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基于生物医学文本挖掘的蛋白质间相互作用关系抽取方法的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第11-23页
    1.1 研究背景与意义第11-12页
    1.2 研究现状第12-21页
        1.2.1 蛋白质关系抽取第13-15页
        1.2.2 迁移学习第15-18页
        1.2.3 正例未标注学习第18-21页
    1.3 现有研究存在的问题和不足第21页
    1.4 本文研究内容第21-22页
    1.5 论文组织结构第22-23页
第二章 基于远程监督和迁移学习的PPI关系抽取第23-57页
    2.1 引言第23-24页
    2.2 方法概述与流程第24-25页
    2.3 远程监督构建辅助集第25-31页
        2.3.1 MEDLINE摘要搜集和处理第26-27页
        2.3.2 IntAct知识库搜集和处理第27-30页
        2.3.3 标准数据集第30-31页
    2.4 特征提取第31-38页
        2.4.1 数据集预处理第31-33页
        2.4.2 结构化表示第33-34页
        2.4.3 提取特征第34-37页
        2.4.4 特征向量构造第37-38页
    2.5 特征选择第38-39页
        2.5.1 最大相关最小冗余算法第38-39页
    2.6 模型构建第39-42页
        2.6.1 问题定义第39-40页
        2.6.2 TrAdaBoost算法第40-42页
    2.7 实验设置第42-47页
        2.7.1 数据集设置第42-43页
        2.7.2 对比算法第43-45页
        2.7.3 性能评估第45-47页
    2.8 实验结果与分析第47-56页
        2.8.1 与标准数据集的对比实验第47-53页
        2.8.2 与有监督算法的对比实验第53-56页
    2.9 本章小结第56-57页
第三章 PU场景下基于远程监督和迁移学习的PPI关系抽取第57-77页
    3.1 引言第57-58页
    3.2 相关工作第58-60页
        3.2.1 贝叶斯分类模型第58-60页
        3.2.2 数据引力第60页
    3.3 方法概述与流程第60-61页
    3.4 特征提取和筛选第61页
    3.5 数据集构建第61-62页
    3.6 问题定义第62-63页
    3.7 AODE算法第63页
    3.8 PAODE算法第63-64页
    3.9 TPAODE算法第64-69页
        3.9.1 基于实例的知识迁移第64-66页
        3.9.2 分类算法第66页
        3.9.3 训练算法第66-68页
        3.9.4 正例先验概率估计第68-69页
    3.10 实验设置第69-70页
    3.11 实验及结果分析第70-75页
        3.11.1 针对参数Unlevel实验第70-72页
        3.11.2 针对参数a的实验第72-75页
        3.11.3 时空分析第75页
    3.12 本章小结第75-77页
第四章 结论与未来工作第77-79页
    4.1 结论第77页
    4.2 未来工作第77-79页
参考文献第79-84页
附录一第84-85页
致谢第85-86页
作者简介第86页

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