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绵羊胴体成分性状QTL的元分析及相关基因的克隆、时空表达谱分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
第一章 前言第13-19页
 1 研究背景第13-17页
   ·绵羊基因组中QTL定位结果存在的问题第13-14页
   ·QTL的整合图谱第14-15页
   ·整合后QTL的元分析第15-16页
   ·绵羊的比较基因组图第16页
   ·绵羊胴体成分性状的复杂遗传机理第16-17页
 2 本研究的主要目的和内容第17-19页
第二章 文献综述第19-41页
 1 绵羊遗传连锁图的绘制第19-23页
   ·实验群体设计第19-20页
   ·目前绘制绵羊遗传连锁图的主要资源参考家系第20-22页
   ·绵羊遗传连锁图的研究进展第22-23页
 2 绵羊物理图谱和比较图谱第23-25页
   ·绵羊物理图谱的研究进展第23-24页
   ·绵羊比较图谱的研究进展第24-25页
 3 绵羊QTL定位的主要方法第25-28页
   ·候选基因法第25页
   ·基因组扫描法第25-28页
     ·标记分析第26页
     ·区间作图法第26-27页
     ·复合区间作图法第27页
     ·多区间作图法第27-28页
 4 绵羊的网络资源第28页
 5 生肌调节因子家族研究进展第28-41页
   ·生肌调节因子家族概述第28-29页
   ·MYOD基因的研究进展第29-32页
     ·MYOD基因结构与功能第29-30页
     ·MYOD基因的表达及调控因子第30-32页
   ·MYOG基因的研究进展第32-34页
     ·MYOG基因的结构与功能第32-33页
     ·MYOG基因的突变及其对性状的影响第33-34页
   ·MYF5和MYF6基因的研究进展第34-36页
     ·MYF5和MYF6基因的结构和功能第34-35页
     ·MYF5和MYF6基因的表达及调控因子第35-36页
   ·Myostatin基因的研究进展第36-41页
     ·Myostatin基因的结构与功能第37-38页
     ·Myostatin基因的表达及调控因子第38-41页
第三章 胴体性状QTL的元分析及候选基因的关联第41-67页
 1 数据和方法第41-49页
   ·QTL文献信息的收集第41-42页
   ·QTL定位信息的收集第42-46页
   ·QTL映射第46-47页
   ·元分析第47-48页
   ·胴体相关基因与元QTL的关联分析及位置候选基因的筛选第48-49页
 2 结果与分析第49-61页
   ·影响胴体成分的QTL的整合及在绵羊基因组的分布第49-52页
   ·影响胴体成分QTL元分析第52-59页
   ·元QTL与候选基因的关联及位置候选基因的筛选第59-61页
 3 讨论第61-67页
   ·绵羊胴体成分及相关性状的定位结果第61-64页
   ·QTL的映射整合第64页
   ·QTL的元分析第64-65页
   ·候选基因与MQTL的关联第65-67页
第四章 MSTN基因和MRF家族的组织和时间表达差异分析第67-97页
 1 材料与方法第67-75页
   ·实验材料第67-69页
     ·样品的采集第67页
     ·主要仪器设备和试剂第67-68页
     ·常用试剂的配制第68-69页
   ·实验方法第69-75页
     ·提取RNA器皿的处理第69-70页
     ·总RNA的提取第70页
     ·RNA样品的琼脂糖凝胶电泳检测第70页
     ·反转录第70-71页
     ·引物设计第71-72页
     ·常规PCR第72-73页
     ·PCR扩增产物的胶回收第73-74页
     ·标准品的制备第74页
     ·实时荧光定量PCR第74-75页
   ·数据处理第75页
 2 结果与分析第75-90页
   ·组织总RNA提取结果第75-76页
   ·普通PCR的扩增结果第76页
   ·荧光定量PCR结果第76-90页
     ·扩增曲线和标准曲线第76-79页
     ·扩增产物的特异性第79-80页
     ·日龄及组织差异对MSTN和MRF家族基因表达的影响第80页
     ·MSTN基因的组织和日龄特异性表达第80-82页
     ·MYOG基因的组织和日龄特异性表达第82-84页
     ·MYOD基因的组织和日龄特异性表达第84-85页
     ·MYF5基因的组织和日龄特异性表达第85-87页
     ·MYF6基因的组织和日龄特异性表达第87-88页
     ·MRF家族基因肌肉中表达量的相关分析第88-90页
 3 讨论第90-97页
   ·MSTN基因的时间特异性表达第90页
   ·MSTN基因的组织特异性表达第90-91页
   ·MYOD、MYOG和MYF5基因的时间特异性表达第91-92页
   ·MYF6基因的时间特异性表达第92-93页
   ·MRF家族时间特异性表达与家族成员具体功能的联系第93-97页
第五章 绵羊MYOG和MYF6基因cDNA克隆及其序列分析第97-129页
 1 材料与方法第97-101页
   ·实验材料第97页
   ·仪器与试剂第97页
   ·实验方法第97-101页
     ·总RNA的提取第97页
     ·RNA样品的琼脂糖凝胶电泳检测第97页
     ·引物设计第97-98页
     ·反转录反应第98页
     ·RT-PCR扩增第98-99页
     ·PCR扩增检测第99页
     ·RT-PCR产物克隆第99-100页
     ·扩增子菌液PCR鉴定第100页
     ·测序第100-101页
     ·序列分析及蛋白质预测第101页
 2 结果与分析第101-125页
   ·MYOG基因克隆和序列分析第101-111页
     ·RNA提取结果第101页
     ·RT-PCR的扩增结果第101页
     ·MYOG基因重组菌液PCR的鉴定第101-102页
     ·MYOG基因的序列测定及同源性分析第102-103页
     ·MYOG基因的序列与普通牛的分析第103-105页
     ·MYOG基因的氨基酸序列与普通牛的氨基酸比对第105-106页
     ·MYOG基因编码蛋白质的组成、分子量、等电点的分析第106-107页
     ·MYOG编码蛋白疏水性分析第107-108页
     ·MYOG编码蛋白信号肽分析第108页
     ·MYOG编码蛋白跨膜结构分析第108-109页
     ·MYOG编码蛋白糖基化位点预测第109-110页
     ·MYOG编码蛋白质二级结构预测第110页
     ·MYOG基因的分子进化分析第110-111页
   ·MYF6基因克隆和序列分析第111-122页
     ·RNA提取效果第111页
     ·RT-PCR的扩增结果第111-112页
     ·MYF6基因重组菌液PCR的鉴定第112页
     ·MYF6基因的序列测定及同源性分析第112-114页
     ·MYF6基因的序列与普通牛的分析第114-116页
     ·MYF6基因的氨基酸序列与普通牛的氨基酸比对第116-117页
     ·MYF6基因编码蛋白质的组成、分子量、等电点的分析第117-118页
     ·MYF6编码蛋白疏水性分析第118页
     ·MYF6编码蛋白信号肽分析第118-119页
     ·MYF6编码蛋白跨膜结构分析第119-120页
     ·MYF6编码蛋白糖基化位点预测第120页
     ·MYF6所编码蛋白质的二级结构预测第120-121页
     ·MYF6基因的分子进化分析第121-122页
   ·MRF家族基因编码区的同源性分析第122-125页
 3 讨论第125-129页
   ·MYOG基因的序列分析第125页
   ·MYOG基因的多态性第125-126页
   ·MRF基因家族基因的同源性第126-129页
第六章 结论与展望第129-135页
 1 本研究总结第129-133页
   ·文献信息收集和群体第129-130页
   ·QTL的映射整合第130页
   ·映射后QTL的元分析第130-131页
   ·元QTL与候选基因的关联第131页
   ·MSTN的组织和时间差异表达第131-132页
   ·MYOG、MYOD和MYF5基因的时间差异表达第132页
   ·MYF6基因的时间差异表达第132-133页
   ·MRF家族时间特异性表达与家族成员具体功能的联系第133页
   ·MYOG和MYF6的CDS区克隆研究第133页
 2 下一步的研究思路第133-135页
参考文献第135-145页
致谢第145-146页
博士在读期间发表的论文第146页

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