| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| ·研究背景及意义 | 第10-11页 |
| ·研究现状及进展 | 第11-14页 |
| ·蛋白质播酸化实验技术 | 第11-12页 |
| ·蛋白质底物与蛋白质激_作用关系预测 | 第12-14页 |
| ·本文的内容结构安排 | 第14-18页 |
| 第二章 网络的链路预测 | 第18-22页 |
| ·网络链路预测简介 | 第18-19页 |
| ·磷酸化网络的链路预测简介 | 第19-22页 |
| 第三章 磷酸化网络链路预测数据处理与分析 | 第22-32页 |
| ·磷酸化蛋白质底物数据来源 | 第22-23页 |
| ·磷酸化蛋白质激酶数据来源 | 第23-25页 |
| ·磷酸化网络数据预处理 | 第25-28页 |
| ·磷酸化网络中蛋白质底物序列数据预处理 | 第28-29页 |
| ·BLOSUM简介 | 第28-29页 |
| ·磷酸化网络中蛋白质底物序列相似性计算 | 第29页 |
| ·磷酸化网络中蛋白质激酶数据预处理 | 第29-32页 |
| 第四章 磷酸化网络链路预测算法 | 第32-38页 |
| ·支持向量机(SVM) | 第32-35页 |
| ·贝叶斯理论(BDT) | 第35-38页 |
| 第五章 磷酸化网络拓扑结构与蛋白质底物序列信息在磷酸化网络链路预测中的应用 | 第38-48页 |
| ·网络节点相似性度量 | 第38-40页 |
| ·SVM-Net算法 | 第40-48页 |
| ·SVM-Net研究背景 | 第41页 |
| ·SVM-Net数据处理 | 第41-43页 |
| ·SVM-Net网络链路预测方法 | 第43-44页 |
| ·SVM-Net网络链路预测结果分析 | 第44-48页 |
| 第六章 磷酸化网络拓扑结构与多种序列信息的磷酸化网络链路预测 | 第48-60页 |
| ·LapRLS-AWN研究背景 | 第48页 |
| ·LapRLS-AWN数据处理 | 第48-49页 |
| ·LapRLS-AWN网络链路预测方法 | 第49-53页 |
| ·拉普拉斯最小二乘法 | 第51-52页 |
| ·磷酸化网络中孤立节点的处理方法 | 第52-53页 |
| ·LapRLS-AWN磷酸化网络预测结构分析 | 第53-60页 |
| 第七章 总结与展望 | 第60-62页 |
| ·本文工作总结 | 第60页 |
| ·下一步工作安排 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-66页 |
| 致谢 | 第66-68页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第68页 |