| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 主要符号对照表 | 第9-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-44页 |
| 1.1 膜电位与离子通道 | 第11-15页 |
| 1.1.1 膜电位 | 第11-13页 |
| 1.1.2 动作电位的产生与传导 | 第13-15页 |
| 1.1.3 电压门控离子通道 | 第15页 |
| 1.2 电压门控钠离子通道概述 | 第15-21页 |
| 1.2.1 电压门控钠离子通道的发现 | 第15-17页 |
| 1.2.2 电压门控钠离子通道的进化 | 第17-20页 |
| 1.2.3 电压门控钠离子通道的分类 | 第20-21页 |
| 1.2.4 细菌电压门控钠离子通道的发现 | 第21页 |
| 1.3 电压门控离子通道的晶体结构 | 第21-29页 |
| 1.3.1 钾离子通道的晶体结构 | 第21-22页 |
| 1.3.2 电压门控钠离子通道的晶体结构 | 第22-29页 |
| 1.4 电压门控离子通道的功能研究 | 第29-40页 |
| 1.4.1 钾离子通道离子选择性 | 第29-31页 |
| 1.4.2 钠离子通道离子选择性 | 第31-34页 |
| 1.4.3 钙离子通道离子选择性 | 第34-35页 |
| 1.4.4 电压感应机制 | 第35-37页 |
| 1.4.5 失活机制 | 第37-39页 |
| 1.4.6 细菌电压门控钠离子通道的功能 | 第39-40页 |
| 1.5 电压门控钠离子通道相关的疾病与药物 | 第40-42页 |
| 1.5.1 电压门控钠离子通道相关疾病 | 第40-41页 |
| 1.5.2 电压门控钠离子通道相关药物 | 第41-42页 |
| 1.6 本文的研究方法与研究意义 | 第42-44页 |
| 第2章 材料与方法 | 第44-47页 |
| 2.1 模型建立 | 第44页 |
| 2.2 参数设置 | 第44页 |
| 2.3 实验方法 | 第44-47页 |
| 2.3.1 NAMD简介 | 第44-45页 |
| 2.3.2 自适应偏置力方法 | 第45-46页 |
| 2.3.3 自由能微扰 | 第46-47页 |
| 第3章 Na_vRh选择性过滤器对Na~+/Ca~(2+)选择性研究 | 第47-72页 |
| 3.1 引言 | 第47页 |
| 3.2 实验内容 | 第47-54页 |
| 3.2.1 系统构建 | 第47-48页 |
| 3.2.2 平衡模拟 | 第48-51页 |
| 3.2.3 ABF实验 | 第51页 |
| 3.2.4 FEP实验 | 第51-53页 |
| 3.2.5 水合数分析 | 第53-54页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第54-71页 |
| 3.3.1 Na~+结合位点 | 第54-60页 |
| 3.3.2 Ca~(2+)结合在Site 1 阻碍Na~+的通过 | 第60-64页 |
| 3.3.3 Ca~(2+)与Na~+在Site 2 结合方式不同 | 第64-68页 |
| 3.3.4 Na~+的通过方式是不对称的 | 第68-71页 |
| 3.4 小结 | 第71-72页 |
| 第4章 Na_vRh选择性过滤器及其真核突变体对Na~+/K~+选择性研究 | 第72-100页 |
| 4.1 引言 | 第72页 |
| 4.2 实验内容 | 第72-79页 |
| 4.2.1 系统构建 | 第72-73页 |
| 4.2.2 平衡模拟 | 第73-75页 |
| 4.2.3 ABF实验 | 第75-76页 |
| 4.2.4 FEP实验 | 第76-79页 |
| 4.2.5 配位数分析 | 第79页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第79-99页 |
| 4.3.1 WT-Na_vRh选择性过滤器具有弱Na~+/K~+选择性 | 第79-82页 |
| 4.3.2 构建DEKA突变体作为哺乳动物钠通道模型 | 第82-83页 |
| 4.3.3 DEKA突变体选择性过滤器中Lys的构象 | 第83-86页 |
| 4.3.4 Na~+、K~+通过DEKA突变体选择性过滤器 | 第86-89页 |
| 4.3.5 Na~+/K~+选择性 | 第89-91页 |
| 4.3.6 Na~+、K~+在Site HFS位点选择性产生原因 | 第91-92页 |
| 4.3.7 Lys的作用 | 第92-95页 |
| 4.3.8 Asp/Glu的作用 | 第95-99页 |
| 4.4 小结 | 第99-100页 |
| 第5章 讨论与展望 | 第100-105页 |
| 5.1 讨论 | 第100-102页 |
| 5.1.1 Na_vRh选择性过滤器渗透Na~+和Ca~(2+)的模型 | 第100-101页 |
| 5.1.2 哺乳动物Nav通道选择性过滤器渗透Na~+和K~+的模型 | 第101-102页 |
| 5.1.3 本文中模拟实验的局限性 | 第102页 |
| 5.2 待解决的问题 | 第102-104页 |
| 5.2.1 哺乳动物Cav通道选择Ca~(2+)的机理 | 第102-103页 |
| 5.2.2 哺乳动物Nav通道Site 1 的结合方式 | 第103-104页 |
| 5.2.3 Lys的其他突变丧失Na~+/K~+选择性的机理 | 第104页 |
| 5.2.4 基于开放构象NavMs的模拟研究 | 第104页 |
| 5.3 前景与展望 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-121页 |
| 致谢 | 第121-123页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第123页 |
