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抗冻蛋白序列与结构特征的研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-9页
第一章 绪论第9-15页
   ·引言第9页
   ·抗冻蛋白的作用机制第9-10页
   ·本文所使用的数据库简介第10-11页
     ·Uniprot数据库第10-11页
     ·PDB数据库第11页
     ·无机晶体结构数据库第11页
   ·抗冻蛋白结构的分类第11-15页
第二章 抗冻蛋白序列的预测第15-20页
   ·引言第15页
   ·数据集的构建第15-16页
   ·特征参数的提取第16-17页
     ·N肽组分信息第16-17页
     ·伪氨基酸信息第17页
     ·化学位移信息第17页
   ·支持向量机算法第17-18页
   ·预测结果及算法评估第18-20页
     ·算法的评估第18-19页
     ·预测结果第19-20页
第三章 抗冻蛋白分子动力学模拟第20-31页
   ·Pymol软件简介第20-21页
   ·Material studio软件简介第21页
   ·本次计算使用的模块第21页
   ·力场和系综第21-22页
   ·冰晶模型的构建第22-24页
   ·蛋白质选取第24-26页
   ·抗冻蛋白的动力学模拟过程第26-28页
     ·水盒子的构建第26页
     ·模拟模型的构建第26-27页
     ·模型的优化第27页
     ·模型的动力学模拟第27-28页
   ·模拟的结果和分析第28-31页
第四章 全文总结第31-32页
参考文献第32-38页
附录第38-42页
致谢第42页

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