蛋白质结构数据库的信息挖掘
| 学位论文版权使用授权书 | 第1-5页 |
| 同济大学学位论文原创性声明 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 第1章 前言 | 第12-15页 |
| ·生物信息学简介 | 第12-13页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第13页 |
| ·课题的来源和意义 | 第13-14页 |
| ·论文的主要内容 | 第14-15页 |
| 第2章 数据挖掘 | 第15-25页 |
| ·数据挖掘简介 | 第15页 |
| ·数据挖掘的任务 | 第15-16页 |
| ·数据挖掘对象 | 第16-19页 |
| ·数据挖掘流程 | 第19页 |
| ·数据挖掘的方法 | 第19-21页 |
| ·生物信息数据挖掘的若干领域 | 第21-25页 |
| ·生物序列的比较和相似性分析 | 第21-22页 |
| ·基因组序列信息分析 | 第22-23页 |
| ·蛋白质的结构与功能预测 | 第23-24页 |
| ·基因表达数据的分析和处理 | 第24-25页 |
| 第3章 蛋白质结构数据库的数据挖掘 | 第25-45页 |
| ·数据的预处理 | 第25-27页 |
| ·利用DSSP转换蛋白质二级结构原始数据 | 第25-27页 |
| ·结构序列中结构空位的处理策略 | 第27页 |
| ·结构序列中不合理结构的处理策略 | 第27页 |
| ·PDB库的蛋白质结构序列的分库切片统计 | 第27-29页 |
| ·蛋白质切片的含义 | 第27-28页 |
| ·蛋白质切片的分库统计 | 第28-29页 |
| ·结构概率 | 第29页 |
| ·基本统计数据 | 第29-34页 |
| ·PDB数据库的蛋白质数据挖掘 | 第34-45页 |
| ·对存在的蛋白质二级结构进行统计 | 第34-35页 |
| ·对一定长度序列对应的二级结构进行统计分析 | 第35-37页 |
| ·对四个子库中的序列进行序列追踪分析 | 第37-39页 |
| ·可视化分析 | 第39-45页 |
| 第四章 基于统计信息数据库的蛋白质结构预测 | 第45-65页 |
| ·蛋白质结构预测方法 | 第45-52页 |
| ·蛋白质结构预测基本流程 | 第45-48页 |
| ·蛋白质结构预测的基本方法 | 第48-49页 |
| ·从氨基酸序列推测蛋白质的二级结构 | 第49-51页 |
| ·蛋白质二级结构预测结果的评估 | 第51-52页 |
| ·基于统计信息数据库的构成 | 第52-53页 |
| ·基于统计信息数据库的蛋白结构预测 | 第53-65页 |
| ·基于统计信息数据库的蛋白结构预测的初步设想 | 第53-58页 |
| ·基于统计信息数据库的蛋白结构预测的改进 | 第58-65页 |
| 第五章 结果与讨论 | 第65-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-71页 |
