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耐受丁草胺的两株细菌新种-BUT-2~T及BUT-3~T的分离及其多相分类研究

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
符号与缩略语说明第13-14页
前言第14-15页
文献综述第15-31页
 1 丁草胺的污染现状及其研究进展第15-21页
   ·丁草胺的性状及应用情况第15-16页
     ·丁草胺简介第15页
     ·丁草胺学名及结构式第15页
     ·丁草胺的理化性质第15页
     ·丁草胺的毒性第15-16页
     ·丁草胺的作用机理第16页
     ·丁草胺的应用范围第16页
   ·丁草胺的污染危害第16-17页
     ·丁草胺对土壤的污染危害第16-17页
     ·丁草胺对水体的污染危害第17页
   ·微生物降解丁草胺的研究进展第17-18页
     ·国外对丁草胺的生物降解研究情况第17-18页
     ·国内对丁草胺的生物降解情况第18页
   ·微生物对有机溶剂耐受性的研究进展第18-21页
     ·有机溶剂对微生物的毒性作用机制第18-19页
     ·微生物对有机溶剂的耐受机制第19-20页
     ·耐有机溶剂微生物的应用第20-21页
 2 微生物多相分类方法研究概述第21-25页
   ·基于表型特征的传统分类第21-22页
   ·基于细胞结构组成的化学分类第22-23页
     ·细胞壁组分分析第22页
     ·全细胞脂肪酸分析第22-23页
     ·磷酸类脂分析第23页
     ·呼吸醌组分分析第23页
     ·全细胞可溶性蛋白电泳及核糖体蛋白图谱分析第23页
   ·基于遗传学的鉴定方法第23-25页
     ·16S rRNA基因序列比对第23-24页
     ·DNA碱基组成比例的测定(G+C mol%)第24页
     ·DNA-DNA杂交第24-25页
 参考文献第25-31页
实验部分第31-75页
 第一章 丁草胺耐受菌株BUT-2~T及BUT-3~T的分离筛选第31-43页
  1 材料与方法第31-34页
   ·供试土样、试剂、培养基及仪器设备第31-32页
     ·供试土样第31页
     ·供试试剂第31页
     ·培养基第31页
     ·仪器和设备第31-32页
   ·耐受菌株的分离、筛选第32页
   ·耐受菌株的16S rRNA基因序列的测定第32页
     ·菌体总DNA的提取第32页
     ·菌株16S rRNA基因序列的PCR扩增第32-33页
     ·PCR产物的T/A克隆第33页
     ·酶连产物的转化第33页
     ·质粒DNA的小量提取第33页
     ·16S rRNA基因序列测定第33-34页
   ·耐受菌株系统发育关系的研究第34页
  2 结果与分析第34-41页
   ·污染土样中丁草胺耐受菌株的分离、筛选第34页
   ·菌株BUT-2~T和BUT-3~T的16S rRNA的基因序列扩增第34-35页
   ·菌株BUT-2~T和BUT-3~T的系统发生关系分析第35-41页
  3 本章小结第41页
  参考文献第41-43页
 第二章 丁草胺耐受菌株BUT-3~T的分类地位研究第43-65页
  1 材料与方法第43-50页
   ·供试菌株、培养基及试剂第43-44页
     ·供试菌株第43页
     ·培养基及试剂第43-44页
   ·菌株表型特征分析第44-45页
     ·菌落形态学特征第44页
     ·细胞形态学特征第44页
     ·革兰氏染色第44页
     ·菌株的运动性观察第44页
     ·API鉴定系统分析第44页
     ·Biolog鉴定系统分析第44-45页
     ·抗生素敏感试验第45页
   ·菌株化学分类特征分析第45-46页
     ·细胞脂肪酸分析第45页
     ·细胞醌类成分测定第45页
     ·细胞极性脂组分分析第45-46页
   ·菌株基因型特性分析第46-50页
     ·核糖体16S rRNA基因序列分析第46页
     ·菌株系统发育进化关系的分析第46页
     ·菌株G+C mol%的测定第46页
     ·DNA-DNA杂交第46-50页
  2 结果与分析第50-61页
   ·菌株表型特征分析第50-55页
     ·菌落及细胞形态、最适生长条件第50页
     ·Biolog测定结果比较第50-51页
     ·API测定结果比较第51-54页
     ·BUT-3~T与参考菌株的表型差异比较第54-55页
   ·菌株化学分类特征分析第55-58页
     ·菌株脂肪酸成分分析第55-56页
     ·菌株醌组分分析第56-57页
     ·菌株极性脂组分分析第57-58页
   ·菌株基因型特性分析结果第58-61页
     ·核糖体16S rRNA基因序列分析第58页
     ·菌株系统发育进化关系的分析第58页
     ·菌株总DNA G+C mol%含量测定第58页
     ·DNA-DNA同源性分析第58-61页
  3 本章小结第61-62页
  参考文献第62-65页
 第三章 丁草胺耐受菌株BUT-2~T的分类地位研究第65-75页
  1 材料与方法第65-67页
   ·供试菌株、培养基及试剂第65页
     ·供试菌株第65页
     ·培养基及试剂第65页
   ·菌株表型特征分析第65-66页
     ·菌落形态学特征第65-66页
     ·细胞形态学特征第66页
     ·革兰氏染色第66页
     ·菌株的运动性观察第66页
     ·抗生素敏感试验第66页
     ·其他生理生化性状的测定第66页
   ·菌株化学分类特征分析第66页
     ·细胞脂肪酸分析第66页
     ·细胞醌类成分测定第66页
     ·细胞极性脂组分分析第66页
   ·菌株基因型特性分析第66-67页
     ·核糖体16S rRNA基因序列分析第66页
     ·菌株系统发育进化关系的分析第66页
     ·菌株G+C mol%的测定第66页
     ·DNA-DNA杂交第66-67页
  2 结果与分析第67-72页
   ·菌株表型特征分析第67-69页
     ·菌落及细胞形态和最适生长条件第67页
     ·BUT-2与参考菌株的表型差异比较第67-69页
   ·菌株化学分类特征分析第69-71页
     ·菌株脂肪酸成分分析第69-70页
     ·菌株醌组分分析第70页
     ·菌株极性脂组分分析第70-71页
   ·菌株基因型特性分析结果第71-72页
     ·核糖体16S rRNA基因序列分析第71页
     ·菌株系统发育进化关系的分析第71页
     ·菌株总DNA G+C mol%含量测定第71页
     ·DNA-DNA同源性分析第71-72页
  3 本章小结第72-73页
  参考文献第73-75页
全文总结第75-77页
本文的主要创新点第77-79页
附录一 文中所用培养基及试剂配方第79-81页
附录二 研究中获得的相关DNA序列第81-83页
附录三 攻读硕士学位期间发表或已录用的论文第83-85页
致谢第85页

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