| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1.前言 | 第10-39页 |
| ·红树林及红树林生境中的微生物 | 第10-25页 |
| ·红树林概况 | 第10-12页 |
| ·红树林土壤的基本性质 | 第12-13页 |
| ·红树林生境中的微生物区系 | 第13-18页 |
| ·红树林微生物的生态功能 | 第18-23页 |
| ·红树林微生物资源的开发利用 | 第23-25页 |
| ·微生物的系统发育多样性 | 第25-38页 |
| ·生命三域分类系统 | 第27页 |
| ·系统发育分析的标记分子 | 第27-28页 |
| ·原核生物"种"的概念 | 第28-29页 |
| ·微生物系统发育多样性研究的基本策略 | 第29-30页 |
| ·微生物系统发育多样性研究的基本分子生物学技术 | 第30-32页 |
| ·细菌的系统发育多样性 | 第32-36页 |
| ·古菌的系统发育多样性 | 第36-38页 |
| ·本研究的立题背景和研究意义 | 第38-39页 |
| 2.材料与方法 | 第39-53页 |
| ·材料 | 第39-43页 |
| ·基本方法 | 第43-53页 |
| 3.结果与分析 | 第53-109页 |
| ·红树林土壤样品理化性质 | 第53-54页 |
| ·红树林土壤总DNA提取 | 第54-55页 |
| ·细菌16S rDNA多样性及其系统发育分析 | 第55-81页 |
| ·细菌16S rDNA序列扩增 | 第55页 |
| ·细菌16S rDNA克隆文库构建 | 第55-56页 |
| ·细菌16S rDNA扩增片段的限制性酶切分析 | 第56-58页 |
| ·秋茄林土壤细菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第58-72页 |
| ·无瓣海桑林土壤细菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第72-75页 |
| ·无红树林裸滩沉积物细菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第75-79页 |
| ·不同样地间细菌16S rDNA多样性比较 | 第79-81页 |
| ·古菌16S rDNA多样性及其系统发育分析 | 第81-106页 |
| ·古菌16S rDNA序列扩增 | 第81页 |
| ·古菌16S rDNA克隆文库构建 | 第81-82页 |
| ·古菌16S rDNA扩增片段的限制性酶切分析 | 第82-84页 |
| ·秋茄林土壤古菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第84-94页 |
| ·无瓣海桑林土壤古菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第94-99页 |
| ·无红树林裸滩沉积物古菌16S rDNA多样性及系统发育分析 | 第99-103页 |
| ·不同样地间古菌16S rDNA多样性比较 | 第103-106页 |
| ·本研究所获16S rDNA序列特征分析 | 第106-109页 |
| 4.讨论 | 第109-117页 |
| ·红树林土壤微生物多样性丰富 | 第109-111页 |
| ·红树林土壤微生物——海洋类型还是陆地类型? | 第111-113页 |
| ·无瓣海桑——使林下土壤微生物多样性降低? | 第113-114页 |
| ·红树林土壤中的硫还原菌和产甲烷菌 | 第114-115页 |
| ·红树林土壤中的放线菌 | 第115-116页 |
| ·16S rDNA克隆文库 | 第116-117页 |
| 5.结论 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-138页 |
| 致谢 | 第138-139页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第139页 |
