| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词 | 第15-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-34页 |
| 1.1 引言 | 第17-20页 |
| 1.2 碳水化合物活性酶的研究进展 | 第20-22页 |
| 1.2.1 糖苷水解酶 | 第20-21页 |
| 1.2.2 糖苷转移酶 | 第21页 |
| 1.2.3 多糖裂解酶 | 第21页 |
| 1.2.4 碳水化合物酯酶 | 第21页 |
| 1.2.5 辅助氧化还原酶 | 第21-22页 |
| 1.2.6 碳水化合物结合域 | 第22页 |
| 1.3 极端微生物的研究概况 | 第22-27页 |
| 1.3.1 耐高温真菌 | 第23-24页 |
| 1.3.2 耐低温真菌 | 第24-25页 |
| 1.3.3 高温酶、中温酶和低温酶的比较 | 第25-27页 |
| 1.4 真菌新兴组学的研究概况 | 第27-30页 |
| 1.4.1 全基因组测序技术 | 第27页 |
| 1.4.2 基因组学 | 第27-28页 |
| 1.4.3 转录组学 | 第28-29页 |
| 1.4.4 蛋白质组学和分泌组学 | 第29页 |
| 1.4.5 代谢组学 | 第29-30页 |
| 1.5 木聚糖降解酶的研究进展 | 第30-32页 |
| 1.5.1 木聚糖降解酶的分类 | 第30-31页 |
| 1.5.2 第10家族木聚糖酶 | 第31页 |
| 1.5.3 第11家族木聚糖酶 | 第31页 |
| 1.5.4 第43家族木糖苷酶 | 第31页 |
| 1.5.5 木聚糖降解酶的应用 | 第31-32页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 1.7 技术路线 | 第33-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-63页 |
| 2.1 材料 | 第34-38页 |
| 2.1.1 培养基 | 第34-35页 |
| 2.1.2 菌株与质粒 | 第35-36页 |
| 2.1.3 底物和标准样品 | 第36页 |
| 2.1.4 生化试剂、试剂盒和工具酶 | 第36页 |
| 2.1.5 实验仪器 | 第36-37页 |
| 2.1.6 溶液 | 第37页 |
| 2.1.7 下载参考基因组 | 第37-38页 |
| 2.2 方法 | 第38-63页 |
| 2.2.1 土样的采集 | 第38页 |
| 2.2.2 菌株的分离与纯化 | 第38-39页 |
| 2.2.3 形态观察 | 第39页 |
| 2.2.4 生长温度测定 | 第39-40页 |
| 2.2.5 木质纤维素降解能力的测定 | 第40-41页 |
| 2.2.6 DNA的提取与检测 | 第41-42页 |
| 2.2.7 枝孢菌系统进化分析 | 第42-43页 |
| 2.2.8 基因组文库构建以及测序 | 第43-44页 |
| 2.2.9 生物信息学分析 | 第44-47页 |
| 2.2.10 枝孢菌SL-16木聚糖降解酶系各基因的表达水平分析 | 第47-52页 |
| 2.2.11 枝孢菌SL-16高表达木聚糖降解酶基因xyn10A、xyn11A和xyl43A的克隆 | 第52页 |
| 2.2.12 枝孢菌SL-16木聚糖基因xyn10A、xyn11A和xyl43A的异源表达 | 第52-54页 |
| 2.2.13 枝孢菌SL-16重组酶Xyn10A、Xyn11A和Xyl43A的纯化以及蛋白定量 | 第54页 |
| 2.2.14 枝孢菌SL-16重组酶Xyn10A、Xyn11A和Xyl43A的酶学性质分析 | 第54-56页 |
| 2.2.15 枝孢菌SL-16重组Xyn10A、Xyn11A和Xyl43A的共同作用 | 第56-57页 |
| 2.2.16 枝孢菌SL-16的Xyn10A、Xyn11A和Xyl43A适温机制分析 | 第57页 |
| 2.2.17 M.thermophilus的GH11木聚糖酶基因的克隆 | 第57-59页 |
| 2.2.18 M.thermophilus的GH11木聚糖酶基因的异源表达 | 第59-60页 |
| 2.2.19 M.thermophilus的重组木聚糖酶的纯化和脱糖基处理 | 第60-61页 |
| 2.2.20 M.thermophilus的重组木聚糖酶的酶学性质分析 | 第61-62页 |
| 2.2.21 M.thermophilus的重组木聚糖酶水解产物为碳源的乳酸菌发酵试验 | 第62-63页 |
| 第三章 枝孢菌的分离与鉴定 | 第63-91页 |
| 3.1 引言 | 第63页 |
| 3.2 材料与方法 | 第63-64页 |
| 3.3 结果与分析 | 第64-89页 |
| 3.3.1 菌株鉴定及保藏 | 第64页 |
| 3.3.2 序列分析 | 第64-70页 |
| 3.3.3 系统进化分析 | 第70-73页 |
| 3.3.4 枝孢菌新种 | 第73-86页 |
| 3.3.5 其他枝孢菌 | 第86-89页 |
| 3.4 讨论 | 第89-91页 |
| 第四章 嗜/耐冷枝孢菌C.tianshanense SL-14和C.neopsychrotoleransSL-16的比较基因组学研究 | 第91-109页 |
| 4.1 引言 | 第91页 |
| 4.2 材料与方法 | 第91-92页 |
| 4.3 结果与分析 | 第92-108页 |
| 4.3.1 枝孢菌降解木质纤维素能力的比较 | 第92页 |
| 4.3.2 DNA质量检测 | 第92-93页 |
| 4.3.3 枝孢菌测序结果 | 第93-94页 |
| 4.3.4 基因结构及功能注释 | 第94-108页 |
| 4.4 讨论 | 第108-109页 |
| 第五章 低温枝孢菌C.neopsychrotolerans SL-16来源的木聚糖降解酶系的研究 | 第109-124页 |
| 5.1 引言 | 第109页 |
| 5.2 材料与方法 | 第109-110页 |
| 5.3 结果与分析 | 第110-122页 |
| 5.3.1 木聚糖降解酶系的序列分析 | 第110页 |
| 5.3.2 各木聚糖降解酶系基因的表达水平分析 | 第110-112页 |
| 5.3.3 重组酶的表达纯化 | 第112页 |
| 5.3.4 重组酶的酶学性质分析 | 第112-117页 |
| 5.3.5 Xyn10A、Xyn11A和Xyl43A的协同作用 | 第117-119页 |
| 5.3.6 适温机制分析 | 第119-122页 |
| 5.4 讨论 | 第122-124页 |
| 第六章 嗜热真菌M.thermophilus来源的GH11家族木聚糖酶的基因克隆、异源表达及功能验证 | 第124-135页 |
| 6.1 引言 | 第124页 |
| 6.2 材料与方法 | 第124页 |
| 6.3 结果与分析 | 第124-134页 |
| 6.3.1 M.thermophilus CGMCC3.18119产木聚糖酶的能力 | 第124-125页 |
| 6.3.2 GH11木聚糖酶编码基因的序列分析 | 第125-126页 |
| 6.3.3 毕氏酵母异源表达 | 第126-127页 |
| 6.3.4 酶学性质分析 | 第127-131页 |
| 6.3.5 木寡糖发酵实验 | 第131-134页 |
| 6.4 讨论 | 第134-135页 |
| 第七章 全文结论 | 第135-136页 |
| 7.1 结论 | 第135页 |
| 7.2 创新点 | 第135-136页 |
| 参考文献 | 第136-157页 |
| 致谢 | 第157-158页 |
| 个人简历 | 第158页 |
