| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 地衣、地衣细菌及二代测序技术 | 第11-17页 |
| 1.1 地衣的独特性 | 第11页 |
| 1.2 地衣细菌 | 第11-14页 |
| 1.3 地衣细菌群落影响因子 | 第14-15页 |
| 1.4 地衣细菌中的新种 | 第15-16页 |
| 1.5 肺衣属地衣 | 第16-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-30页 |
| 2.1 实验材料 | 第17-18页 |
| 2.2 地衣标本照片 | 第18-19页 |
| 2.3 标本采集地概况 | 第19-20页 |
| 2.4 实验仪器 | 第20页 |
| 2.5 实验试剂 | 第20-21页 |
| 2.6 主要实验步骤 | 第21-25页 |
| 2.6.1 肺衣总DNA提取 | 第21-22页 |
| 2.6.2 DNA原样检测 | 第22页 |
| 2.6.3 肺衣共生真菌rDNA ITS序列的PCR扩增 | 第22-23页 |
| 2.6.4 肺衣细菌 16S rDNA序列的PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.6.5 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测 | 第24页 |
| 2.6.6 PCR产物纯化 | 第24-25页 |
| 2.7 下机数据处理 | 第25-30页 |
| 2.7.1 原始数据质控 | 第25-26页 |
| 2.7.2 OTU划分与精简与分类地位鉴定 | 第26-27页 |
| 2.7.3 基于OTU矩阵的群落多样性分析。 | 第27-30页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第30-53页 |
| 3.1 肺衣总DNA提取检测 | 第30-31页 |
| 3.2 肺衣属肺衣物种鉴定 | 第31-33页 |
| 3.2.1 肺衣共生真菌ITS rDNA PCR产物电泳检测 | 第31页 |
| 3.2.2 测序结果比对及构建系统发育树 | 第31-33页 |
| 3.3 肺衣细菌总 16s rDNA的检测 | 第33-34页 |
| 3.4 原始数据质控 | 第34-35页 |
| 3.5 OTU划分与分类地位鉴定 | 第35-38页 |
| 3.6 菌群Alpha多样性分析 | 第38-41页 |
| 3.6.1 Rarefaction稀疏曲线 | 第38-39页 |
| 3.6.2 Alpha多样性指数 | 第39-41页 |
| 3.7 菌群的分类学组成分析 | 第41-50页 |
| 3.7.1 门分类水平的分类学组成分析 | 第41-43页 |
| 3.7.2 样本组间门、属分类学组成的差异分析 | 第43-47页 |
| 3.7.3 样本组间目、科优势类群分类学组成的差异分析 | 第47-48页 |
| 3.7.4 各分类水平优势类群 | 第48-50页 |
| 3.8 地衣细菌群落Beta多样性分析 | 第50-53页 |
| 第四章 结论创新 | 第53-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
