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莫荷罗非鱼“广福1号”及其亲本基因组DNA的甲基化分析

摘要第4-6页
abstract第6-8页
引言第11-17页
    1 罗非鱼简介第11-12页
        1.1 罗非鱼概况第11页
        1.2 莫荷罗非鱼“广福1号”第11-12页
    2 表观遗传学第12-14页
        2.1 DNA甲基化第12页
        2.2 甲基化分子机制第12-13页
        2.3 DNA甲基化的生物学作用第13页
        2.4 DNA甲基化在水产动物的研究进展第13-14页
    3 DNA甲基化的研究技术第14-16页
        3.1 全基因组水平的DNA甲基化检测第14-15页
        3.2 特异位点水平的DNA甲基化检测第15-16页
        3.3 甲基化新位点的寻找第16页
    4 本研究的目的与意义第16-17页
第一章 莫荷罗非鱼“广福1号”与其亲本间DNA甲基化的差异分析第17-33页
    1 材料与方法第17-22页
        1.1 实验材料第17页
        1.2 实验仪器和试剂第17-18页
        1.3 提取基因组DNA第18页
        1.4 甲基化扩增敏感多态性(MSAP)分析第18-21页
        1.5 MSAP数据统计与分析第21页
        1.6 甲基化特异性条带的回收、克隆和测序第21-22页
    2 结果第22-29页
        2.1 MSAP带型分析第22-23页
        2.2 不同组织间DNA甲基化水平差异分析第23-24页
        2.3 亲子代罗非鱼相同组织间DNA甲基化水平差异分析第24页
        2.4 亲、子代罗非鱼甲基化模式的变化第24-25页
        2.5 甲基化特异性片段序列分析第25-29页
    3 讨论第29-33页
第二章 莫荷罗非鱼“广福1号”及其亲本prkaca基因的克隆和组织表达分析第33-48页
    1 材料与方法第33-37页
        1.1 实验鱼第33页
        1.2 实验仪器和试剂第33-34页
        1.3 实验用水第34页
        1.4 实验方法第34-37页
    2 结果第37-45页
        2.1 prkaca基因cDNA克隆和序列分析第37-40页
        2.2 同源比较和系统进化树分析第40-41页
        2.3 prkaca基因在橙色莫桑比克罗非鱼和荷那龙罗非鱼不同组织中的表达分析第41-42页
        2.4 盐碱胁迫下亲、子代罗非鱼和尼罗罗非鱼prkaca基因的表达分析第42-45页
    3 讨论第45-48页
第三章 莫荷罗非鱼“广福1号”prkaca基因DNA甲基化水平分析第48-62页
    1 材料与方法第48-52页
        1.1 实验材料第48页
        1.2 实验仪器与试剂第48页
        1.3 基因组DNA提取第48-49页
        1.4 基因组DNA序列克隆及序列分析第49页
        1.5 重亚硫酸盐处理第49-51页
        1.6 CpG岛预测和BSP引物设计第51页
        1.7 BSP扩增第51页
        1.8 测序结果分析第51-52页
    2 结果第52-59页
        2.1 莫荷罗非鱼“广福1号”prkaca基因组DNA克隆及分析第52页
        2.2 prkaca基因组DNA的CpG岛预测及引物设计第52-54页
        2.3 BSP反应的PCR产物扩增结果第54-55页
        2.4 莫荷罗非鱼“广福1号”盐碱胁迫下的BSP分析第55-58页
        2.5 莫荷罗非鱼“广福1号”与亲本间的BSP分析第58-59页
    3 讨论第59-62页
全文总结第62-64页
参考文献第64-76页
附录 在读期间发表论文情况第76-77页
致谢第77页

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