基于线粒体基因的常见造礁石珊瑚系统进化研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 1 引言 | 第12-25页 |
| ·生物分类 | 第12-13页 |
| ·生物分类的定义 | 第12页 |
| ·生物分类的发展历史 | 第12页 |
| ·生物分类的方法 | 第12-13页 |
| ·分子系统学 | 第13-14页 |
| ·定义及原理 | 第13-14页 |
| ·发展条件 | 第14页 |
| ·分子系统树 | 第14-17页 |
| ·系统树的构建方法 | 第14-15页 |
| ·不同系统树的比较 | 第15-17页 |
| ·珊瑚礁简介 | 第17-21页 |
| ·珊瑚生态研究 | 第17-19页 |
| ·柳珊瑚的分子研究 | 第19-20页 |
| ·石珊瑚的分子研究 | 第20-21页 |
| ·珊瑚的分类研究 | 第21-23页 |
| ·珊瑚的形态分类 | 第21-22页 |
| ·珊瑚的分子分类研究 | 第22页 |
| ·传统分类与分子分类的联系 | 第22-23页 |
| ·研究目的及意义 | 第23-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-31页 |
| ·实验仪器及用具 | 第25页 |
| ·样本采集工具 | 第25页 |
| ·DNA 提取及目的基因扩增 | 第25页 |
| ·实验试剂 | 第25-26页 |
| ·主要试剂 | 第25页 |
| ·主要溶液的配制 | 第25-26页 |
| ·实验材料 | 第26页 |
| ·采样 | 第26-27页 |
| ·采样地点 | 第26页 |
| ·采样方法 | 第26页 |
| ·样本形态学初步鉴定 | 第26-27页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第27-29页 |
| ·DNA 的提取 | 第28-29页 |
| ·DNA 提取结果检测 | 第29页 |
| ·PCR 引物 | 第29-30页 |
| ·引物的设计 | 第29页 |
| ·参考引物 | 第29-30页 |
| ·PCR 扩增 | 第30页 |
| ·扩增体系 | 第30页 |
| ·扩增程序 | 第30页 |
| ·扩增产物的检测 | 第30页 |
| ·序列测定及拼接 | 第30页 |
| ·序列分析 | 第30页 |
| ·单个基因序列分析 | 第30页 |
| ·联合基因序列及分析 | 第30页 |
| ·系统进化分析 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-44页 |
| ·样本采集及形态学鉴定结果 | 第31页 |
| ·总 DNA 提取结果 | 第31页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第31-33页 |
| ·COⅠ基因扩增结果 | 第32页 |
| ·线粒体 16S rRNA 扩增结果 | 第32-33页 |
| ·线粒体 12S rRNA 扩增结果 | 第33页 |
| ·测序结果 | 第33-34页 |
| ·COⅠ基因分析结果 | 第34-36页 |
| ·COⅠ基因序列碱基组成及变异 | 第34页 |
| ·COⅠ基因遗传距离分析结果 | 第34-36页 |
| ·COⅠ基因系统发育树 | 第36页 |
| ·线粒体 16S rRNA 基因 | 第36-39页 |
| ·序列碱基组成及变异 | 第36-37页 |
| ·遗传距离分析结果 | 第37-38页 |
| ·系统发育树 | 第38-39页 |
| ·线粒体 12S rRNA 基因 | 第39-41页 |
| ·序列碱基组成及变异 | 第39-40页 |
| ·遗传距离分析结果 | 第40-41页 |
| ·系统发育树 | 第41页 |
| ·串联基因 | 第41-44页 |
| ·序列碱基组成及变异 | 第41-42页 |
| ·遗传距离分析结果 | 第42-43页 |
| ·系统发生分析 | 第43-44页 |
| 4 讨论 | 第44-49页 |
| ·DNA 提取 | 第44页 |
| ·COⅠ基因 | 第44-45页 |
| ·线粒体 16S rRNA 基因 | 第45-46页 |
| ·线粒体 12S rRNA 基因 | 第46-47页 |
| ·线粒体三基因组合数据 | 第47-49页 |
| 5 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-60页 |
| 附录一 | 第60-65页 |
| 附录二 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简历 | 第70-71页 |
| 导师简介 | 第71页 |
