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转基因植物及产品核酸检测新技术研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-12页
英文缩写一览表第12-14页
第一章 绪论第14-43页
   ·转基因植物第14-15页
   ·全球转基因作物商业化种植、应用现状第15-17页
   ·转基因生物安全性评价和管理第17-24页
     ·主要国际组织对于转基因生物的安全管理第18-20页
       ·国际食品法典委员会 (CAC)第18页
       ·经济发展合作组织 (OECD)第18-19页
       ·国际作物生命协会 (CropLife International)第19-20页
       ·国际标准化组织 (ISO)第20页
     ·主要国家对转基因生物的安全管理第20-24页
       ·欧盟第21-22页
       ·美国第22页
       ·日本第22-23页
       ·中国第23-24页
   ·转基因及其产品检测方法第24-40页
     ·基于蛋白质的检测技术第25-26页
     ·基于核酸的DNA 扩增、产物检测技术第26-36页
       ·植物基因组DNA 提取和纯化第27页
       ·基因组DNA 浓度测定和评价第27-28页
       ·植物基因组DNA 质量和拷贝数换算第28页
       ·内标准基因和阳性参考物质第28-30页
       ·定性PCR 检测方法第30-31页
       ·定量PCR 检测方法第31-34页
         ·竞争性定量PCR第32页
         ·实时荧光定量PCR第32-34页
       ·核酸等温扩增技术第34-35页
       ·DNA 芯片或DNA 微阵列 (DNA Microarrays) 技术第35-36页
       ·生物传感器 (Biosensors)第36页
     ·转基因植物检测技术标准化第36-37页
     ·转基因产品检测方法数据库第37-38页
     ·未批准转基因植物检测第38页
     ·转基因植物及产品检测方法发展趋势及展望第38-40页
   ·本课题研究的目的、内容和意义第40-43页
第二章 番木瓜内源参照基因及“华农1 号”转基因番木瓜品系特异性检测方法研究第43-73页
   ·实验材料、试剂与仪器第44-45页
     ·植物材料第44页
     ·常用试剂第44-45页
     ·主要仪器设备第45页
   ·实验方法第45-54页
     ·植物基因组DNA 提取和纯化第45-46页
     ·基因组DNA 浓度测定和评价第46页
     ·番木瓜内源参照基因检测方法建立第46-51页
       ·番木瓜内源参照基因的查找第46-48页
       ·番木瓜内源参照基因定性、定量PCR 引物设计第48页
       ·CHY 基因定性PCR 反应体系和条件第48页
       ·CHY 基因定量PCR 反应体系和条件第48-49页
       ·CHY 内源参照基因的PCR 验证第49-50页
         ·CHY 内源参照基因种内非特异性验证第49页
         ·CHY 基因种间特异性验证第49页
         ·CHY 基因拷贝数评估第49-50页
       ·CHY 基因特异性PCR 检测灵敏度第50页
       ·CHY 基因在转基因番木瓜检测中的应用第50-51页
     ·“华农1 号”番木瓜品系特异性定性、定量检测方法研究第51-54页
       ·“华农1 号”番木瓜外源插入基因及其旁邻序列信息分析第51-52页
       ·“华农1 号”番木瓜品系特异性PCR 引物、探针设计第52页
       ·定性、定量PCR 反应体系和反应条件的建立第52-54页
         ·定性PCR 反应体系和条件第52-54页
         ·定量PCR 反应体系和条件第54页
     ·结果与分析第54-71页
     ·番木瓜内源参照基因检测方法建立第54-62页
       ·番木瓜内源参照基因的筛选第54-55页
       ·CHY 内源参照基因的验证第55-57页
         ·CHY 基因种间特异性鉴定第55页
         ·CHY 基因种内非特异性检测第55-56页
         ·CHY 基因在番木瓜中的拷贝数评估第56-57页
       ·CHY 基因测序分析第57-58页
       ·CHY 基因定性PCR 的灵敏度第58页
       ·CHY 基因定量PCR 检测第58-60页
         ·定量PCR 检测体系的检测极限(LOD) 和定量极限(Limit of Quantitation, LOQ)。第58-59页
         ·标准曲线构建第59-60页
         ·定量PCR 检测体系的重复性和重演性第60页
       ·番木瓜内源参照基因CHY 可应用性检测第60-62页
     ·“华农1 号”番木瓜品系特异性定性、定量检测方法研究第62-71页
       ·“华农1 号”番木瓜外源基因表达框的结构和序列信息第62-65页
       ·外源整合序列的特征描述第65-67页
       ·“华农1 号”番木瓜品系特异性定性PCR 检测方法第67-68页
       ·“华农1 号”番木瓜品系特异性定量检测方法第68-70页
         ·定量PCR 检测体系的LOD 和LOQ第69页
         ·标准曲线构建第69-70页
         ·品系特异性定量PCR 检测体系的重复性和重演性第70页
       ·应用建立的品系特异性检测方法对实际转基因番木瓜样品的定量分析第70-71页
   ·本章小结和讨论第71-73页
第三章 基于复合兼并引物PCR 的转基因作物高通量筛选检测方法研究第73-89页
   ·实验材料、试剂与仪器第74-75页
     ·植物材料第74页
     ·常用试剂第74页
     ·主要仪器设备第74-75页
   ·实验方法第75-79页
     ·植物基因组DNA 提取和纯化第75页
     ·基因组DNA 浓度测定和评价第75页
     ·DNA 样品制备第75-77页
     ·外源插入基因基因序列分析第77页
     ·兼并PCR 引物设计第77-78页
     ·兼并PCR 扩增体系的建立第78页
     ·兼并PCR 扩增方法验证第78-79页
       ·兼并PCR 扩增方法特异性验证第78-79页
       ·兼并PCR 扩增方法灵敏度检测第79页
     ·复合兼并PCR 扩增方法检测实际样品第79页
   ·结果与分析第79-88页
     ·外源插入基因基因序列分析第79-82页
       ·mCry3A 和Cry3Bb1 基因序列分析第80-81页
       ·CP4-EPSPS 基因序列分析第81页
       ·bar 和pat 基因序列分析第81-82页
       ·Cry1Ab、Cry1Ac 和Cry1A(b/c)基因序列分析第82页
     ·兼并PCR 扩增方法建立第82-86页
       ·兼并PCR 扩增方法特异性验证第82-85页
         ·mCry3-F/R PCR 反应体系特异性检测第82-83页
         ·mCP4ES-F/R PCR 反应体系特异性检测第83页
         ·mPAT-F/R PCR 反应体系特异性检测第83-84页
         ·mCry1A-F/R PCR 反应体系特异性检测第84页
         ·复合兼并引物PCR 方法特异性检测第84-85页
       ·兼并PCR 扩增方法灵敏度检测第85-86页
     ·实际样品检测评估4 重复合兼并PCR 扩增方法的可应用性第86-88页
   ·本章小结和讨论第88-89页
第四章 MPIC:一种新的基于毛细管凝胶电泳检测的微滴聚合酶链式反应分析方法研究第89-107页
   ·实验材料、试剂与仪器第90-91页
     ·植物材料第90页
     ·试剂第90-91页
     ·主要仪器设备第91页
   ·实验方法第91-98页
     ·植物基因组DNA 提取和纯化第91-92页
     ·基因组DNA 浓度测定和评价第92页
     ·DNA 样品制备第92-93页
     ·通用引物设计第93页
     ·目标特异性引物设计第93-95页
     ·单重PCR 扩增体系和程序第95页
     ·MPIC 方法的建立第95-97页
       ·复合模板的合成第95-96页
       ·微滴制备第96-97页
       ·微滴PCR 扩增第97页
       ·毛细管凝胶电泳检测微滴PCR 产物第97页
     ·MPIC 方法的实际应用性检测第97-98页
   ·结果与分析第98-106页
     ·MPIC 方法的设计和原理第98-99页
     ·MPIC 方法中微滴的热稳定性评估第99页
     ·MPIC 方法优化第99-102页
       ·DNA 聚合酶的选择第100-101页
       ·引物浓度第101页
       ·纯化/不纯化复合模板对MPIC 方法的影响第101-102页
       ·预扩增循环数对MPIC 的影响第102页
     ·八重MPIC 方法中PCR 扩增特异性检测第102-103页
     ·八重MPIC 方法方法灵敏度检测第103页
     ·MPIC 方法的灵活性第103-104页
     ·实际样品检测评估MPIC 方法的可应用性第104-106页
   ·本章小结和讨论第106-107页
第五章 结论第107-108页
参考文献第108-127页
附录第127-131页
致谢第131-132页
攻读博士学位期间已发表或录用的论文第132-136页
附件第136页

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