| 中文摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-22页 |
| ·课题研究的背景及意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状与发展动态 | 第10-13页 |
| ·用于环境微生物的分子生物学技术 | 第10-11页 |
| ·国内外PCR-DGGE 在环境微生物领域的应用 | 第11-13页 |
| ·研究中用到的主要分子生物学技术 | 第13-18页 |
| ·样品基因组DNA 的提取与纯化 | 第13-14页 |
| ·聚合酶链式反应简介 | 第14-17页 |
| ·变性梯度凝胶电泳概况 | 第17-18页 |
| ·生物多样性、DNA 克隆测序及微生物分类鉴定 | 第18-20页 |
| ·生物多样性 | 第18-19页 |
| ·基因组片段克隆测序 | 第19-20页 |
| ·系统发育分析 | 第20页 |
| ·主要研究目的和内容 | 第20-22页 |
| 第二章 研究的技术路线、方法和材料 | 第22-32页 |
| ·研究采用的技术路线 | 第22-23页 |
| ·总基因组DNA 的提取 | 第23-24页 |
| ·样品预处理 | 第23页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第23-24页 |
| ·样品DNA 的PCR 扩增 | 第24-26页 |
| ·总细菌的降落式PCR 扩增 | 第24-25页 |
| ·氨氧化菌的嵌套式PCR 扩增 | 第25页 |
| ·硝酸菌的嵌套式PCR 扩增 | 第25-26页 |
| ·反硝化细菌的嵌套式PCR 扩增 | 第26页 |
| ·聚合酶链式反应扩增所用试剂 | 第26页 |
| ·样品DNA 的PCR 扩增及产物检测 | 第26-27页 |
| ·基因组DNA 提取产物检测 | 第27页 |
| ·聚合酶链式反应扩增结果检测 | 第27页 |
| ·琼脂糖电泳所用试剂 | 第27页 |
| ·聚合酶链式反应产物的DGGE 分析 | 第27-29页 |
| ·具体操作步骤 | 第27-28页 |
| ·所用试剂及其配制 | 第28-29页 |
| ·多样性信息度量指数 | 第29页 |
| ·聚合酶链式反应产物的变性梯度凝胶电泳分析 | 第29-30页 |
| ·凝胶片段的回收及克隆测序 | 第30页 |
| ·系统进化树的构建 | 第30-31页 |
| ·准备工作 | 第30页 |
| ·系统进化树的构建步骤 | 第30-31页 |
| ·主要实验仪器 | 第31-32页 |
| 第三章 贫营养条件下微生物群落结构的演替 | 第32-53页 |
| ·研究方法与取样条件 | 第32-34页 |
| ·样品编号 | 第34页 |
| ·洗浴水MBR 总细菌种群的多样性分析 | 第34-40页 |
| ·总细菌DNA 提取结果 | 第34-35页 |
| ·总细菌DNA 的PCR 扩增 | 第35页 |
| ·总细菌PCR 扩增产物的变性梯度凝胶电泳分离 | 第35-37页 |
| ·总细菌Shannnon-Wiener 多样性指数分析 | 第37-38页 |
| ·总细菌DGGE 图谱相似性分析 | 第38-40页 |
| ·总细菌种群聚类分析 | 第40页 |
| ·工业园区MBR 总细菌种群的多样性分析 | 第40-45页 |
| ·总细菌DNA 提取结果 | 第40-41页 |
| ·总细菌DNA 的PCR 扩增 | 第41页 |
| ·总细菌PCR 扩增产物的DGGE 分离 | 第41-42页 |
| ·总细菌Shannon-Wiener 多样性指数分析 | 第42-43页 |
| ·总细菌DGGE 图谱相似性分析 | 第43-44页 |
| ·总细菌种群聚类分析 | 第44-45页 |
| ·总细菌优势菌属DNA 片段克隆测序结果 | 第45-49页 |
| ·系统发育树的构建 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 贫营养条件下氨氧化菌等种群结构的演替与分析 | 第53-77页 |
| ·氨氧化菌种群结构多样性分析 | 第53-61页 |
| ·样品编号 | 第53页 |
| ·氨氧化菌DNA 的嵌套式PCR 扩增 | 第53-54页 |
| ·氨氧化菌扩增产物变性梯度凝胶电泳分析 | 第54-56页 |
| ·氨氧化菌Shannon-Wiener 多样性指数分析 | 第56-57页 |
| ·氨氧化菌DGGE 图谱相似性分析 | 第57-60页 |
| ·氨氧化菌DGGE 图谱聚类分析 | 第60-61页 |
| ·硝酸菌种群结构分析 | 第61-69页 |
| ·硝酸菌DNA 的嵌套式PCR 扩增 | 第61-63页 |
| ·硝酸菌扩增产物变性梯度凝胶电泳分析 | 第63-65页 |
| ·硝酸菌Shannon-Wiener 多样性指数分析 | 第65-66页 |
| ·硝酸菌DGGE 图谱相似性分析 | 第66-68页 |
| ·硝酸菌DGGE 图谱聚类分析 | 第68-69页 |
| ·反硝化细菌种群多样性分析 | 第69-76页 |
| ·反硝化细菌DNA 的嵌套式PCR 扩增 | 第69-70页 |
| ·反硝化细菌的变性梯度凝胶电泳分析 | 第70-72页 |
| ·反硝化细菌Shannon-Wiener 多样性指数分析 | 第72-73页 |
| ·反硝化细菌DGGE 图谱相似性分析 | 第73-75页 |
| ·反硝化细菌DGGE 图谱聚类分析 | 第75-76页 |
| ·本章小结 | 第76-77页 |
| 第五章 结论与建议 | 第77-79页 |
| ·结论 | 第77-78页 |
| ·建议 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-84页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
