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基于半监督学习的SELDI-TOF蛋白质质谱数据分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-12页
第1章 绪论第12-21页
   ·研究背景及意义第12-14页
   ·蛋白质组学的相关研究第14-15页
   ·SELDI-TOF 质谱特征提取算法的研究现状第15-18页
     ·基于有监督学习方法的研究第15页
     ·基于无监督学习方法的研究第15-16页
     ·基于半监督学习方法的研究第16-18页
   ·本文主要工作第18-21页
     ·主要内容第18-19页
     ·组织结构第19-21页
第2章 SELDI-TOF 质谱技术及算法分析第21-42页
   ·SELDI-TOF 质谱技术的研究现状及进展第21-23页
     ·质谱技术的研究现状及进展第21页
     ·SELDI-TOF 质谱技术的分析第21-23页
   ·预处理技术第23-24页
   ·SELDI-TOF 数据分析的经典算法第24-31页
     ·主成分分析(PCA)方法第24-25页
     ·核主成分分析(KPCA)方法第25-27页
     ·支持向量机(SVM)方法第27-29页
     ·K 最近邻节点(KNN)方法第29页
     ·线性判别分析(LDA)方法第29-30页
     ·人工神经网络方法第30-31页
   ·SELDI-TOF 数据结合半监督学习方法介绍第31-41页
     ·半监督学习介绍第31页
     ·基于图的半监督学习介绍第31-37页
     ·局部全局一致性学习(LLGC)第37-39页
     ·简洁局部全局一致性学习(BB-LLGC)第39-41页
   ·本章小结第41-42页
第3章 基于多步降维和半监督学习的质谱特征提取第42-54页
   ·实验所用样本集及相关预处理方法第43-46页
     ·实验所用样本数据集的介绍第43页
     ·对实验数据集进行预处理的步骤第43-46页
   ·特征提取实验算法和流程第46-50页
     ·利用 T 检验进行初步筛选第46-47页
     ·基于离散小波变化及相对熵排序再次筛选第47-48页
     ·利用主成分分析完成特征提取第48-49页
     ·结合半监督学习算法进行分类第49页
     ·特征提取实验的流程概述第49-50页
   ·实验结果及其分析第50-53页
     ·在三个数据集上的分类结果分析第50-51页
     ·通过对比方法探讨本实验所用方法的效果第51-52页
     ·与经典的降维分类框架对比第52页
     ·与不同分类器进行分类性能对比第52-53页
     ·探讨标记样本数量对分类器的分类性能的影响第53页
   ·本章小结第53-54页
第4章 基于稀疏表示和半监督学习的蛋白质质谱数据分类第54-61页
   ·实验所用样本集描述与相关预处理第54页
   ·进行分类实验的算法与实验流程第54-57页
     ·利用核主成分分析方法完成特征提取第54-55页
     ·利用稀疏表示向量进行构图第55-56页
     ·结合半监督学习算法进行分类第56-57页
   ·实验结果与分析第57-60页
     ·对三个数据集的参数进行选择第57页
     ·在三个数据集上的分类结果第57-58页
     ·不同特征提取结合分类算法之间的分类性能比较第58-59页
     ·本章分类算法与经典分类算法的性能比较第59页
     ·不同标记比例对本章分类算法的影响第59-60页
   ·本章小结第60-61页
第5章 总结与展望第61-63页
致谢第63-64页
参考文献第64-71页
附录第71页

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