| 致谢 | 第1-6页 |
| 目录 | 第6-12页 |
| 图目录 | 第9-10页 |
| 表目录 | 第10-11页 |
| 补充材料 | 第11-12页 |
| 缩略词 | 第12-13页 |
| 摘要 | 第13-15页 |
| ABSTRACT | 第15-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-39页 |
| ·引言 | 第18页 |
| ·连锁作图(QTL作图) | 第18-24页 |
| ·定位与定位群体 | 第19-20页 |
| ·F_2定位群体 | 第20页 |
| ·回交定位群体 | 第20-21页 |
| ·重组自交系群体 | 第21-22页 |
| ·双单倍体群体 | 第22页 |
| ·近等位基因系 | 第22-23页 |
| ·连锁作图群体的大小、类型和自交代数 | 第23-24页 |
| ·关联作图 | 第24-34页 |
| ·连锁不平衡以及影响因素 | 第25-28页 |
| ·基于基因组扫描的LD分析 | 第28-29页 |
| ·基于候选基因的LD分析 | 第29-31页 |
| ·关联作图在异花授粉物种中的研究进展 | 第31页 |
| ·关联作图在自花授粉物种中的研究进展 | 第31-34页 |
| ·关联分析与连锁作图的整合 | 第34-39页 |
| 第二章 美国水稻微核心种质库的遗传结构和多样性研究 | 第39-56页 |
| ·引言 | 第39-40页 |
| ·材料与方法 | 第40-43页 |
| ·材料 | 第40-41页 |
| ·性状测定 | 第41页 |
| ·标记测定 | 第41-42页 |
| ·统计分析 | 第42-43页 |
| ·结果分析 | 第43-46页 |
| ·SSR标记概况 | 第43页 |
| ·遗传结构分析 | 第43-45页 |
| ·基因型多样性和分化 | 第45页 |
| ·表型多样性和分化 | 第45-46页 |
| ·基因型分化和表型分化的联系 | 第46页 |
| ·讨论 | 第46-56页 |
| ·在URMC中的遗传多样性 | 第46-47页 |
| ·基因型和表型描述遗传分化 | 第47页 |
| ·多样性和群体结构分析的意义 | 第47-56页 |
| 第三章 利用美国农业部微核心库定位产量相关性状 | 第56-81页 |
| ·引言 | 第56-57页 |
| ·材料与方法 | 第57-61页 |
| ·材料 | 第57-58页 |
| ·表型鉴定 | 第58页 |
| ·基因型鉴定 | 第58-59页 |
| ·统计分析 | 第59-61页 |
| ·结果分析 | 第61-64页 |
| ·表型分析 | 第61页 |
| ·标记概述和群体结构 | 第61-62页 |
| ·连锁不平衡 | 第62页 |
| ·模型比较 | 第62-63页 |
| ·标记和性状的关联性 | 第63-64页 |
| ·讨论 | 第64-81页 |
| ·遗传结构和连锁不平衡 | 第64-65页 |
| ·模型比较 | 第65-66页 |
| ·性状与性状、分子标记与性状之间的关联 | 第66-81页 |
| 第四章 利用关联作图分析收获指数 | 第81-106页 |
| ·引言 | 第81-82页 |
| ·材料与方法 | 第82-86页 |
| ·材料 | 第82-83页 |
| ·试验地点和田间设计 | 第83页 |
| ·表型数据收集 | 第83-84页 |
| ·基因型鉴定 | 第84-85页 |
| ·统计分析 | 第85-86页 |
| ·结果分析 | 第86-89页 |
| ·分子标记概述 | 第86页 |
| ·群体结构和地理起源 | 第86-87页 |
| ·表型分析 | 第87页 |
| ·模型比较、标记和性状之间的关联 | 第87-89页 |
| ·讨论 | 第89-106页 |
| ·遗传多样性和遗传结构 | 第89页 |
| ·表型的环境敏感性和性状之间的相互关系 | 第89-90页 |
| ·收获指数的遗传分析 | 第90-91页 |
| ·收获指数对环境敏感性的遗传基础 | 第91-106页 |
| 第五章 采用关联作图与连锁作图研究水稻直穗病 | 第106-124页 |
| ·引言 | 第106-108页 |
| ·材料和方法 | 第108-111页 |
| ·直穗病的诱导 | 第108页 |
| ·关联作图的材料 | 第108页 |
| ·连锁作图和QTL分析的材料 | 第108页 |
| ·直穗病的评价体系 | 第108-109页 |
| ·关联作图的分子标记 | 第109页 |
| ·连锁作图中的基因池构建 | 第109页 |
| ·PCR和电泳图 | 第109-110页 |
| ·统计分析 | 第110-111页 |
| ·结果 | 第111-113页 |
| ·多态性群体和F_2群体的的表型多样性 | 第111页 |
| ·多样性群体中分子标记概况和遗传结构 | 第111页 |
| ·关联作图的模型比较和关联分析 | 第111-112页 |
| ·基因池 | 第112页 |
| ·连锁作图和QTL分析 | 第112-113页 |
| ·讨论 | 第113-124页 |
| ·遗传多样性和遗传结构 | 第113页 |
| ·模型比较和关联作图 | 第113-114页 |
| ·与qSH-8邻近的两个QTL—“Pi43”和“HD5” | 第114-115页 |
| ·直穗病的连锁作图和关联作图 | 第115-124页 |
| 参考文献 | 第124-140页 |
| 个人简介 | 第140页 |