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酵母甘油代谢工程与基因组重排构建乙醇高产菌株及相关机理研究

致谢第1-11页
英文缩略词第11-13页
摘要第13-15页
Abstract第15-17页
第一章 文献综述第17-36页
   ·工业微生物的遗传育种第17-29页
     ·引言第17-18页
     ·基因代谢网络的育种策略第18-24页
       ·单一基因操作的育种第19-20页
       ·代谢网络工程的育种第20-24页
     ·细胞水平的全基因组育种策略第24-28页
       ·自然选育与随机诱变第25-26页
       ·杂交与融合育种技术第26页
       ·全基因组定向进化第26-27页
       ·全基因组重排第27-28页
     ·小结第28-29页
   ·应用于酵母遗传操作的标记第29-34页
     ·引言第29页
     ·营养缺陷型标记第29-30页
     ·抗性标记第30-31页
     ·细胞学标记第31-32页
     ·分子标记第32-33页
     ·小结第33-34页
   ·本工作研究目的与研究内容第34-36页
第二章 工业酿酒酵母出发菌株的筛选第36-46页
   ·前言第36页
   ·材料第36-39页
     ·菌株第36页
     ·主要试剂第36-37页
     ·实验试剂的配制第37-38页
     ·培养基的配制第38-39页
     ·主要仪器第39页
   ·方法第39-41页
     ·发酵性能测定第39-40页
       ·发酵工艺流程第39-40页
       ·发酵产物分析第40页
     ·酵母单倍体分离与鉴定第40-41页
       ·诱导孢子形成的方法第40页
       ·子囊孢子的分离和单倍体的获得第40页
       ·酵母单倍体的鉴定第40-41页
       ·单倍体交配型鉴定第41页
     ·酵母单倍体杂交与鉴定第41页
       ·单倍体的杂交第41页
       ·重组子的鉴定第41页
   ·结果第41-44页
     ·酿酒酵母菌株单倍体的分离与鉴定第41-43页
       ·酿酒酵母菌株单倍体的分离第41-42页
       ·单倍体发酵性能测定及交配型鉴定第42-43页
     ·杂交获得优良酵母重组子第43-44页
   ·讨论第44-45页
   ·本章小结第45-46页
第三章 利用RAPD-SCAR分子标记筛选细胞融合重组子第46-72页
   ·前言第46页
   ·材料第46-51页
     ·菌株第46-47页
     ·主要试剂第47页
     ·实验试剂的配制第47-50页
       ·酵母基因组DNA提取主要试剂第47-48页
       ·琼脂糖凝胶电泳所用试剂第48页
       ·原生质体制备与电融合所用试剂第48-49页
       ·脉冲场凝胶电泳(PFGE)所用试剂第49-50页
     ·培养基的配制第50页
     ·主要仪器第50-51页
   ·方法第51-58页
     ·酵母基因组DNA的提取第51页
     ·RAPD反应分析第51-53页
       ·RAPD引物第51-52页
       ·RAPD扩增第52-53页
     ·目的条带的回收与TA克隆第53-55页
       ·目的条带的割胶回收第53页
       ·目的条带与T载体的连接第53-54页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第54页
       ·连接产物转化大肠杆菌感受态细胞第54页
       ·菌落PCR挑选转化子第54-55页
     ·特异序列片段扩增(SCAR)引物的设计第55页
     ·原生质体的制备与电融合第55-57页
       ·原生质体制备第55-56页
       ·原生质体再生第56-57页
       ·原生质体电融合第57页
     ·脉冲场凝胶电泳(PFGE)对酵母核型的分析第57-58页
       ·酵母菌染色体DNA样品制备第57-58页
       ·脉冲场凝胶电泳(PFGE)第58页
   ·结果第58-69页
     ·菌株Z8和Z9的RAPD分析第58-60页
     ·RAPD-SCAR分子标记转化第60-61页
     ·原生质体的制备与电融合第61-63页
       ·原生质体制备条件优化第61-63页
       ·原生质体的电融合第63页
     ·Z8和Z9重组子的检测第63-66页
       ·SCAR分子标记筛选杂合重组子第63-64页
       ·杂合重组子的验证第64-66页
     ·重组子与亲株发酵性能的比较第66-69页
   ·讨论第69-70页
     ·分子标记在工业菌株中的应用第69页
     ·RAPD标记到SCAR标记的转化第69-70页
     ·原生质融合重组子第70页
   ·本章小结第70-72页
第四章 甘油代谢工程构建乙醇高产菌株第72-110页
   ·前言第72-73页
   ·材料第73-79页
     ·菌株与质粒第73-76页
     ·主要试剂第76页
     ·实验试剂配制第76-77页
       ·酵母细胞转化所用试剂第76-77页
       ·氨基酸的配制第77页
       ·GAPN酶活测定所用试剂第77页
     ·培养基的配制第77-78页
     ·实验仪器第78-79页
   ·方法第79-84页
     ·细菌基因组DNA的提取第79-80页
     ·目的条带的回收与克隆第80-81页
       ·目的条带的割胶回收第80页
       ·目的片段与载体的酶切第80-81页
       ·目的片段与载体的连接第81页
     ·质粒DNA的抽提第81-82页
     ·酵母细胞的转化第82页
     ·酵母蛋白的提取与含量测定第82-83页
       ·蛋白的提取第82-83页
       ·蛋白含量测定第83页
     ·NADP~+依赖型GAPN酶活测定第83-84页
       ·酶活的测定第83页
       ·酶活的计算方法第83-84页
     ·抗性标记辅助筛选酵母重组子第84页
   ·实验结果第84-106页
     ·构建FPS1基因缺失的实验单倍体菌株第84-87页
       ·构建pUG6FAB质粒第84-86页
       ·FPS1基因的敲除与检测第86-87页
     ·染色体外表达异源gapN基因第87-92页
       ·构建异源gapN基因表达质粒第87-91页
       ·gapN基因异源表达与酶活测定第91-92页
     ·实验菌株发酵性能测定第92-96页
       ·生长特性和葡萄糖底物消耗第92-93页
       ·代谢副产物的生成第93页
       ·乙醇的生成第93-96页
     ·构建FPS1基因位点整合异源gapN基因的工业酿酒菌株第96-102页
       ·构建pUG7FAB质粒第96-97页
       ·构建pUG6FG和pUG7FG质粒第97-99页
       ·FPS1基因位点整合异源gapN基因的工业单倍体菌株第99-101页
       ·基因改造工业单倍体菌株杂交及重组子的筛选第101-102页
     ·构建FPS1基因缺失的二倍体菌株第102页
     ·构建的工业酵母菌株特性测定第102-106页
       ·GAPN酶活测定第102页
       ·发酵特性测定第102-106页
   ·讨论第106-108页
     ·FPS1基因敲除对酵母菌株发酵性能的影响第106-107页
     ·表达异源gapN基因对酵母菌株发酵性能的影响第107页
     ·FPS1基因缺失与异源GAPN酶系的协同效应第107-108页
     ·基因代谢工程改良酿酒酵母菌株发酵性能第108页
   ·本章小结第108-110页
第五章 利用改进的全基因组重排技术提高菌株乙醇耐受力第110-129页
   ·前言第110页
   ·材料第110-113页
     ·菌株与质粒第110-111页
     ·主要试剂第111-112页
     ·实验试剂的配制第112页
       ·诱变试剂的配制第112页
       ·染色液的配制第112页
     ·培养基的配制第112-113页
     ·实验仪器第113页
   ·方法第113-114页
     ·EMS诱变第113页
     ·紫外诱变第113-114页
     ·菌株乙醇耐受力测定第114页
       ·生长曲线测定第114页
       ·细胞膜完整性分析第114页
   ·结果第114-126页
     ·诱变剂的选择第114-116页
       ·EMS诱变第114-115页
       ·紫外诱变第115-116页
     ·全基因组重排第116-123页
       ·抗性标记辅助的全基因组重排第116-117页
       ·乙醇耐受力分析第117-119页
       ·重组子的发酵性能第119-123页
     ·Cre/loxP系统去除抗性筛选标记第123-126页
       ·质粒pSH的构建第123-125页
       ·抗性标记的剔除第125-126页
   ·讨论第126-128页
     ·抗性标记辅助的全基因组重排技术第126-127页
     ·酵母乙醇耐受力机制第127页
     ·标记剔除系统的建立第127-128页
   ·本章小结第128-129页
第六章 全文总结及后续工作建议第129-133页
   ·全文总结第129-131页
   ·本文创新点第131-132页
   ·后续工作建议第132-133页
参考文献第133-141页
附录第141-142页
作者简介第142页

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