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2型糖尿病GWAS关联SNP对miRNA-mRNA互作的影响分析

摘要第6-7页
Abstract第7页
1 绪论第10-22页
    1.1 2型糖尿病的遗传学第10-15页
        1.1.1 2型糖尿病概述第10-11页
        1.1.2 2型糖尿病的遗传学研究第11-14页
        1.1.3 T2D GWAS关联SNP第14-15页
    1.2 miRNA第15-18页
        1.2.1 miRNA概述第15页
        1.2.2 miRNA靶基因的预测方法第15-17页
        1.2.3 SNP影响miRNA-mRNA互作的计算分析第17-18页
    1.3 SLC30A8基因第18-21页
        1.3.1 SLC30A8基因的结构和功能第18-20页
        1.3.2 SLC30A8基因及其SNP与2型糖尿病第20-21页
    1.4 本研究的目的与意义第21-22页
2 材料与方法第22-33页
    2.1 T2D GWAS关联SNP对miRNA-mRNA互作影响的计算分析第22-24页
        2.1.1 T2D GWAS关联SNP及其连锁SNP第22页
        2.1.2 计算分析方法第22-24页
    2.2 预测结果的实验验证第24-33页
        2.2.1 实验设备第24页
        2.2.2 实验试剂第24-26页
        2.2.3 DH5α大肠杆菌感受态细胞的制备第26-27页
        2.2.4 3'UTR重组载体的构建第27-29页
        2.2.5 miRNA表达载体的构建第29-32页
        2.2.6 细胞转染第32页
        2.2.7 双荧光素酶报告基因检测第32-33页
3 结果与分析第33-52页
    3.1 T2D GWAS关联SNP及其连锁SNP第33-34页
    3.2 T2D GWAS关联SNP及其连锁SNP对miRNA-mRNA互作的影响第34-39页
    3.3 T2D GWAS关联基因与miRNA的相互作用第39-44页
        3.3.1 T2D GWAS关联基因的蛋白质互作网络图第39-40页
        3.3.2 T2D GWAS关联hub基因与miRNA的相互作用第40-44页
    3.4 实验验证SNP对miRNA结合的影响第44-52页
        3.4.1 重组载体构建结果第44页
        3.4.2 调控SLC30A8的天然miRNA第44-45页
        3.4.3 RHO rs6426514 SNP等位基因转录丰度差异第45-46页
        3.4.4 SLC30A8 rs11558471与miR-1205/3074/3667第46-48页
        3.4.5 SLC30A8 rs2466293与miR-181a第48-49页
        3.4.6 SLC30A8 rs113040697与miR-134/758/3122/3193第49-52页
4 讨论第52-55页
    4.1 SNP对miRNA-mRNA互作的影响第52-53页
    4.2 调控T2D GWAS关联基因的miRNA第53-55页
5 结论与展望第55-56页
参考文献第56-68页
攻读学位期间发表的学术论文第68-69页
致谢第69-70页
附录第70-84页

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