| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 1 综述 | 第9-14页 |
| ·基因组学概述 | 第9-10页 |
| ·结构基因组学 | 第9页 |
| ·比较基因组学 | 第9页 |
| ·功能基因组学 | 第9-10页 |
| ·功能基因组学的主要研究内容 | 第10-11页 |
| ·基因功能的研究 | 第10页 |
| ·基因组表达及时空调控的转录组学研究 | 第10页 |
| ·基因组多样性的研究 | 第10页 |
| ·蛋白质组及蛋白质组学的研究 | 第10-11页 |
| ·功能基因组学的研究方法 | 第11-14页 |
| ·EST 法 | 第11-12页 |
| ·SAGE 法 | 第12页 |
| ·RNA-seq | 第12-14页 |
| 2 七鳃鳗基因组学研究进展 | 第14-18页 |
| ·七鳃鳗的生物学特征简介 | 第14页 |
| ·研究进展 | 第14-18页 |
| ·人类基因组学研究 | 第14页 |
| ·七鳃鳗基因组学研究 | 第14-18页 |
| 3 cDNA 文库构建及 EST 测序 | 第18-24页 |
| ·cDNA 文库概述 | 第18-19页 |
| ·cDNA 文库构建的基本原理和方法 | 第18-19页 |
| ·用于 EST 研究的 cDNA 文库分类 | 第19页 |
| ·EST 测序 | 第19-20页 |
| ·EST 随机测序 | 第19-20页 |
| ·序列前处理 | 第20页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏 cDNA 文库的构建与 EST 测序 | 第20-21页 |
| ·材料与方法 | 第20-21页 |
| ·结果 | 第21页 |
| ·日本七鳃鳗血液 cDNA 文库的构建与 EST 测序 | 第21-22页 |
| ·材料与方法 | 第21-22页 |
| ·结果 | 第22页 |
| ·讨论 | 第22-24页 |
| 4 日本七鳃鳗血液和肝脏组织的比较转录组学研究 | 第24-42页 |
| ·材料与方法 | 第24-25页 |
| ·日本七鳃鳗 EST 序列与海七鳃鳗全基因组比对 | 第24页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏和血液表达基因的功能分析 | 第24页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏和血液表达差异基因的比较分析 | 第24-25页 |
| ·结果与讨论 | 第25-40页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏、血液 EST 文库与海七鳃鳗全基因组注释蛋白的比较分析 | 第25-26页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏、血液 EST 文库与海七鳃鳗全基因组拼接序列的比较分析 | 第26-27页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏、血液表达基因功能的比较分析 | 第27-34页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏和血液组织中表达差异显著的基因 | 第34页 |
| ·肝脏组织中高表达基因的功能分析 | 第34-37页 |
| ·血液组织中高表达基因的功能分析 | 第37-40页 |
| ·总结 | 第40-42页 |
| 5 结论 | 第42-43页 |
| ·完成了 cDNA 文库的构建和 EST 测序 | 第42页 |
| ·完成了日本七鳃鳗 EST 序列与海七鳃鳗全基因组的比对分析 | 第42页 |
| ·完成了日本七鳃鳗肝脏和血液表达基因的比较转录组学分析 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-45页 |
| 附录 A 日本七鳃鳗肝脏表达基因功能富集总表 | 第45-54页 |
| 附录 B 日本七鳃鳗血液表达基因功能富集总表 | 第54-61页 |
| 附录 C 日本七鳃鳗肝脏高表达基因功能聚类结果 | 第61-64页 |
| 附录 D 日本七鳃鳗血液高表达基因功能聚类结果 | 第64-68页 |
| 附录 E 日本七鳃鳗肝脏表达基因在人类基因组中的同源基因在 KEGG 数据库帕金森症通路中的富集 | 第68-69页 |
| 附录 F 日本七鳃鳗肝脏表达基因在人类基因组中的同源基因在 KEGG 数据库亨廷顿氏舞蹈症通路中的富集 | 第69-70页 |
| 附录 G 日本七鳃鳗肝脏表达基因在人类基因组中的同源基因在 KEGG 数据库阿尔茨海默症通路中的富集 | 第70-71页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
