| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| ·背景 | 第11-12页 |
| ·反转排序 | 第12-13页 |
| ·有向基因组的反转排序问题 | 第12页 |
| ·无向基因组的反转排序问题 | 第12-13页 |
| ·转位排序 | 第13页 |
| ·移位排序 | 第13-14页 |
| ·有向基因组移位排序 | 第14页 |
| ·无向基因组移位排序 | 第14页 |
| ·多种操作排序 | 第14-15页 |
| ·反转与转位排序 | 第14-15页 |
| ·反转与移位排序 | 第15页 |
| ·基因重组排序的最小权重问题 | 第15-16页 |
| ·本文的组织 | 第16-17页 |
| 第2章 基础知识 | 第17-24页 |
| ·重组操作与排序距离 | 第17-19页 |
| ·线排列与圈排列 | 第19-20页 |
| ·断点图 | 第20-22页 |
| ·(g,b)-split与(g,b)-padding | 第22-24页 |
| 第3章 有向基因组反转和转位排序问题 | 第24-32页 |
| ·下界 | 第24-25页 |
| ·3-permutation和3-cycle | 第25-26页 |
| ·圈交错 | 第26-27页 |
| ·圈相交 | 第27-29页 |
| ·1-twisted pair | 第29-30页 |
| ·1.5近似度算法 | 第30-31页 |
| ·Sort(π)的性能比分析 | 第31-32页 |
| 第4章 有向基因组反转和转位排序的最小权重问题 | 第32-41页 |
| ·下界 | 第33-34页 |
| ·处理2-cycle | 第34页 |
| ·5-cycle的基本性质 | 第34-36页 |
| ·处理3-cycle | 第36-37页 |
| ·1.5k近似度算法 | 第37-38页 |
| ·一个重要的不等式 | 第38-39页 |
| ·Weight-Sort(π)的性能比分析 | 第39-41页 |
| 第5章 算法实现 | 第41-53页 |
| ·基本数据结构 | 第42-46页 |
| ·permutation类 | 第42-43页 |
| ·node类 | 第43-44页 |
| ·black_edge和gray_edge类 | 第44-45页 |
| ·cycle类 | 第45-46页 |
| ·breakpoint_graph类 | 第46-50页 |
| ·初始化 | 第46-47页 |
| ·安全的(g,b)-split | 第47-49页 |
| ·Operation重组操作 | 第49-50页 |
| ·Query | 第50页 |
| ·试验结果 | 第50-53页 |
| 第6章 总结 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 攻读硕士学位期间的学术论文目录 | 第57-58页 |
| 在读期间参与科研项目情况 | 第58-59页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第59页 |