| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-8页 |
| 第一章 综述 | 第8-27页 |
| 第一节 分子标记与单核苷酸多态性（SNP） | 第8-12页 |
| ·分子标记技术的发展 | 第8-10页 |
| ·分子标记的应用领域 | 第10页 |
| ·SNP 概述 | 第10-12页 |
| 第二节 SNP 标记开发概述 | 第12-22页 |
| ·从已有的EST数据库中开发SNP标记 | 第12-14页 |
| ·SNP 开发与生物信息学 | 第14-18页 |
| ·SNP的检测方法 | 第18-22页 |
| 第三节 SNP分子标记在水产养殖动物中的应用 | 第22-26页 |
| ·构建水产动物遗传连锁图谱 | 第22-23页 |
| ·SNP 在群体遗传学中种群进化和亲缘关系的应用 | 第23页 |
| ·SNP 在基因连锁不平衡、关联分析和功能学方面的应用 | 第23-25页 |
| ·SNP 在牡蛎生物学研究中的应用 | 第25-26页 |
| 第四节 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 第二章 基于长牡蛎 EST 数据库获得候选 SNP 位点 | 第27-37页 |
| 前言 | 第27-28页 |
| 第一节 实验材料与方法 | 第28-31页 |
| ·长牡蛎 EST 序列的获得 | 第28页 |
| ·长牡蛎 EST 序列的聚类和拼接 | 第28-29页 |
| ·从下载的 EST 文件中设置筛选 SNP 的标准 | 第29-30页 |
| ·长牡蛎 SNP 位点类型的统计 | 第30页 |
| ·含有长牡蛎 SNP 的 EST 功能推测 | 第30-31页 |
| 第二节 试验结果与分析 | 第31-34页 |
| ·基于 EST 数据库开发的候选 SNP 数目及类型统计 | 第31-32页 |
| ·SNP 类型统计 | 第32-33页 |
| ·含有候选 SNP 位点的 EST 功能分析 | 第33-34页 |
| 第三节 讨论 | 第34-37页 |
| 第三章 利用 FLDAS-PCR 对候选 SNP 进行分型检测 | 第37-47页 |
| 前言 | 第37-38页 |
| 第一节 实验材料 | 第38-39页 |
| ·DNA 模板制备及鉴定 | 第38-39页 |
| ·主要试剂和主要仪器 | 第39页 |
| 第二节 实验方法 | 第39-41页 |
| ·FLDAS-PCR 引物的设计方式及 FLDAS-PCR 原理 | 第39-40页 |
| ·DNA 扩增及 SNP 分型 | 第40-41页 |
| ·PCR产物检测 | 第41页 |
| ·测序分析确认FLDAS-PCR结果 | 第41页 |
| 第三节 实验结果与分析 | 第41-45页 |
| ·基因组 DNA 提取情况 | 第41-42页 |
| ·EST-SNP 位点的 FLDAS- PCR 验证 | 第42-43页 |
| ·测序分析确认结果 | 第43-44页 |
| ·引物设计与优化 | 第44-45页 |
| 第四节 讨论 | 第45-47页 |
| 第四章 长牡蛎 SNP 位点群体多态性分析及功能预测 | 第47-54页 |
| 第一节 材料与方法 | 第47-48页 |
| ·实验材料 | 第47页 |
| ·多态性分析方法 | 第47-48页 |
| 第二节 实验结果与分析 | 第48-53页 |
| ·根据FLDAS-PCR 基因分型结果的基因型统计 | 第48-49页 |
| ·基因型数据分析 | 第49-50页 |
| ·17 个长牡蛎 SNP 位点的功能预测 | 第50-53页 |
| 第三节 讨论 | 第53-54页 |
| 实验总结 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 致谢 | 第63页 |
