| 中文摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| ·本文的研究背景及意义 | 第8-9页 |
| ·近似字符串匹配算法的研究现状 | 第9-14页 |
| ·近似字符串匹配的串行算法 | 第9-13页 |
| ·近似字符串匹配的并行算法 | 第13-14页 |
| ·本文的主要研究内容 | 第14-15页 |
| ·论文结构安排 | 第15-17页 |
| 第2章 基础知识 | 第17-28页 |
| ·GPU的发展 | 第17-18页 |
| ·GPU通用计算 | 第18-22页 |
| ·基于 GPU 的通用计算（GPGPU） | 第18-19页 |
| ·GPGPU的编程方法 | 第19-22页 |
| ·NVIDIA CUDA简介 | 第22-27页 |
| ·CUDA编程模型 | 第22-23页 |
| ·CUDA软件体系 | 第23-25页 |
| ·CUDA存储器模型 | 第25-26页 |
| ·硬件映射 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第3章 允许 k-mismatch 的近似串匹配并行算法 | 第28-45页 |
| ·引言 | 第28页 |
| ·问题描述 | 第28-29页 |
| ·基于CUDA的朴素并行算法 | 第29-33页 |
| ·线程级并行算法 | 第29-31页 |
| ·基于CUDA的两级并行算法 | 第31-33页 |
| ·基于CUDA的两级并行优化算法 | 第33-40页 |
| ·算法描述 | 第34-38页 |
| ·算法的加速比分析 | 第38-40页 |
| ·实验结果与分析 | 第40-43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 允许 k-difference 的近似串匹配并行算法 | 第45-66页 |
| ·引言 | 第45页 |
| ·问题描述 | 第45-47页 |
| ·允许 k-difference 的近似串匹配并行算法 | 第47-56页 |
| ·消除数据依赖关系 | 第48-53页 |
| ·并行算法描述 | 第53-56页 |
| ·算法的加速比分析 | 第56-60页 |
| ·多核CPU环境下算法的加速比分析 | 第56-58页 |
| ·GPU环境下算法的加速比分析 | 第58-60页 |
| ·实验结果与分析 | 第60-65页 |
| ·本章小结 | 第65-66页 |
| 结论 | 第66-68页 |
| 附录 A：CUDA 编程环境的安装与配置 | 第68-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第82页 |
