| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第1章 绪论 | 第7-15页 |
| ·课题背景 | 第7-8页 |
| ·国内外研究概况 | 第8-13页 |
| ·基于距离的建树方法 | 第9-10页 |
| ·最大简约方法 | 第10-11页 |
| ·极大似然法 | 第11-12页 |
| ·建树方法的特点与比较 | 第12-13页 |
| ·本文的主要研究工作 | 第13-14页 |
| ·文章结构 | 第14-15页 |
| 第2章 NJ 法介绍 | 第15-29页 |
| ·距离矩阵法构建进化树的基本过程 | 第15-18页 |
| ·构建进化树 | 第15-17页 |
| ·核苷酸替代模型 | 第17-18页 |
| ·NJ 算法 | 第18-24页 |
| ·NJ 法结果不唯一问题的分析 | 第24-28页 |
| ·传统建树方法的其他问题 | 第28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第3章 NJ 进化树构建方法的改进 | 第29-45页 |
| ·INJ 的基本思想 | 第29页 |
| ·INJ 算法描述 | 第29-38页 |
| ·实验数据与结果分析 | 第38-44页 |
| ·9 个熊细胞色素数据的实验 | 第38-44页 |
| ·算法分析 | 第44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第4章 Multi-Tree 分子进化分析系统的设计与实现 | 第45-64页 |
| ·系统设计原则 | 第45页 |
| ·系统需求 | 第45-47页 |
| ·业务目标 | 第46-47页 |
| ·用户特点 | 第47页 |
| ·系统架构与实现细节 | 第47-48页 |
| ·业务逻辑对象说明 | 第48-51页 |
| ·系统输入输出 | 第51-55页 |
| ·进化树结果 | 第51页 |
| ·项目文件 | 第51页 |
| ·序列文件 | 第51-52页 |
| ·多序列比对结果 | 第52页 |
| ·距离矩阵文件 | 第52-53页 |
| ·进化树的字符串表示 | 第53页 |
| ·系统树的绘制风格 | 第53-55页 |
| ·系统运行环境 | 第55-56页 |
| ·系统打包发布 | 第56-60页 |
| ·系统的安装 | 第60-63页 |
| ·Microsoft(R) .NET Framework2.0 的安装过程 | 第61-62页 |
| ·Multi-Tree 分子进化分析系统的安装 | 第62-63页 |
| ·本章小结 | 第63-64页 |
| 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |