1.1 彩色棉的产业重要地位和意义 | 第21页 |
| 1.1.2 彩色棉产业的发展和制约因素 | 第21-22页 |
| 1.2 棕色棉的遗传定位及色素成分鉴定 | 第22-24页 |
| 1.2.1 棕色棉的遗传控制 | 第22页 |
| 1.2.2 棕色棉纤维基因Lc_1遗传定位 | 第22-23页 |
| 1.2.3 棕色棉纤维颜色与品质关系及纤维色素鉴定 | 第23-24页 |
| 1.3 原花色素的合成与调控 | 第24-28页 |
| 1.3.1 原花色素的单体与合成 | 第24-26页 |
| 1.3.2 原花色素的调控 | 第26-28页 |
| 1.4 bHLH的功能和分类研究进展 | 第28-31页 |
| 1.4.1 bHLH的相关功能研究 | 第28-29页 |
| 1.4.2 bHLH的分类与鉴定 | 第29-31页 |
| 第二章 引言 | 第31-35页 |
| 2.1 研究意义及立题依据 | 第31-33页 |
| 2.2 技术路线 | 第33-35页 |
| 第三章 棉花TT2同源基因的克隆、转基因功能验证和表达分析 | 第35-51页 |
| 3.1 材料 | 第35-37页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第35页 |
| 3.1.2 菌株和载体 | 第35页 |
| 3.1.3 主要药品试剂 | 第35-36页 |
| 3.1.4 主要仪器设备 | 第36页 |
| 3.1.5 主要试剂和缓冲液配方 | 第36页 |
| 3.1.6 主要培养基配方 | 第36-37页 |
| 3.2 方法 | 第37-41页 |
| 3.2.1 DNA提取 | 第37页 |
| 3.2.2 RNA提取、c DNA合成 | 第37页 |
| 3.2.3 棉花TT2同源序列的鉴定、扩增及进化分析 | 第37-38页 |
| 3.2.4 DNA片段的酶切、回收、连接、测序 | 第38页 |
| 3.2.5 定量qRT-PCR分析 | 第38-39页 |
| 3.2.6 载体构建 | 第39-40页 |
| 3.2.7 棉花的遗传转化 | 第40-41页 |
| 3.3 结果分析 | 第41-49页 |
| 3.3.1 棉花TT2同源基因的克隆 | 第41-44页 |
| 3.3.2 陆地棉GhTT2同源基因的功能验证 | 第44-45页 |
| 3.3.3 陆地棉GhTT2同源基因的表达分析 | 第45-48页 |
| 3.3.4 GhTT2同源基因在RIL群体的白色纤维和棕色纤维中的表达 | 第48-49页 |
| 3.5 小结 | 第49-51页 |
| 第四章 棕色纤维基因Lc_1的精细定位 | 第51-63页 |
| 4.1 材料 | 第51-52页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第51页 |
| 4.1.2 主要药品试剂 | 第51页 |
| 4.1.3 主要仪器设备 | 第51页 |
| 4.1.4 主要缓冲液配方 | 第51-52页 |
| 4.2 方法 | 第52-55页 |
| 4.2.1 Lc_1遗传群体构建与表型统计 | 第52页 |
| 4.2.2 GhTT2-3A连锁的SSR和SNP标记引物的获得 | 第52-53页 |
| 4.2.3 SSR和SNP标记引物的反应体系与PCR扩增 | 第53页 |
| 4.2.4 SSR引物的PCR产物的电泳及显色 | 第53-54页 |
| 4.2.5 遗传连锁图谱构建 | 第54-55页 |
| 4.3 结果分析 | 第55-61页 |
| 4.3.1 GhTT2-3A-BAC的筛选、测序、分析 | 第55-56页 |
| 4.3.2 GhTT2-3A和Lc_1连锁标记的筛选 | 第56-58页 |
| 4.3.3 Lc_1和GhTT2-3A在RIL和F2代群体中遗传图谱的构建 | 第58-61页 |
| 4.4 小结 | 第61-63页 |
| 第五章 GhTT2-3A的功能分析 | 第63-87页 |
| 5.1 材料 | 第63-65页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第63页 |
| 5.1.2 载体和菌株 | 第63-64页 |
| 5.1.3 主要药品和试剂 | 第64页 |
| 5.1.4 主要仪器设备 | 第64页 |
| 5.1.5 主要试剂、缓冲液及培养基配方 | 第64-65页 |
| 5.2 方法 | 第65-67页 |
| 5.2.1 GhTT2-3A纤维特异表达载体的构建 | 第65页 |
| 5.2.2 棉花的遗传转化 | 第65页 |
| 5.2.3 转基因棉花的鉴定 | 第65-66页 |
| 5.2.4 Southern blot分析 | 第66-67页 |
| 5.2.5 Fb LA2::GhTT2-3A转基因材料的数字表达谱分析 | 第67页 |
| 5.3 结果与分析 | 第67-85页 |
| 5.3.1 纤维中特异启动GhTT2-3A的转基因材料的获得与筛选 | 第67-69页 |
| 5.3.2 35S::GhTT2-3A和E6::GhTT2-3A转基因材料的分析 | 第69-70页 |
| 5.3.3 Fb L2A::GhTT-3A转基因棉花的分子鉴定及表型分析 | 第70-73页 |
| 5.3.4 GhTT2-3A在纤维发育中的表达与成熟纤维呈色的关系 | 第73-75页 |
| 5.3.5 Fb L2A::GhTT2-3A转基因棉花 22DPA纤维的基因数字表达谱比较分析 | 第75-81页 |
| 5.3.6 Fb L2A:: GhTT2-3A转基因棉花的衣分统计 | 第81页 |
| 5.3.7 Fb L2A::GhTT2-3A转基因棉花纤维品质分析 | 第81-85页 |
| 5.4 小结 | 第85-87页 |
| 第六章 棉花TT8同源基因的鉴定、克隆及在PA合成中的调控作用 | 第87-103页 |
| 6.1 材料 | 第87-88页 |
| 6.1.1 植物材料 | 第87页 |
| 6.1.2 载体和菌株 | 第87页 |
| 6.1.3 主要药品试剂 | 第87页 |
| 6.1.4 主要仪器设备 | 第87页 |
| 6.1.5 主要缓冲液配方 | 第87-88页 |
| 6.2 方法 | 第88-92页 |
| 6.2.1 棉花bHLH的序列来源 | 第88页 |
| 6.2.2 bHLH蛋白和相关的bHLH结构域的鉴定 | 第88-89页 |
| 6.2.3 棉花bHLHs的进化分析和分类 | 第89页 |
| 6.2.4 棉花S5a和S5b亚家族bHLH基因的克隆和序列分析 | 第89-90页 |
| 6.2.5 烟草瞬时表达 | 第90-92页 |
| 6.3 结果与分析 | 第92-100页 |
| 6.3.1 棉花基因组中bHLH基因的鉴定 | 第92-94页 |
| 6.3.2 棉花bHLH家族的进化分析和分类 | 第94页 |
| 6.3.3 四倍体棉花中S5a和S5b亚家族的bHLH的克隆和序列分析 | 第94-99页 |
| 6.3.4 GhTT-3A和GhbHLH110A协同激活PA合成途径 | 第99-100页 |
| 6.4 小结 | 第100-103页 |
| 第七章 讨论 | 第103-113页 |
| 7.1 陆地棉中有5对R2R3-MYB家族的GhTT2同源蛋白 | 第103-104页 |
| 7.2 GhTT2同源基因的表达模式在棉花各组织中不同 | 第104-105页 |
| 7.3 GhTT2-3A是棕色纤维基因Lc_1的候选基因 | 第105-106页 |
| 7.4 GhTT2-3A促进PA在纤维中合成和积累 | 第106-107页 |
| 7.5 GhTT2-3A和bHLH在棉花PA合成途径中的调控作用 | 第107-109页 |
| 7.6 PA影响转基因纤维产量和品质 | 第109页 |
| 7.7 bHLH的鉴定分类和进化分析 | 第109-113页 |
| 第八章 主要结论和创新点及后续工作展望 | 第113-115页 |
| 8.1 主要结论 | 第113页 |
| 8.2 创新点 | 第113页 |
| 8.3 后续工作展望 | 第113-115页 |
| 参考文献 | 第115-123页 |
| 附录 | 第123-159页 |
| 附录一 缩略词 | 第123-124页 |
| 附录二 GhTT2-1D～5D的载体构建流程 | 第124-125页 |
| 附录三 棉花PA合成途径RT-RCR引物 | 第125页 |
| 附录四 来自其它植物中用于进化分析的bHLH蛋白 | 第125-134页 |
| 附录五 搜索bHLH蛋白网址 | 第134页 |
| 附录六 bHLH探针序列 | 第134-136页 |
| 附录七 棉花bHLH的相关编码序列在不同来源中的对应序列 | 第136-148页 |
| 附录八 拟南芥、可可和棉花的bHLH的进化分类、保守区域和已知生物学功能注释 | 第148-157页 |
| 附录九 参研课题 | 第157页 |
| 附录十 博士期间发表论文 | 第157-159页 |
| 致谢 | 第159-160页 |
