| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-35页 |
| ·胶质类芽孢杆菌研究现状 | 第13-18页 |
| ·胶质类芽孢杆菌简介 | 第13页 |
| ·胶质类芽孢杆菌的分类地位 | 第13-14页 |
| ·胶质类芽孢杆菌形态特征及生理生化性质 | 第14-15页 |
| ·胶质类芽孢杆菌功能与应用研究概述 | 第15-18页 |
| ·解钾、溶磷效果及机理研究 | 第15-17页 |
| ·胶质类芽孢杆菌固氮研究 | 第17页 |
| ·胶质类芽孢杆菌在生产实践中的应用 | 第17-18页 |
| ·微生物基因组学研究进展 | 第18-27页 |
| ·微生物基因组学发展历史 | 第18-20页 |
| ·基因组学分类 | 第20-21页 |
| ·测序技术 | 第21-27页 |
| ·传统测序技术 | 第21-22页 |
| ·高通量测序技术 | 第22-25页 |
| ·高通量测序法与全基因组随机测序 | 第25-26页 |
| ·高通量测序法的拼接 | 第26页 |
| ·大分子片段基因组文库 | 第26-27页 |
| ·生物固氮基因的研究进展 | 第27-31页 |
| ·生物固氮 | 第27-28页 |
| ·固氮酶结构及其编码基因 | 第28-29页 |
| ·固氮基因的表达调控 | 第29-31页 |
| ·研究目的和意义 | 第31-32页 |
| ·研究内容和技术路线 | 第32-35页 |
| ·研究内容 | 第32页 |
| ·研究方法 | 第32-34页 |
| ·技术路线 | 第34-35页 |
| 2 材料与方法 | 第35-51页 |
| ·材料 | 第35-37页 |
| ·菌株 | 第35页 |
| ·质粒载体 | 第35页 |
| ·工具酶及DNA分子量标准 | 第35页 |
| ·试剂盒 | 第35-36页 |
| ·主要试剂 | 第36页 |
| ·主要仪器及设备 | 第36-37页 |
| ·培养基 | 第37页 |
| ·方法 | 第37-51页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016全基因组测序 | 第37-46页 |
| ·鸟枪法基因组文库的构建 | 第38-40页 |
| ·基因组文库的大规模测序 | 第40-42页 |
| ·基因组454高通量测序 | 第42-46页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016基因组拼接 | 第46页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016基因组注释 | 第46-49页 |
| ·开放阅读框(ORF)的预测 | 第46页 |
| ·基因功能注释 | 第46页 |
| ·其他元件注释 | 第46-47页 |
| ·胶质类芽孢杆菌氮代谢网络分析 | 第47页 |
| ·全基因组多序列比对 | 第47页 |
| ·参照序列及软件 | 第47-49页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016固氮性能的测定 | 第49-51页 |
| ·乙炔还原法测定固氮酶活性 | 第49页 |
| ·凯氏定氮法测定氮含量 | 第49-50页 |
| ·~(15)N标记法测固氮性能 | 第50-51页 |
| 3 结果与分析 | 第51-63页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016的基因组序列测定 | 第51页 |
| ·文库构建及测序 | 第51页 |
| ·序列质量剪切 | 第51页 |
| ·基因组拼接 | 第51页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016全基因组注释及生物信息学分析 | 第51-61页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016基因组基本特征 | 第51-53页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016基因组环形图谱 | 第53-54页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016基因组编码ORFs的分析 | 第54-55页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016中tRNA以及密码子的使用情况 | 第55-56页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016的G+C含量曲线 | 第56页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016与KNP414等三株类芽孢杆菌的基因组比较 | 第56-57页 |
| ·测序完成的类芽孢杆菌菌株系统进化分析 | 第57-58页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016的N代谢途径 | 第58-59页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016固氮相关基因 | 第59-61页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016固氮性能及分析 | 第61-63页 |
| ·在无氮培养基生长状况 | 第61页 |
| ·固氮酶活测定结果 | 第61页 |
| ·凯氏定氮法测定结果 | 第61-62页 |
| ·~(15)N标记法测定结果 | 第62-63页 |
| 4 讨论 | 第63-67页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016的基因组测序 | 第63-64页 |
| ·胶质类芽孢杆菌3016的基因组注释及比较 | 第64页 |
| ·胶质类芽孢杆菌系统进化分析 | 第64-65页 |
| ·胶质类芽抱杆菌3016 N代谢网络途径及固氮能力 | 第65-67页 |
| 5 结论 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第78页 |
