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新疆罗布泊盐湖放线菌多样性及多相分类

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
第一章 文献综述第13-31页
   ·盐湖概况第13-16页
     ·中国盐湖概况第13-14页
     ·罗布泊盐湖概况第14-16页
   ·嗜盐放线菌第16-19页
     ·嗜盐放线菌的定义第16-18页
     ·嗜盐放线菌物种资源第18-19页
   ·放线菌系统分类进展第19-27页
     ·放线菌分类学的发展第19-22页
     ·放线菌的多相分类第22-27页
   ·放线菌多样性研究方法第27-29页
   ·课题研究的目的与意义第29-31页
第二章 罗布泊盐湖沉积物非培养放线菌多样性第31-49页
   ·材料和方法第31-35页
     ·样品的采集第31页
     ·样品总DNA的提取第31-32页
     ·放线菌特异性序列的扩增第32页
     ·PCR产物的回收纯化第32-33页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第33-34页
     ·目的片段的连接转化第34页
     ·克隆文库构建与RFLP分析第34-35页
     ·非培养放线菌系统发育多样性分析及文库评价第35页
   ·结果与分析第35-44页
     ·样品总DNA的提取第35-36页
     ·放线菌特异性扩增与PCR产物纯化第36页
     ·克隆文库构建与RFLP分析第36-37页
     ·克隆文库的评价第37-40页
     ·罗布泊非培养放线菌群落结构及其系统发育多样性第40-44页
   ·讨论第44-49页
     ·非培养技术带来的有价值的发现第44-45页
     ·生态效应对盐湖放线菌多样性组成的影响第45-46页
     ·链霉菌(Streptomyces)是盐湖生境中的优势群体吗第46-49页
第三章 罗布泊盐湖沉积物可培养放线菌物种多样性第49-65页
   ·材料与方法第49-52页
     ·土壤样品离子成分的测定第49页
     ·培养基第49-50页
     ·样品的分离第50-51页
     ·菌株保藏第51页
     ·菌株的16S rRNA系统进化分析第51-52页
       ·菌株DNA的小量提取第51页
       ·16S rDNA基因的PCR扩增第51-52页
       ·目的片段的连接与转化第52页
       ·放线菌16S rDNA基因系统发育第52页
   ·结果与分析第52-61页
     ·土壤样品离子成分组成第52-53页
     ·不同培养基对罗布泊土壤放线菌的分离比较第53-56页
     ·不同盐浓度条件下培养基对罗布泊土壤放线菌的分离比较第56-57页
     ·罗布泊盐湖放线菌物种多样性与系统发育分析第57-61页
   ·讨论第61-65页
     ·极端环境放线菌资源的挖掘任重道远第61-62页
     ·可培养微生物多样性的有限性和非培养法的局限性第62-63页
     ·可培养获得的优势种群是自然生态中的优势种群吗第63-65页
第四章 放线菌新种的多相分类第65-117页
   ·材料和方法第65-85页
     ·新种菌株信息第65-66页
     ·新种菌株的表型分类方法第66-76页
       ·放线菌的纯化第66页
       ·放线菌的形态观察第66页
       ·放线菌的培养特征观察第66-67页
       ·革兰氏阴性或阳性菌的测定第67-68页
       ·碳、氮源利用实验第68-69页
       ·温度、NaCl和pH耐受试验第69-70页
       ·糖发酵试验第70页
       ·明胶液化试验第70-71页
       ·牛奶凝固与胨化试验第71页
       ·淀粉水解试验第71页
       ·纤维素分解试验第71-72页
       ·硝酸盐还原试验第72页
       ·氧化酶试验第72-73页
       ·过氧化氢酶试验第73页
       ·脲酶试验第73页
       ·脂酶试验第73页
       ·甲基红试验(methyl red test,MR)第73-74页
       ·V-P试验(Voges-Prokauer test)第74页
       ·吲哚试验(indo1 test)第74-75页
       ·硫化氢产生试验第75页
       ·酪蛋白水解试验第75页
       ·抗生素敏感性试验第75-76页
       ·Biolog自动微生物鉴定系统第76页
     ·放线菌新种的化学分类方法第76-81页
       ·全细胞氨基酸分析第76-77页
       ·细胞脂肪酸组分分析第77-78页
       ·全细胞水解糖分分析第78页
       ·甲基萘醌分析第78-79页
       ·磷脂组分分析第79-81页
     ·放线菌新种的分子分类方法第81-85页
       ·16S rRNA基因序列分析第81页
       ·DNA-DNA分子杂交第81-83页
       ·DNA GC mol%的测定第83-85页
   ·结果与分析第85-115页
     ·新种YIM 92370的多相分类结果第85-90页
       ·菌株YIM 92370的形态特征第85-86页
       ·菌株YIM 92370的培养特征第86页
       ·菌株YIM 92370的生理生化特性第86页
       ·菌株YIM 92370的化学分类特征第86-87页
       ·菌株YIM 92370的分子分类特征第87页
       ·菌株YIM 92370与同源菌株的差异比较第87-89页
       ·嗜盐糖霉菌新属白色嗜盐糖霉菌新种的描述第89-90页
     ·新种TRM 415的多相分类结果第90-95页
       ·菌株TRM 415的形态特征第90页
       ·菌株TRM 415的生理生化特性第90-92页
       ·菌株TRM 415的化学分类特征第92页
       ·菌株TRM 415的分子分类特征第92-93页
       ·菌株TRM 415与同源菌株的差异比较第93-95页
       ·盐生耐盐短杆菌新种的描述第95页
     ·新种TRM 40136的多相分类结果第95-101页
       ·菌株TRM 40136形态特征第96页
       ·菌株TRM 40136的生理生化特性第96-97页
       ·菌株TRM 40136化学分类结果第97-99页
       ·菌株TRM 40136分子分类结果第99-100页
       ·新疆放线多孢菌新种的描述第100-101页
     ·新种TRM 40133的多相分类结果第101-104页
       ·菌株TRM 40133表型特征第101-102页
       ·菌株TRM 40133化学分类特征第102-103页
       ·菌株TRM 40133分子分类特征第103页
       ·盐湖糖多孢菌新种的描述第103-104页
     ·新种TRM 40137的多相分类结果第104-111页
       ·菌株TRM 40137表型特征第104-106页
       ·菌株TRM 40137化学分类特征第106-107页
       ·菌株TRM 40137分子分类特征第107-108页
       ·喜盐耐盐糖霉菌新种的描述第108-111页
     ·新种TRM F103的多相分类结果第111-115页
       ·菌株TRM F103表型特征第111-112页
       ·菌株TRM F103化学分类特征第112页
       ·菌株TRM F103分子分类特征第112-114页
       ·盐生耐盐拟无枝菌酸菌新种的描述第114-115页
   ·讨论第115-117页
主要创新和发现第117-119页
参考文献第119-131页
附录第131-133页
发表论文第133-135页
致谢第135-136页

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